More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1489 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  78.7 
 
 		 217 aa  378  1e-104  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  68.87 
 
 		 217 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  62.04 
 
 		 217 aa  314  8e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  62.5 
 
 		 217 aa  313  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  59.45 
 
 		 217 aa  300  1e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  64.93 
 
 		 227 aa  298  3e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  59.71 
 
 		 217 aa  281  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  59.71 
 
 		 217 aa  281  6.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  64.59 
 
 		 220 aa  279  2e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  57.41 
 
 		 217 aa  279  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  58.74 
 
 		 217 aa  277  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  61.11 
 
 		 216 aa  276  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  59.79 
 
 		 209 aa  255  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  56.73 
 
 		 237 aa  254  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.42 
 
 		 218 aa  251  5.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  57.73 
 
 		 218 aa  251  8.000000000000001e-66  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  61.19 
 
 		 231 aa  237  8e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  55.39 
 
 		 212 aa  233  2.0000000000000002e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1511  endonuclease III  43.68 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1540  endonuclease III  43.68 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  44.66 
 
 		 210 aa  173  1.9999999999999998e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  41.94 
 
 		 218 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  41.59 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1022  endonuclease III  43.23 
 
 		 219 aa  171  5e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0470  endonuclease III  45.96 
 
 		 235 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  43.98 
 
 		 220 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  41.59 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  44.28 
 
 		 211 aa  169  4e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  42.79 
 
 		 207 aa  169  4e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  44.33 
 
 		 220 aa  168  5e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1629  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.204448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  42.03 
 
 		 215 aa  167  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1493  endonuclease III  38.27 
 
 		 209 aa  167  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.319133  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.5 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  41.29 
 
 		 212 aa  167  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  40.61 
 
 		 227 aa  167  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0091  endonuclease III  44.95 
 
 		 237 aa  166  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  39.8 
 
 		 209 aa  165  5e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0197  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  40.3 
 
 		 213 aa  165  5e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000114708  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4319  endonuclease III  44.94 
 
 		 276 aa  165  5e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.145875 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0761  endonuclease III  43.85 
 
 		 197 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  45.03 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  46.6 
 
 		 212 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  39.29 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  46.03 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  46.07 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0613  endonuclease III  40.69 
 
 		 286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.65 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  42.72 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  46.52 
 
 		 217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.41 
 
 		 210 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  40.1 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  40.1 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  40.1 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  40.1 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  44.28 
 
 		 258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0248  endonuclease III  47.18 
 
 		 233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  42.86 
 
 		 256 aa  162  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.755364 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  40.1 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  40.1 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  46.03 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  40.1 
 
 		 215 aa  161  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  44.79 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  43 
 
 		 208 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0960  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  38.54 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  43.94 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2727  endonuclease III  39.41 
 
 		 224 aa  159  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  40.7 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3934  endonuclease III  44.44 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.386422  hitchhiker  0.00986962 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  45.6 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1364  endonuclease III  39.81 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.621669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  50 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  41.18 
 
 		 213 aa  159  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1472  endonuclease III  39.61 
 
 		 215 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.822891  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0123  endonuclease III  40.95 
 
 		 223 aa  158  5e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000215731  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0422  endonuclease III  40.57 
 
 		 234 aa  158  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.226123  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  43.22 
 
 		 261 aa  158  6e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0159  endonuclease III  45.21 
 
 		 260 aa  158  6e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.939047  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2793  endonuclease III  41.84 
 
 		 211 aa  158  7e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1603  endonuclease III  39.71 
 
 		 215 aa  158  7e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  40.69 
 
 		 226 aa  157  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1187  endonuclease III, DNA repair  38.81 
 
 		 214 aa  157  8e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00300969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4848  endonuclease III  43.39 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  42.31 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0447  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.15 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0205  endonuclease III  44.39 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0490975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0069  endonuclease III  43.69 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  43.07 
 
 		 212 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3375  endonuclease III  44.68 
 
 		 236 aa  156  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2939  endonuclease III  41.84 
 
 		 211 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  43.81 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.56 
 
 		 212 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.81 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  42.72 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04910  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  42 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  45.5 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  42.18 
 
 		 213 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1715  endonuclease III  43.81 
 
 		 214 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104745  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08500  endonuclease III  43.01 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.479508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>