More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0915 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0915  endonuclease III  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.603627  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0698  endonuclease III  82.61 
 
 		 208 aa  359  2e-98  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0623  endonuclease III  83.09 
 
 		 208 aa  359  2e-98  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.668418  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1074  endonuclease III  82.13 
 
 		 208 aa  357  5e-98  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.497275  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  76.73 
 
 		 212 aa  321  5e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0115  endonuclease III  72.5 
 
 		 211 aa  302  2.0000000000000002e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0512  endonuclease III  71.5 
 
 		 210 aa  294  5e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1341  endonuclease III  70.41 
 
 		 213 aa  278  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  63.82 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  50 
 
 		 215 aa  193  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  50.25 
 
 		 215 aa  187  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  46.5 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  43.88 
 
 		 209 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  44.67 
 
 		 224 aa  181  5.0000000000000004e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.44 
 
 		 218 aa  178  4e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  43.28 
 
 		 225 aa  175  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  44.55 
 
 		 214 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0620  hypothetical protein  47.59 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.41 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  41.78 
 
 		 222 aa  167  8e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  44.66 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  43.2 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  44.15 
 
 		 267 aa  166  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.89 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  39.5 
 
 		 222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  41.97 
 
 		 237 aa  165  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  40 
 
 		 220 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  41.05 
 
 		 217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  42.72 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  41.35 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.42 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  41.03 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  39.9 
 
 		 235 aa  161  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  39.8 
 
 		 285 aa  161  7e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  40.98 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  39.8 
 
 		 260 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.98 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  40.38 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  41.12 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  40 
 
 		 236 aa  159  3e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  39.8 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.86 
 
 		 263 aa  157  8e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  38.31 
 
 		 236 aa  157  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.44 
 
 		 241 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  40.1 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  35.82 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  37.5 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  43.08 
 
 		 223 aa  156  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  42.78 
 
 		 234 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3289  endonuclease III  42.86 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133312 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  40.74 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  42.25 
 
 		 236 aa  155  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  39.57 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  42.64 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  39.04 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.28 
 
 		 218 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  39.69 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  38.12 
 
 		 212 aa  155  6e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  38.76 
 
 		 223 aa  154  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3742  endonuclease III  42.05 
 
 		 215 aa  154  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.941778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  40.58 
 
 		 219 aa  154  9e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  42.05 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  42.05 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  42.05 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  42.05 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  42.05 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  40 
 
 		 281 aa  154  9e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.61 
 
 		 278 aa  154  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  42.05 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  41.54 
 
 		 215 aa  153  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  40.58 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  42.27 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  39.49 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  37.56 
 
 		 208 aa  153  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  39.47 
 
 		 219 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.47 
 
 		 219 aa  153  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  41.38 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.78 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  42.02 
 
 		 227 aa  153  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.96 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  41.54 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  39.8 
 
 		 254 aa  152  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  41.49 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  39.13 
 
 		 207 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  42.25 
 
 		 225 aa  151  8e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  42.49 
 
 		 210 aa  151  8e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  39.11 
 
 		 284 aa  150  8.999999999999999e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  38.07 
 
 		 246 aa  150  8.999999999999999e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  41.03 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  40.1 
 
 		 239 aa  150  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  39.5 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  39.5 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  37.25 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  38.05 
 
 		 211 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  36.63 
 
 		 230 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  40.1 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1195  putative EndoIII-related endonuclease  42.25 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.643643  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  37.24 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  38.92 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26220  endonuclease III  38.46 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.420808  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>