More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1412 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1412  HhH-GPD family protein  100 
 
 		 242 aa  491  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5333  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  43.01 
 
 		 253 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3412  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  44.06 
 
 		 239 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2840  HhH-GPD family protein  39.9 
 
 		 259 aa  141  9e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465492  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2718  HhH-GPD family protein  40.93 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.74745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2945  Endonuclease III FCL domain protein  40.1 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  hitchhiker  0.00145788 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  35.09 
 
 		 236 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.31 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  31.7 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  37.38 
 
 		 224 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  33.85 
 
 		 204 aa  99  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.56 
 
 		 241 aa  97.4  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  35.18 
 
 		 236 aa  95.5  7e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  34.16 
 
 		 242 aa  92.8  4e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  34.25 
 
 		 233 aa  90.1  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.31 
 
 		 232 aa  89.4  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.83 
 
 		 219 aa  89.4  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.66 
 
 		 219 aa  88.6  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.74 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  32.64 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  31.9 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1446  endonuclease III  32.04 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1838  endonuclease III  34.5 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.749072  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  29.23 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  30.15 
 
 		 657 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  31.5 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0888  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.08 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  31.5 
 
 		 213 aa  78.2  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13250  endonuclease III  31.5 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  29.3 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.5 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.29 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  27.19 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  28.57 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  27.23 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0197  endonuclease III  30 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.67 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3556  endonuclease III  32.82 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.848548 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  30.69 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  26.73 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1031  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.5 
 
 		 214 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474778  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.88 
 
 		 270 aa  75.1  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2692  endonuclease III  30.5 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.841587  normal  0.269141 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.18 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  28.57 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  28.8 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  30.46 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  29 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2166  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.66 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0297232  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  27.75 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  33.16 
 
 		 233 aa  73.2  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  28.8 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  27.64 
 
 		 210 aa  72.8  0.000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1407  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.04 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.74 
 
 		 230 aa  72  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.96 
 
 		 274 aa  71.2  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43577  predicted protein  29.15 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00140419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  28.27 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4204  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.65 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  31.93 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  30.85 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  28.36 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1289  endonuclease III  29.44 
 
 		 220 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00130293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  29.02 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2109  endonuclease III  27 
 
 		 223 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.171881  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.28 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1772  endonuclease III  29.23 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1914  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.22 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0826  endonuclease III  30.41 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0857  endonuclease III  28.5 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.08 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  25 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  29.95 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1089  endonuclease III  26.34 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0205  endonuclease III/Nth  29.67 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.911472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2937  endonuclease III  30.49 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.206628 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  27.46 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  29.1 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0683  endonuclease III  27.05 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  27.32 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  26.55 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  29.38 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  27.27 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  27.86 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1676  endonuclease III  26.5 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0235  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.5 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.784957  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1691  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.65 
 
 		 356 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1456  endonuclease III  27.5 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1428  endonuclease III  27.5 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0645154  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1429  endonuclease III  27.5 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.965291  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1570  endonuclease III  27.5 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1714  endonuclease III  27.5 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.147583  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0584  endonuclease III  29.85 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.675785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1641  endonuclease III  27.5 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00426336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  29.32 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0961  endonuclease III  29.38 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000122491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  25.81 
 
 		 212 aa  68.6  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0162  endonuclease III  29.19 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.562877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>