More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12645 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12645  predicted protein  100 
 
 		 199 aa  417  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10978  DNA repair protein Ntg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01120)  42.8 
 
 		 429 aa  203  1e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30250  Endonuclease III  45.54 
 
 		 382 aa  194  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00854867  normal  0.477388 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03640  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  43.75 
 
 		 452 aa  159  4e-38  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433978  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  38.89 
 
 		 273 aa  158  5e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.31 
 
 		 356 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.71 
 
 		 357 aa  106  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.12 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.39 
 
 		 356 aa  103  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  36.94 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.39 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.03 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.39 
 
 		 356 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  34.39 
 
 		 356 aa  101  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  33.12 
 
 		 207 aa  101  7e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  36.14 
 
 		 221 aa  99  5e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  35.44 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.39 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.2 
 
 		 220 aa  95.5  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  33.76 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  33.76 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  33.13 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  33.12 
 
 		 219 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.73 
 
 		 220 aa  93.2  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  32.28 
 
 		 218 aa  92.4  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  32.48 
 
 		 209 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.76 
 
 		 218 aa  91.7  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.54 
 
 		 227 aa  90.9  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.22 
 
 		 216 aa  90.1  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  34.25 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.65 
 
 		 218 aa  88.6  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_9118  predicted protein  26.22 
 
 		 186 aa  88.2  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  32.93 
 
 		 203 aa  87.8  9e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  31.72 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  29.3 
 
 		 267 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  30.57 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  35.22 
 
 		 210 aa  86.3  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  32.28 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  32.28 
 
 		 218 aa  86.3  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  31.01 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.87 
 
 		 214 aa  86.3  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.25 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  32.02 
 
 		 209 aa  85.5  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  31.21 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.85 
 
 		 220 aa  85.1  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  29.94 
 
 		 212 aa  84.7  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  31.46 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  28.41 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  32.48 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  32.87 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1026  EndoIII-related endonuclease  27.33 
 
 		 209 aa  82.8  0.000000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.744613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.66 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  33.33 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  29.7 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2571  endonuclease III  33.8 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  33.33 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  33.33 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  28.21 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  32.91 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  29.56 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  32.02 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  29.48 
 
 		 227 aa  81.3  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  28.3 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.64 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  30.11 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  32.64 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  27.67 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  27.85 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  32.64 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  30.38 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.38 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.11 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  28.57 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  32.64 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  30.23 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  31.94 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  32.05 
 
 		 335 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  28.4 
 
 		 244 aa  79  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  31.94 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  31.21 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.93 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  31.94 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  27.85 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  31.65 
 
 		 213 aa  77.8  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  29.75 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  31.94 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  28.34 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.19 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  32.68 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  29.49 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  28.97 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  27.71 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  30.5 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  31.94 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  30.5 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2824  endonuclease III  33.1 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  32.03 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  33.33 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  30.57 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  32.17 
 
 		 220 aa  76.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>