More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0549 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  100 
 
 		 212 aa  432  1e-120  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  62.12 
 
 		 227 aa  265  2.9999999999999995e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.41 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  59.8 
 
 		 216 aa  250  1e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  56.93 
 
 		 218 aa  247  1e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  56.37 
 
 		 217 aa  246  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  57.84 
 
 		 217 aa  244  9e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  54.9 
 
 		 217 aa  240  1e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  57.22 
 
 		 237 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  54.9 
 
 		 217 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  53.43 
 
 		 217 aa  234  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  58.71 
 
 		 220 aa  233  1.0000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  55.39 
 
 		 217 aa  233  2.0000000000000002e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  53.43 
 
 		 217 aa  231  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  52.45 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  54.9 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  50.72 
 
 		 209 aa  225  5.0000000000000005e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  49.51 
 
 		 217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  58.2 
 
 		 231 aa  202  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  44.55 
 
 		 213 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0597  endonuclease III  48.19 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.326491 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  48.13 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  48.4 
 
 		 270 aa  155  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  45.55 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  44.02 
 
 		 214 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  46.91 
 
 		 214 aa  154  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  44 
 
 		 213 aa  154  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  47.59 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  44.02 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  44.02 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  44.02 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  44.02 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  43.06 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  44.02 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  44.02 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  44.02 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  46.55 
 
 		 210 aa  153  2e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.06 
 
 		 237 aa  152  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  45.03 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  45.03 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  44 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.5 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  43.06 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.769441 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  43.81 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  43.53 
 
 		 197 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  43.06 
 
 		 214 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  48.86 
 
 		 214 aa  151  8e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  41.92 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.03 
 
 		 214 aa  150  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  43.94 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  46.02 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.02 
 
 		 219 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0915  endonuclease III  37.24 
 
 		 208 aa  150  2e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.603627  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  43.5 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  45 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  41.58 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  40.39 
 
 		 212 aa  149  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  42.5 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  42.5 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  43.5 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  42.5 
 
 		 213 aa  149  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  41.21 
 
 		 236 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  39.9 
 
 		 218 aa  148  5e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  39.3 
 
 		 211 aa  148  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0561  endonuclease III  46.63 
 
 		 233 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.1956 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  43.98 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  48.84 
 
 		 287 aa  148  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0115  endonuclease III  38.61 
 
 		 211 aa  148  7e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0500  endonuclease III  39.58 
 
 		 215 aa  147  9e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  50.61 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  41.71 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.5 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  44.16 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.86 
 
 		 247 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  43.28 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  43 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  43.81 
 
 		 214 aa  147  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  40.53 
 
 		 215 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  42 
 
 		 211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  39.8 
 
 		 208 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  46.23 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  44.5 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  46.81 
 
 		 248 aa  145  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3311  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.98 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  43.24 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1341  endonuclease III  36.23 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  42.5 
 
 		 211 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1074  endonuclease III  38.27 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.497275  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1235  endonuclease III  43.98 
 
 		 214 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.649386 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  37.57 
 
 		 209 aa  145  5e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0698  endonuclease III  38.27 
 
 		 208 aa  145  5e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  44.16 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  41.94 
 
 		 286 aa  145  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1669  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.33 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0936  endonuclease III  43.54 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0591838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  42 
 
 		 211 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  42.5 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2873  endonuclease III  46.67 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0623  endonuclease III  38.27 
 
 		 208 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.668418  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  42.64 
 
 		 212 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>