More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_26220 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_26220  endonuclease III  100 
 
 		 230 aa  447  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.420808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  52.88 
 
 		 217 aa  202  3e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0519  endonuclease III  50.74 
 
 		 276 aa  191  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0437  endonuclease III  50.95 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.186096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3376  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  50.24 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.996166  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1071  endonuclease III  52.97 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  50.95 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8862  endonuclease III  44.29 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  49.26 
 
 		 234 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  52.97 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.79 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3093  endonuclease III  53.59 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000150861 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  47.52 
 
 		 276 aa  182  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  46.63 
 
 		 212 aa  182  4.0000000000000006e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  48.33 
 
 		 233 aa  181  6e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3166  endonuclease III  47.14 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0244001 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  49.01 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5316  endonuclease III  48.51 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  47.32 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25390  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  49.75 
 
 		 244 aa  179  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4759  endonuclease III  47.52 
 
 		 270 aa  178  4.999999999999999e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.033358  hitchhiker  0.00175385 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0340  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.09 
 
 		 243 aa  177  8e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0469  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.24 
 
 		 241 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.751701 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  43.72 
 
 		 210 aa  176  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  48.51 
 
 		 234 aa  175  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0255  endonuclease III  50.99 
 
 		 257 aa  176  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  49.01 
 
 		 239 aa  175  5e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3037  endonuclease III  51.49 
 
 		 259 aa  173  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  47.96 
 
 		 224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1993  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  48.31 
 
 		 263 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  41.55 
 
 		 225 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  45.93 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0326  endonuclease III  50.25 
 
 		 241 aa  172  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.425287  normal  0.0561637 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  42.41 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  42 
 
 		 225 aa  171  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.39 
 
 		 214 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  47.17 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  37.2 
 
 		 209 aa  169  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  41.46 
 
 		 215 aa  169  4e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  42.03 
 
 		 218 aa  168  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  41.46 
 
 		 211 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1638  endonuclease III  45.5 
 
 		 228 aa  166  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.104677  normal  0.333144 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.55 
 
 		 218 aa  167  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.6 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  45.41 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  46.19 
 
 		 256 aa  165  5e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0507  endonuclease III  45.93 
 
 		 248 aa  165  5e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.417277  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  43 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  43 
 
 		 220 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  44.85 
 
 		 220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13705  endonuclease III nth  46.31 
 
 		 245 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.034727 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2164  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.67 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  46.7 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0623  endonuclease III  41.27 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.668418  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  43.84 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  40.64 
 
 		 223 aa  162  4.0000000000000004e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2021  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.67 
 
 		 229 aa  161  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  45.45 
 
 		 214 aa  161  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  40.71 
 
 		 221 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3930  endonuclease III  44.02 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1731  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.15 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.5 
 
 		 278 aa  160  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  44.78 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  48.66 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0150  endonuclease III  38.1 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0720  endonuclease III  43.54 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.98 
 
 		 214 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  38.97 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.44 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  44.78 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  42.66 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.12 
 
 		 237 aa  159  4e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  45.63 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  44.08 
 
 		 228 aa  159  4e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0115  endonuclease III  38.76 
 
 		 211 aa  158  6e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3269  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.79 
 
 		 217 aa  158  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.398571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5203  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.33 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000830378 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0569  endonuclease III  38.03 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0915424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  41.44 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1074  endonuclease III  40.21 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.497275  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5433  endonuclease III  44.02 
 
 		 258 aa  157  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.828323  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  43.13 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  44.33 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0698  endonuclease III  40.21 
 
 		 208 aa  157  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  43.19 
 
 		 222 aa  157  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0144  endonuclease III  38.79 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.08 
 
 		 219 aa  157  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  42.71 
 
 		 228 aa  155  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4816  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.86 
 
 		 259 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.308298  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4902  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.86 
 
 		 259 aa  155  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.184225 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  39.68 
 
 		 212 aa  155  4e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  40.19 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.19 
 
 		 219 aa  155  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  42 
 
 		 207 aa  155  4e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  43.07 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2682  endonuclease III  44.71 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  45.26 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2306  endonuclease III  44.71 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  42.71 
 
 		 228 aa  155  6e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  43.58 
 
 		 233 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>