More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_9118 on replicon NC_009368
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009368  OSTLU_9118  predicted protein  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  38.54 
 
 
210 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  36.56 
 
 
235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  36.36 
 
 
223 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  33.33 
 
 
223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  38.38 
 
 
259 aa  112  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.76 
 
 
263 aa  112  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  37.1 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  39.25 
 
 
228 aa  110  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.22 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  36.56 
 
 
218 aa  109  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  37.37 
 
 
238 aa  109  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  36.22 
 
 
239 aa  108  6e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.14 
 
 
241 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  38.38 
 
 
257 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  34.43 
 
 
214 aa  106  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  32.6 
 
 
215 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  32.6 
 
 
215 aa  105  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  32.6 
 
 
215 aa  105  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  32.81 
 
 
224 aa  106  3e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  32.6 
 
 
215 aa  105  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  32.6 
 
 
215 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  32.6 
 
 
215 aa  105  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  33.33 
 
 
219 aa  105  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  35.14 
 
 
251 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  33.7 
 
 
212 aa  105  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  34.25 
 
 
215 aa  105  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  35.56 
 
 
219 aa  104  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  35.56 
 
 
219 aa  104  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  36.76 
 
 
241 aa  104  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  32.04 
 
 
215 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  35.29 
 
 
220 aa  103  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.76 
 
 
277 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  33.7 
 
 
209 aa  103  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  34.24 
 
 
216 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  33.16 
 
 
273 aa  102  3e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  34.62 
 
 
248 aa  102  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0761  endonuclease III  32.79 
 
 
220 aa  101  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.169913  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  36.07 
 
 
218 aa  101  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  35.68 
 
 
276 aa  101  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  33.88 
 
 
209 aa  101  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  34.92 
 
 
219 aa  101  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  33.33 
 
 
228 aa  100  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  33.51 
 
 
248 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  32.28 
 
 
220 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  32.04 
 
 
215 aa  100  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  31.69 
 
 
213 aa  100  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  33.52 
 
 
256 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  32.6 
 
 
215 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  34.41 
 
 
246 aa  100  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.33 
 
 
217 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  32.28 
 
 
220 aa  100  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.77 
 
 
220 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.97 
 
 
223 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  34.39 
 
 
208 aa  99.8  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  31.87 
 
 
210 aa  100  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  32.09 
 
 
197 aa  99.4  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  31.52 
 
 
219 aa  99.8  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  32.28 
 
 
228 aa  99.8  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  33.33 
 
 
209 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  34.95 
 
 
212 aa  99.8  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  34.59 
 
 
237 aa  99.4  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  34.59 
 
 
291 aa  99.4  3e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  34.59 
 
 
256 aa  98.6  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  35.68 
 
 
246 aa  98.6  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4289  putative endonuclease III  36.77 
 
 
178 aa  98.6  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  32.6 
 
 
215 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  32.07 
 
 
210 aa  97.8  8e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  34.95 
 
 
225 aa  97.8  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.05 
 
 
258 aa  97.4  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  32.79 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  31.69 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.05 
 
 
213 aa  96.7  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  35.68 
 
 
268 aa  96.3  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  32.64 
 
 
258 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  34.07 
 
 
245 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  35.11 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  34.97 
 
 
213 aa  95.9  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  35.48 
 
 
217 aa  95.9  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  34.41 
 
 
244 aa  96.3  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1373  endonuclease III  34.72 
 
 
260 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.822659  normal  0.0581262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  32.07 
 
 
215 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.51 
 
 
243 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.48 
 
 
218 aa  95.1  6e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  35.26 
 
 
227 aa  94.4  8e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  32.11 
 
 
230 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.25 
 
 
218 aa  94  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0960  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.15 
 
 
212 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  32.61 
 
 
211 aa  94  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0468  endonuclease III  31.46 
 
 
210 aa  93.2  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  33.87 
 
 
234 aa  93.2  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.05 
 
 
218 aa  92.8  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.33 
 
 
218 aa  93.2  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  32.24 
 
 
220 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  31.05 
 
 
221 aa  92.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  33.15 
 
 
207 aa  92.4  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  29.95 
 
 
215 aa  92  4e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  31.89 
 
 
222 aa  92.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.09 
 
 
278 aa  92  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  33.9 
 
 
216 aa  91.7  5e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>