More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1412 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  60.83 
 
 		 220 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  61.19 
 
 		 217 aa  238  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  53.73 
 
 		 217 aa  232  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  53.23 
 
 		 217 aa  233  3e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  55.72 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  54.73 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  52.74 
 
 		 217 aa  221  9e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  53.23 
 
 		 237 aa  221  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  50.75 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  52.74 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  53.5 
 
 		 227 aa  219  3.9999999999999997e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  52.24 
 
 		 217 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  52.13 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  53.44 
 
 		 218 aa  206  4e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  58.2 
 
 		 212 aa  204  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  54.3 
 
 		 218 aa  203  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  51.31 
 
 		 209 aa  201  9e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  52.76 
 
 		 216 aa  198  5e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  44.83 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  44.39 
 
 		 235 aa  159  3e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  41.18 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  39.09 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  39.59 
 
 		 209 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  48.39 
 
 		 233 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  48.69 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  47.85 
 
 		 270 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.04 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.42 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.8 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  43.32 
 
 		 210 aa  148  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  41.82 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  47.31 
 
 		 233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  42.92 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  40.2 
 
 		 216 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.94 
 
 		 229 aa  145  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  38.73 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  42.86 
 
 		 210 aa  145  8.000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.65 
 
 		 214 aa  144  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  38.64 
 
 		 238 aa  144  9e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  36.11 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  46.28 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.1 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.41 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  38.95 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  40.38 
 
 		 251 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  45.05 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  38.95 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  40.51 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  45.88 
 
 		 214 aa  142  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  42.08 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  45.16 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  42.02 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  44.04 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  44.15 
 
 		 260 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0439  endonuclease III  45.9 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.45571  normal  0.92859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  42.35 
 
 		 261 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  36.44 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.29 
 
 		 210 aa  141  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  42.18 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  42.57 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  42.05 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  41.49 
 
 		 234 aa  141  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  39.44 
 
 		 277 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  41.2 
 
 		 249 aa  140  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  47.22 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  41.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  41.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  41.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.06 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  41.18 
 
 		 213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.81 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  43.62 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  41.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  47.26 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0960  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.45 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  41.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  42.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  41.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  42.29 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  42.08 
 
 		 212 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  36.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  42.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  41.79 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  38.57 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  40.69 
 
 		 208 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  39.47 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  41.79 
 
 		 230 aa  139  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  43.3 
 
 		 211 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  41.38 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  42.41 
 
 		 246 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  38.95 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  39.47 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  38.95 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  38.95 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  38.95 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  38.95 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  38.95 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  46.52 
 
 		 214 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>