More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4204 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 220 aa  458  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.2 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  39.53 
 
 		 218 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  44.26 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.63 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  40 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.09 
 
 		 220 aa  161  9e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.64 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.62 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  42.62 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.2 
 
 		 215 aa  156  3e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.62 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.34 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.29 
 
 		 357 aa  135  4e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  38.69 
 
 		 356 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.56 
 
 		 356 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.56 
 
 		 356 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  34.5 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.29 
 
 		 356 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  38.2 
 
 		 203 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  35.57 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  34.2 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  37.71 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  37.71 
 
 		 213 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.35 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.71 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.32 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  35.75 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  34.07 
 
 		 210 aa  114  7.999999999999999e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  34.55 
 
 		 208 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  34.64 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  35.43 
 
 		 221 aa  111  9e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  30.22 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  33.52 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  34.54 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.31 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  35.53 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  30.66 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  29.95 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  32.97 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  35.2 
 
 		 273 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  31.84 
 
 		 215 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  32.29 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  29.35 
 
 		 251 aa  108  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  30.49 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  32.61 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  31.87 
 
 		 257 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  31.18 
 
 		 284 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  30.65 
 
 		 246 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  33.52 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  32.8 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  35.91 
 
 		 209 aa  106  3e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  31.13 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  31.13 
 
 		 220 aa  105  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  33.91 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  32.02 
 
 		 222 aa  105  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  32.98 
 
 		 211 aa  105  8e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.97 
 
 		 214 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  30.1 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  30.11 
 
 		 276 aa  104  9e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  32.97 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  31.37 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  31.12 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  29.53 
 
 		 211 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  30.81 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  32.97 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  32.97 
 
 		 214 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  34.62 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  31.32 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  30.24 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  30.24 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  30.24 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  31.69 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  30.24 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  30.24 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0857  endonuclease III  31.09 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  30.15 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  32.42 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  30.24 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  31.63 
 
 		 214 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  30.14 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  32.97 
 
 		 211 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  34.08 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  32.22 
 
 		 281 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  33.52 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  32.42 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  30.1 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  32.42 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  31.87 
 
 		 214 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  33.52 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  33.52 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  30.15 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.87 
 
 		 211 aa  102  3e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  30.65 
 
 		 291 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.16 
 
 		 210 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  32.97 
 
 		 211 aa  102  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  32.96 
 
 		 212 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.96 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>