More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0623 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0623  endonuclease III  100 
 
 
208 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.668418  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0698  endonuclease III  98.56 
 
 
208 aa  421  1e-117  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1074  endonuclease III  98.08 
 
 
208 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.497275  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0915  endonuclease III  83.09 
 
 
208 aa  359  2e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.603627  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  78.82 
 
 
212 aa  332  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0512  endonuclease III  75 
 
 
210 aa  304  7e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0115  endonuclease III  72 
 
 
211 aa  299  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1341  endonuclease III  69.9 
 
 
213 aa  276  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  63.82 
 
 
228 aa  265  4e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  50.25 
 
 
215 aa  199  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  47.29 
 
 
220 aa  187  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  44.67 
 
 
208 aa  185  4e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  45 
 
 
209 aa  179  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  42.58 
 
 
224 aa  175  4e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.96 
 
 
219 aa  175  4e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  43.63 
 
 
236 aa  174  7e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  42.56 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  41.5 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  43.78 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.18 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  47.29 
 
 
215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.18 
 
 
216 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  42.29 
 
 
285 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  45.7 
 
 
267 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  42.36 
 
 
235 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  42.05 
 
 
211 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  40 
 
 
217 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0620  hypothetical protein  46.74 
 
 
217 aa  167  9e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  41.55 
 
 
211 aa  166  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  41.18 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  39.3 
 
 
212 aa  165  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  44.74 
 
 
236 aa  165  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  41.09 
 
 
212 aa  164  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  40.58 
 
 
211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  44.55 
 
 
214 aa  162  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  42.79 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  42.79 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  41.76 
 
 
216 aa  161  8.000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  42.72 
 
 
218 aa  160  1e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  40.58 
 
 
236 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  44.44 
 
 
225 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  41.04 
 
 
222 aa  159  3e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  45.9 
 
 
233 aa  158  6e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.71 
 
 
237 aa  157  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26220  endonuclease III  40.62 
 
 
230 aa  156  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.420808  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  38 
 
 
212 aa  156  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  41.53 
 
 
234 aa  155  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.71 
 
 
278 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.45 
 
 
211 aa  155  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.62 
 
 
231 aa  155  4e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.41 
 
 
214 aa  155  4e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  40.74 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  41.18 
 
 
228 aa  155  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  41.27 
 
 
248 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  41.26 
 
 
219 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  40.2 
 
 
248 aa  154  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  36.97 
 
 
212 aa  154  7e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  41.18 
 
 
213 aa  154  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  39.8 
 
 
260 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  42.35 
 
 
227 aa  154  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  38.81 
 
 
210 aa  154  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.58 
 
 
212 aa  154  8e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  40.29 
 
 
214 aa  154  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  40.2 
 
 
260 aa  154  9e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  41 
 
 
209 aa  154  9e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  40 
 
 
213 aa  154  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  37.25 
 
 
236 aa  154  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40 
 
 
211 aa  153  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  42.23 
 
 
220 aa  154  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  40.69 
 
 
228 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  40.98 
 
 
221 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.95 
 
 
258 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  41.35 
 
 
231 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  39.11 
 
 
219 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.11 
 
 
219 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3680  endonuclease III  38.12 
 
 
230 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  42.21 
 
 
224 aa  153  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  44.32 
 
 
225 aa  152  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.69 
 
 
268 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  41 
 
 
209 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43 
 
 
218 aa  153  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  39.3 
 
 
260 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1491  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.81 
 
 
226 aa  152  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000021977  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0857  endonuclease III  39.9 
 
 
210 aa  152  4e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2072  endonuclease III  40 
 
 
213 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3749  endonuclease III  37.62 
 
 
230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.2 
 
 
212 aa  151  7e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  39.22 
 
 
213 aa  151  8e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  40 
 
 
213 aa  150  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  42.54 
 
 
197 aa  150  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  39.71 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  39.71 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  41.8 
 
 
211 aa  150  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  39.71 
 
 
211 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  39.71 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  42.33 
 
 
212 aa  150  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  39.71 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0246  endonuclease III  42.5 
 
 
216 aa  150  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00760265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  39.71 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  39.71 
 
 
211 aa  150  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>