More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0810 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  93.69 
 
 		 217 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  93.69 
 
 		 217 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  80.65 
 
 		 217 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  70.83 
 
 		 217 aa  323  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  71.3 
 
 		 217 aa  322  3e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  65.28 
 
 		 217 aa  298  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  61.11 
 
 		 217 aa  292  3e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  65.07 
 
 		 217 aa  290  1e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  58.06 
 
 		 217 aa  289  3e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  57.87 
 
 		 216 aa  280  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  60.77 
 
 		 227 aa  273  2.0000000000000002e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  59.31 
 
 		 218 aa  253  2.0000000000000002e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  55.5 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.82 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.98 
 
 		 209 aa  243  9.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  57.28 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  54.9 
 
 		 212 aa  240  1e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.74 
 
 		 231 aa  219  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  46.53 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  46.53 
 
 		 212 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  44.78 
 
 		 212 aa  171  9e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  45.96 
 
 		 214 aa  171  9e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  46.53 
 
 		 335 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.53 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  45.89 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  44.55 
 
 		 212 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  44.72 
 
 		 252 aa  166  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  45.18 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  43.56 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  44.55 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  42.57 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  45.9 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.05 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  43.56 
 
 		 212 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  41.92 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  42.35 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.35 
 
 		 219 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  47.95 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  44.44 
 
 		 213 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  42.93 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  43.98 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  45.1 
 
 		 254 aa  159  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  42.93 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  43.65 
 
 		 211 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  43.07 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  159  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  41.92 
 
 		 226 aa  158  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  43.98 
 
 		 212 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  42.86 
 
 		 260 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  43.56 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.96 
 
 		 247 aa  158  7e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  43.92 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  42.2 
 
 		 222 aa  157  8e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  41.88 
 
 		 211 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  43.37 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  41.62 
 
 		 212 aa  157  1e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  42.51 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  39.49 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.5 
 
 		 210 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  40.7 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  42.64 
 
 		 260 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  40.4 
 
 		 225 aa  155  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  43.46 
 
 		 213 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  45.55 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  44.26 
 
 		 258 aa  155  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  43.23 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.65 
 
 		 219 aa  155  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  39.9 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.21 
 
 		 237 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  41 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  41.92 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  40.7 
 
 		 215 aa  154  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  40 
 
 		 236 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  41.79 
 
 		 209 aa  154  8e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  40.98 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  40.41 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  40.41 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  40.41 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  40.41 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  43.07 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  40.41 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  40.41 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.36 
 
 		 274 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  43 
 
 		 211 aa  154  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  39.7 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  42.23 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  40.41 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  42.29 
 
 		 209 aa  153  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  39.7 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  40.82 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  40.91 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  41.36 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  40.91 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  43.72 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  41.36 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  41.36 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  40.91 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  40.91 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  42.93 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>