More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1074 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0698  endonuclease III  99.52 
 
 		 208 aa  427  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1074  endonuclease III  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.497275  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0623  endonuclease III  98.08 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.668418  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0915  endonuclease III  82.13 
 
 		 208 aa  357  5e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.603627  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1222  endonuclease III  78.33 
 
 		 212 aa  332  2e-90  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0512  endonuclease III  74 
 
 		 210 aa  301  6.000000000000001e-81  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0115  endonuclease III  71.5 
 
 		 211 aa  299  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1341  endonuclease III  70.41 
 
 		 213 aa  281  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0516  endonuclease III/Nth  63.32 
 
 		 228 aa  264  8e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  49.26 
 
 		 215 aa  194  5.000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  46.8 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  43.65 
 
 		 208 aa  180  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  45 
 
 		 209 aa  179  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.96 
 
 		 219 aa  177  8e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  43.78 
 
 		 225 aa  175  4e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  42.11 
 
 		 224 aa  174  7e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  43.63 
 
 		 236 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  42.56 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3695  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.18 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0580  endonuclease III  41.5 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.814346  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1159  endonuclease III  46.43 
 
 		 215 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1999  endonuclease III  42.29 
 
 		 285 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.71433  normal  0.505258 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  42.36 
 
 		 235 aa  171  9e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.71 
 
 		 216 aa  170  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  45.16 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0620  hypothetical protein  46.2 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  41.06 
 
 		 211 aa  166  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  40.58 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  44.55 
 
 		 214 aa  165  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  39.8 
 
 		 217 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  41.09 
 
 		 212 aa  165  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  44.74 
 
 		 236 aa  164  6.9999999999999995e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  41.03 
 
 		 211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  38.31 
 
 		 212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  40.69 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1886  endonuclease III  42.79 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0305  endonuclease III  42.79 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  40.57 
 
 		 222 aa  158  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  40.1 
 
 		 236 aa  158  5e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  42.72 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  38 
 
 		 212 aa  158  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  45.9 
 
 		 233 aa  157  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  43.92 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0006  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.27 
 
 		 231 aa  157  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.179819  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  40.64 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0198  endonuclease III  41.27 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  41.18 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1887  endonuclease III  38.81 
 
 		 210 aa  155  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.299157  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  40.39 
 
 		 213 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0880  endonuclease III  41.35 
 
 		 231 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000630803  hitchhiker  0.000000662064 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  41.45 
 
 		 211 aa  155  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  40.2 
 
 		 248 aa  154  6e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0819  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.48 
 
 		 218 aa  154  7e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  40.2 
 
 		 260 aa  154  7e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.33 
 
 		 211 aa  154  7e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  39.11 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  39.11 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2747  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.58 
 
 		 212 aa  154  9e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.81262  normal  0.488762 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  41.26 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1665  endonuclease III  40.69 
 
 		 228 aa  154  1e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.628404  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  40.29 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.19 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  42.33 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1954  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.64 
 
 		 278 aa  152  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  36.49 
 
 		 212 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.86 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  40.5 
 
 		 209 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  37.25 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1610  endonuclease III  40.2 
 
 		 228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2038  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.2 
 
 		 212 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  42.21 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  39.22 
 
 		 213 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2562  endonuclease III  42.33 
 
 		 212 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.560783  normal  0.0252184 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  40.5 
 
 		 209 aa  152  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0829  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.78 
 
 		 231 aa  152  5e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  39.3 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  41.63 
 
 		 220 aa  151  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  41.8 
 
 		 211 aa  151  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  38.83 
 
 		 262 aa  152  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  39.71 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  39.71 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  39.71 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  41.29 
 
 		 213 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0857  endonuclease III  39.9 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  39.71 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  39.71 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  39.3 
 
 		 260 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  39.71 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  39.71 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  39.71 
 
 		 211 aa  151  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0176  endonuclease III  39.71 
 
 		 249 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.809108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  39.51 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  41.8 
 
 		 211 aa  151  7e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  42.11 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  41.99 
 
 		 197 aa  151  8e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3567  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  40.2 
 
 		 268 aa  151  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26220  endonuclease III  40.21 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.420808  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0246  endonuclease III  41.87 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00760265  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  42.63 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  41.33 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>