More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0888 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 225 aa  456  1e-127  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  57.92 
 
 		 215 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.33 
 
 		 218 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.95 
 
 		 220 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  45.87 
 
 		 218 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.38 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.75 
 
 		 219 aa  206  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.76 
 
 		 220 aa  205  5e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  47.34 
 
 		 209 aa  202  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.37 
 
 		 356 aa  201  5e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.88 
 
 		 356 aa  201  7e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.45 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.57 
 
 		 227 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  45 
 
 		 220 aa  198  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  44.04 
 
 		 218 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.93 
 
 		 356 aa  193  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.88 
 
 		 357 aa  192  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  57.14 
 
 		 356 aa  191  9e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  50.56 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  50.56 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  52.22 
 
 		 203 aa  187  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  49.71 
 
 		 218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.45 
 
 		 218 aa  181  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  42.86 
 
 		 210 aa  181  7e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.37 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  50.81 
 
 		 221 aa  179  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  46.11 
 
 		 204 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  42.31 
 
 		 207 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  42.51 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  41.71 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  37.37 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.39 
 
 		 204 aa  149  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  40.98 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.81 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  38.76 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  39.43 
 
 		 256 aa  145  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  38.76 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  37.67 
 
 		 213 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.34 
 
 		 220 aa  144  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  34.9 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  38.07 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  37.62 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  37.23 
 
 		 212 aa  142  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  38.76 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  33.98 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  37.13 
 
 		 212 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.13 
 
 		 219 aa  141  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  37.02 
 
 		 235 aa  141  8e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  37.29 
 
 		 211 aa  141  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  37.56 
 
 		 211 aa  141  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  35.86 
 
 		 212 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  35.03 
 
 		 251 aa  140  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  37.95 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  35.64 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  40.57 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  36.14 
 
 		 209 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  40.66 
 
 		 273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.71 
 
 		 216 aa  138  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.14 
 
 		 258 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  32.77 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  34.76 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.19 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  32.24 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  37.5 
 
 		 254 aa  136  2e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  37.62 
 
 		 335 aa  136  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  35.68 
 
 		 212 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  35.61 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  32.77 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  36.16 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  33.9 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  33.71 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  31.9 
 
 		 212 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  32.38 
 
 		 217 aa  135  4e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.14 
 
 		 212 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  36.16 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  34.17 
 
 		 239 aa  135  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  35.68 
 
 		 212 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.94 
 
 		 214 aa  135  7.000000000000001e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  36.78 
 
 		 217 aa  134  8e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  35.12 
 
 		 212 aa  134  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  35.05 
 
 		 223 aa  134  9e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  33.67 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0235  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.7 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.784957  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.2 
 
 		 214 aa  134  9e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  39.33 
 
 		 210 aa  134  9e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  35.68 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.6 
 
 		 178 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  35.43 
 
 		 268 aa  134  9.999999999999999e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  40.23 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.37 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  31.16 
 
 		 246 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  36.36 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  35.15 
 
 		 212 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.09 
 
 		 243 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  39.2 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  37.64 
 
 		 219 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  34.86 
 
 		 284 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.12 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  37.5 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  36.41 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>