More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_43577 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  100 
 
 
273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30250  Endonuclease III  39.39 
 
 
382 aa  187  2e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00854867  normal  0.477388 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03640  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  41.41 
 
 
452 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433978  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10978  DNA repair protein Ntg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01120)  34.83 
 
 
429 aa  166  4e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12645  predicted protein  38.89 
 
 
199 aa  158  9e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.44 
 
 
215 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.97 
 
 
219 aa  152  8e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.05 
 
 
219 aa  144  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  40.98 
 
 
218 aa  143  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  40.21 
 
 
209 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  37.16 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.39 
 
 
220 aa  140  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.66 
 
 
225 aa  139  6e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.89 
 
 
218 aa  139  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.53 
 
 
220 aa  138  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.14 
 
 
356 aa  135  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  40.22 
 
 
220 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.11 
 
 
356 aa  132  5e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.22 
 
 
218 aa  132  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.21 
 
 
220 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  36.26 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  35.45 
 
 
204 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  38.8 
 
 
218 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.52 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.65 
 
 
356 aa  126  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  38.46 
 
 
213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  38.46 
 
 
213 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.92 
 
 
357 aa  125  7e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  32.88 
 
 
221 aa  124  1e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  33.68 
 
 
210 aa  120  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  34.03 
 
 
210 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.57 
 
 
204 aa  120  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  34.52 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.26 
 
 
211 aa  116  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  32.99 
 
 
207 aa  115  5e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  31.31 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  32.6 
 
 
209 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.87 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  30.96 
 
 
219 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.96 
 
 
219 aa  110  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  35.08 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.2 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  32.67 
 
 
210 aa  107  2e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  32.81 
 
 
227 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  33.33 
 
 
217 aa  106  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  33.33 
 
 
286 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  32.24 
 
 
215 aa  104  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  31.75 
 
 
218 aa  104  2e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  34.36 
 
 
223 aa  103  4e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  31.28 
 
 
214 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.64 
 
 
214 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  31.28 
 
 
214 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  31.28 
 
 
214 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  34.57 
 
 
220 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  31.77 
 
 
227 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  34.44 
 
 
214 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  32.97 
 
 
220 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  32.97 
 
 
220 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  31.94 
 
 
227 aa  100  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.02 
 
 
214 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  33.33 
 
 
214 aa  99.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  30.73 
 
 
214 aa  99.8  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.33 
 
 
216 aa  99.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.07 
 
 
214 aa  99.4  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  34.22 
 
 
208 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1026  EndoIII-related endonuclease  31.07 
 
 
209 aa  99  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.744613  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  31.11 
 
 
213 aa  99  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  30.77 
 
 
215 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  30.77 
 
 
215 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  30.77 
 
 
215 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  30.77 
 
 
215 aa  99  8e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  30.53 
 
 
251 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  30.77 
 
 
215 aa  99  8e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  30.17 
 
 
214 aa  99  8e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  30.77 
 
 
215 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  31.63 
 
 
219 aa  98.6  9e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  31.02 
 
 
214 aa  98.6  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  32.2 
 
 
211 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  30.48 
 
 
214 aa  98.2  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  35.11 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  32.22 
 
 
213 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.84 
 
 
216 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  33.33 
 
 
216 aa  98.2  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  32.98 
 
 
220 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  30.43 
 
 
227 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.51 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  30.77 
 
 
215 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  31.61 
 
 
224 aa  97.8  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  30.73 
 
 
212 aa  97.8  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  31.16 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  29.35 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  31.41 
 
 
234 aa  97.4  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  29.61 
 
 
214 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  30.17 
 
 
214 aa  97.8  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  30.35 
 
 
285 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  30.35 
 
 
237 aa  97.1  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  29.61 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  29.61 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  29.61 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  29.61 
 
 
214 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>