More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30250 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_30250  Endonuclease III  100 
 
 		 382 aa  791    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00854867  normal  0.477388 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03640  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, putative  44.08 
 
 		 452 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.433978  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10978  DNA repair protein Ntg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01120)  39.79 
 
 		 429 aa  194  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.97635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12645  predicted protein  45.54 
 
 		 199 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  39.39 
 
 		 273 aa  187  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.04 
 
 		 225 aa  132  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.84 
 
 		 219 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.82 
 
 		 215 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0628  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.14 
 
 		 357 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1555  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.83 
 
 		 356 aa  116  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.272014 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.64 
 
 		 220 aa  115  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.71 
 
 		 219 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0356  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.29 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0334689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1071  hypothetical protein  34.76 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.661198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.81 
 
 		 227 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 		 218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  33.33 
 
 		 218 aa  108  2e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.7 
 
 		 218 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3237  endonuclease III  32.81 
 
 		 227 aa  107  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  33.7 
 
 		 204 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.81 
 
 		 220 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1973  HhH-GPD  35.26 
 
 		 218 aa  106  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.75329e-18  normal  0.0273848 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.62 
 
 		 218 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.98 
 
 		 211 aa  106  8e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  31.49 
 
 		 203 aa  104  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  31.75 
 
 		 207 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1450  endonuclease III, putative  32.34 
 
 		 209 aa  104  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  34.87 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  34.87 
 
 		 218 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  31.49 
 
 		 209 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  30.98 
 
 		 210 aa  103  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  31.49 
 
 		 209 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.31 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  34.87 
 
 		 209 aa  101  2e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3667  endonuclease III  30.61 
 
 		 219 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000300806  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  30.88 
 
 		 215 aa  100  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2309  HhH-GPD family protein  33.7 
 
 		 220 aa  100  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000091499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  31.25 
 
 		 227 aa  99.8  7e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1004  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.14 
 
 		 216 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.557567  normal  0.350835 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  28.5 
 
 		 215 aa  98.6  1e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.08 
 
 		 220 aa  99  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  34.07 
 
 		 224 aa  99  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.79 
 
 		 277 aa  99  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  30.22 
 
 		 221 aa  98.6  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.27 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  31.6 
 
 		 267 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  32.84 
 
 		 213 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  28.63 
 
 		 248 aa  98.2  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.41 
 
 		 218 aa  97.8  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  31.16 
 
 		 246 aa  97.8  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3103  endonuclease III  30.05 
 
 		 228 aa  97.4  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  31.32 
 
 		 220 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  31.32 
 
 		 220 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  30.05 
 
 		 220 aa  95.9  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.02 
 
 		 213 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  32.02 
 
 		 217 aa  95.9  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  32.06 
 
 		 211 aa  94.7  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  31.15 
 
 		 281 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  31.61 
 
 		 228 aa  95.1  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  31.37 
 
 		 223 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  33.86 
 
 		 227 aa  95.1  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.6 
 
 		 218 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1965  endonuclease III  31.16 
 
 		 212 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.522243  normal  0.0145073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32.42 
 
 		 217 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  33.52 
 
 		 230 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  33.01 
 
 		 211 aa  94  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  30.57 
 
 		 260 aa  93.6  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  30.48 
 
 		 256 aa  93.2  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  29.74 
 
 		 225 aa  92.4  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  30.77 
 
 		 222 aa  92  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  30.81 
 
 		 215 aa  92.4  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  31.61 
 
 		 219 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.61 
 
 		 219 aa  92.8  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  31.87 
 
 		 291 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  30.94 
 
 		 213 aa  92.4  1e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  30.94 
 
 		 213 aa  92.4  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0960  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.79 
 
 		 212 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  30.77 
 
 		 212 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  31.32 
 
 		 268 aa  92  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  30.57 
 
 		 260 aa  91.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  28.42 
 
 		 222 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  28.83 
 
 		 217 aa  90.9  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  29.12 
 
 		 210 aa  90.5  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  32.99 
 
 		 213 aa  90.5  5e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.44 
 
 		 214 aa  90.5  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  29.9 
 
 		 211 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  28.5 
 
 		 235 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  28.96 
 
 		 217 aa  89.7  8e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  28.21 
 
 		 218 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  30 
 
 		 214 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0954  endonuclease III  27.46 
 
 		 227 aa  89  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  30.57 
 
 		 211 aa  89.4  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  31.12 
 
 		 285 aa  89.4  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  31.18 
 
 		 224 aa  89.4  1e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  31.58 
 
 		 239 aa  88.2  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  28.73 
 
 		 217 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.57 
 
 		 263 aa  88.2  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1468  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.73 
 
 		 178 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  28.43 
 
 		 276 aa  87.4  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.12 
 
 		 241 aa  87  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>