More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_09581 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  100 
 
 		 217 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  65.44 
 
 		 217 aa  300  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  63.43 
 
 		 217 aa  299  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  64.06 
 
 		 217 aa  298  3e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  63.59 
 
 		 217 aa  298  5e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  66.02 
 
 		 217 aa  289  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  65.53 
 
 		 217 aa  288  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  65.53 
 
 		 217 aa  286  1e-76  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  57.41 
 
 		 217 aa  279  2e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  60.83 
 
 		 217 aa  277  8e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  55.09 
 
 		 216 aa  267  1e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  53.37 
 
 		 227 aa  244  9.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  50.7 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  49.51 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  53.09 
 
 		 218 aa  213  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.61 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  53.65 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.13 
 
 		 231 aa  208  4e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  48.08 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.67 
 
 		 219 aa  157  8e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  40.91 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  40.85 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.79 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  41.71 
 
 		 261 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  156  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  38.68 
 
 		 213 aa  155  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  42 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  40.57 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  42.93 
 
 		 211 aa  155  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  40.59 
 
 		 260 aa  154  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  40.59 
 
 		 249 aa  154  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  40.59 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  40.49 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  41 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  42.31 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.31 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  42.41 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  41.36 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  40.8 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  39.9 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  41.5 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  40.49 
 
 		 211 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  41.18 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  40.5 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  38.68 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2178  endonuclease III  38.97 
 
 		 213 aa  152  5e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.468625  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  40.5 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.8 
 
 		 210 aa  151  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  40.51 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.36 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  40.1 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.88 
 
 		 214 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  42.16 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  39.51 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  41.36 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  38.21 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  40.8 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  41.45 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  41.36 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1869  endonuclease III  41.36 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40 
 
 		 212 aa  149  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  40.84 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  43.27 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  39.79 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  40.84 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  40.31 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.36 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  39.51 
 
 		 287 aa  149  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  40.84 
 
 		 214 aa  149  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  39.79 
 
 		 211 aa  149  4e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  40.84 
 
 		 215 aa  148  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  37.86 
 
 		 207 aa  148  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  41.36 
 
 		 335 aa  148  7e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  40.82 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  37.85 
 
 		 213 aa  147  8e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  40.31 
 
 		 212 aa  147  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.33 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  39.51 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  37.56 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  37.56 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.84 
 
 		 211 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  37.56 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  37.09 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  36.79 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  37.74 
 
 		 236 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  38.68 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1014  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.31 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0604012  normal  0.969692 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  39.79 
 
 		 211 aa  145  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  40.11 
 
 		 254 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  37.38 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  38.03 
 
 		 212 aa  145  3e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>