More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2534 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  62.44 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  61.95 
 
 		 260 aa  272  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.68 
 
 		 268 aa  268  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  61.27 
 
 		 249 aa  266  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  60.41 
 
 		 260 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  59.9 
 
 		 260 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  60.5 
 
 		 236 aa  262  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  58.91 
 
 		 254 aa  260  8.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  58.79 
 
 		 261 aa  257  8e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  60.8 
 
 		 274 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  57.64 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  59.3 
 
 		 256 aa  251  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.61 
 
 		 218 aa  250  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  57.5 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  58.62 
 
 		 214 aa  248  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  57.5 
 
 		 254 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  55.22 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  56.86 
 
 		 252 aa  248  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.13 
 
 		 210 aa  246  2e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  56.78 
 
 		 252 aa  245  4e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  53.2 
 
 		 211 aa  244  6e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  58.59 
 
 		 237 aa  242  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  52.71 
 
 		 211 aa  242  3e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  55.17 
 
 		 218 aa  241  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  55.17 
 
 		 218 aa  241  3.9999999999999997e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  54.27 
 
 		 236 aa  240  9e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  54.68 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  54.19 
 
 		 212 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2607  endonuclease III  55.56 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  56.12 
 
 		 212 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  53.69 
 
 		 212 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  53.43 
 
 		 219 aa  237  9e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  53.66 
 
 		 335 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  53.69 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  56.86 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  56.28 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  54.77 
 
 		 262 aa  235  3e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  55.17 
 
 		 214 aa  235  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  55.17 
 
 		 214 aa  235  4e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  55.61 
 
 		 212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  55.1 
 
 		 215 aa  234  6e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  56.12 
 
 		 212 aa  234  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  56.28 
 
 		 214 aa  234  8e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  55.1 
 
 		 212 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0871  endonuclease III  55.17 
 
 		 214 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.348794 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  52.71 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  54.68 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.68 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  54.68 
 
 		 214 aa  232  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  52.71 
 
 		 212 aa  231  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  55.28 
 
 		 240 aa  231  5e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  54.68 
 
 		 214 aa  231  6e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  51.72 
 
 		 212 aa  231  7.000000000000001e-60  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  52.45 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  54.9 
 
 		 214 aa  231  7.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  53.69 
 
 		 215 aa  230  9e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  51.23 
 
 		 212 aa  231  9e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  53.69 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0235  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.2 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.784957  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  53.69 
 
 		 222 aa  230  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1632  endonuclease III  55.39 
 
 		 359 aa  229  2e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.43019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  51.72 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  54.08 
 
 		 212 aa  229  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  53.96 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  51.71 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  55.17 
 
 		 214 aa  228  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  54.68 
 
 		 214 aa  229  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  54.68 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  54.68 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  54.68 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  54.68 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  54.68 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  54.68 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  54.68 
 
 		 214 aa  228  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  53.69 
 
 		 270 aa  228  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.68 
 
 		 214 aa  228  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  53.69 
 
 		 214 aa  227  9e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  54.46 
 
 		 219 aa  227  9e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  53.69 
 
 		 214 aa  227  9e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  54.19 
 
 		 214 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  53.69 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  53.62 
 
 		 213 aa  226  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0857  endonuclease III  50.74 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.2 
 
 		 212 aa  226  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  52.22 
 
 		 210 aa  227  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.54 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  50.24 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  52.94 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2517  endonuclease III  52.71 
 
 		 216 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  52.71 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4249  endonuclease III  53.2 
 
 		 249 aa  226  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.884041  normal  0.624306 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  52.2 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2655  endonuclease III  51.23 
 
 		 212 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3170  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.22 
 
 		 216 aa  225  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  54.19 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  54.19 
 
 		 214 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  52.22 
 
 		 217 aa  225  4e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  54.59 
 
 		 233 aa  224  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  52.71 
 
 		 211 aa  224  6e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>