More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1009 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  100 
 
 		 217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  78.7 
 
 		 217 aa  378  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  65.9 
 
 		 217 aa  319  1.9999999999999998e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  65.9 
 
 		 217 aa  318  3.9999999999999996e-86  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  67.74 
 
 		 217 aa  313  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  63.59 
 
 		 217 aa  298  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  59.26 
 
 		 217 aa  294  6e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  60.29 
 
 		 227 aa  285  2e-76  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  62.14 
 
 		 217 aa  285  4e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  61.65 
 
 		 217 aa  283  1.0000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  61.65 
 
 		 217 aa  282  3.0000000000000004e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  63.72 
 
 		 220 aa  281  6.000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  60.65 
 
 		 216 aa  278  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  59.22 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  61.34 
 
 		 218 aa  258  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  62.89 
 
 		 218 aa  258  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.79 
 
 		 209 aa  252  3e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  57.84 
 
 		 212 aa  244  9.999999999999999e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.72 
 
 		 231 aa  229  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  41.1 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  41.1 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  42.29 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  41.26 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  45.45 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  41.1 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  42.93 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  43.98 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  39.39 
 
 		 209 aa  168  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  43.94 
 
 		 237 aa  167  8e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  45.69 
 
 		 213 aa  167  9e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  43.92 
 
 		 276 aa  167  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  42.23 
 
 		 210 aa  167  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.11 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  43.46 
 
 		 220 aa  166  2.9999999999999998e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  45.63 
 
 		 210 aa  165  4e-40  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.72 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  47.15 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  43.15 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  41.55 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  39.72 
 
 		 223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  43.75 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  40.91 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  44.9 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  38.31 
 
 		 224 aa  162  3e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  43.43 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.6 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  40.65 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  40.4 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  42.03 
 
 		 238 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  43.43 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  38.58 
 
 		 227 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  42.31 
 
 		 268 aa  161  6e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  44.1 
 
 		 261 aa  161  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  43.35 
 
 		 230 aa  161  6e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  43.65 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  42.86 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  42.86 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  41.24 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  42.78 
 
 		 197 aa  160  2e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  44.68 
 
 		 258 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.5 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  45.31 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3737  endonuclease III  42.72 
 
 		 226 aa  159  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.5 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  41.21 
 
 		 228 aa  159  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  42.16 
 
 		 219 aa  159  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  41.29 
 
 		 211 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  42.36 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  40.98 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  43.22 
 
 		 208 aa  158  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.4 
 
 		 258 aa  158  6e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  46.03 
 
 		 213 aa  157  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  44.21 
 
 		 214 aa  157  9e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  40.72 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  41.18 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  43.81 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  41.12 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  41.12 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  41.12 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  41.12 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  41.87 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  41.12 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  44.06 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  41.12 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  41.12 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  41.5 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.71 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  38.54 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  39.11 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  43.56 
 
 		 248 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  42.51 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  40.2 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  45.21 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  45.83 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  43.46 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.54 
 
 		 237 aa  155  4e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  42.31 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  44.09 
 
 		 252 aa  155  6e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  50.26 
 
 		 240 aa  155  6e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  47.62 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>