More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0785 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0785  HhH-GPD  100 
 
 		 269 aa  533  1e-150  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.62 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  36.15 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  32.06 
 
 		 219 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  35.11 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  32.35 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5333  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35.68 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2234  endonuclease III  34.07 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000219145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.49 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  30.94 
 
 		 212 aa  94  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2840  HhH-GPD family protein  31.54 
 
 		 259 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465492  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  32.74 
 
 		 211 aa  92.4  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2122  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.16 
 
 		 212 aa  92  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.134945  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  31.84 
 
 		 212 aa  92  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  32.3 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3412  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  34.19 
 
 		 239 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  32.3 
 
 		 212 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  31.25 
 
 		 236 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  30.97 
 
 		 212 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1922  endonuclease III  30.66 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  32.3 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  32.3 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  32.3 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  32.3 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  32.3 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  32.3 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  31.47 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.47 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  32.3 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  32.3 
 
 		 211 aa  89.7  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  30.04 
 
 		 212 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  30.97 
 
 		 212 aa  89  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1815  endonuclease III  31.63 
 
 		 211 aa  89  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000116865  decreased coverage  0.000297282 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  31.9 
 
 		 215 aa  88.6  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  31.47 
 
 		 219 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  30.17 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  30.4 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2345  endonuclease III  31 
 
 		 211 aa  88.6  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0106344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2247  endonuclease III  32.44 
 
 		 213 aa  88.6  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000650328  normal  0.36112 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2013  endonuclease III  32.44 
 
 		 213 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000346358  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1901  endonuclease III  32.44 
 
 		 213 aa  88.6  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000183349  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  30.17 
 
 		 211 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  30.53 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  31.39 
 
 		 213 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2160  endonuclease III  29.82 
 
 		 211 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  32.43 
 
 		 213 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1551  endonuclease III  30.17 
 
 		 211 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.651941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1721  endonuclease III  30.17 
 
 		 211 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.161227  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1623  endonuclease III  30.17 
 
 		 211 aa  87.8  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.475261  normal  0.347988 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1905  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.4 
 
 		 213 aa  87  3e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  32.3 
 
 		 212 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  29.65 
 
 		 212 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2059  endonuclease III  30.4 
 
 		 213 aa  86.3  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000403968  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1866  endonuclease III  30.97 
 
 		 211 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2945  Endonuclease III FCL domain protein  31.74 
 
 		 254 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  hitchhiker  0.00145788 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4551  hypothetical protein  30.4 
 
 		 213 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2265  endonuclease III  30.4 
 
 		 213 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000635696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2514  endonuclease III  29.87 
 
 		 231 aa  86.3  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2106  endonuclease III  30.4 
 
 		 213 aa  85.9  6e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0792284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  29.63 
 
 		 212 aa  86.3  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2178  endonuclease III  30.97 
 
 		 213 aa  85.9  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.468625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2174  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.74 
 
 		 211 aa  85.9  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.660077  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1005  endonuclease III protein  33.02 
 
 		 214 aa  85.5  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.248668  normal  0.180711 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  33.63 
 
 		 213 aa  85.5  8e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2279  endonuclease III  29.6 
 
 		 213 aa  85.5  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0342815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  30.7 
 
 		 242 aa  85.5  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2718  HhH-GPD family protein  31.3 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.74745 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_806  endonuclease III protein  30.54 
 
 		 225 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2971  endonuclease III  31.16 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2070  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.96 
 
 		 213 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.027671  normal  0.855553 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.09 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0851  endonuclease III  31.01 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  31.39 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  29.6 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.6 
 
 		 212 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2704  endonuclease III  30.38 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  30.53 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_002936  DET0935  endonuclease III  31.38 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0000351084  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  29.65 
 
 		 211 aa  83.2  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1844  endonuclease III  29.52 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000031535  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  30.97 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2350  endonuclease III  30.91 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.55 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  32 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  29.15 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  30.18 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  30.04 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  30.18 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.38 
 
 		 222 aa  82.4  0.000000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.87 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  31.8 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5669  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.45 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3106  endonuclease III  30.34 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0829  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.62 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.141999  normal  0.027211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2359  endonuclease III  30.36 
 
 		 213 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2097  endonuclease III  33.03 
 
 		 214 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.161318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2366  endonuclease III  31.8 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249238  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1074  endonuclease III  32.44 
 
 		 235 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2327  endonuclease III  30.45 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0732  endonuclease III  30.36 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.517887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>