More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1244 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  100 
 
 
250 aa  513  1.0000000000000001e-145  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  52.21 
 
 
228 aa  221  8e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  51.39 
 
 
223 aa  221  9e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  44.14 
 
 
225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  50.69 
 
 
220 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  51.64 
 
 
223 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  48.6 
 
 
222 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  48.8 
 
 
257 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  47.95 
 
 
223 aa  206  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  48.31 
 
 
216 aa  205  5e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  49.3 
 
 
222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  49.51 
 
 
224 aa  198  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  51.69 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  47.89 
 
 
232 aa  196  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  46.15 
 
 
226 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  50.96 
 
 
225 aa  193  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  47 
 
 
228 aa  192  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  47 
 
 
228 aa  192  5e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  50.68 
 
 
223 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  50.68 
 
 
223 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  49.75 
 
 
234 aa  190  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  47.64 
 
 
221 aa  186  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  51.64 
 
 
217 aa  186  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  46.01 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  45.45 
 
 
223 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  45.83 
 
 
226 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  43.19 
 
 
223 aa  174  9e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  42.79 
 
 
206 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  41.9 
 
 
221 aa  169  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  43.75 
 
 
218 aa  166  4e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  42.18 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  41.06 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  38.81 
 
 
220 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  38.36 
 
 
220 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  40.18 
 
 
213 aa  159  3e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  44.17 
 
 
237 aa  158  7e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  35.32 
 
 
232 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  39.05 
 
 
229 aa  150  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  38.25 
 
 
216 aa  150  2e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  35.65 
 
 
232 aa  149  5e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.36 
 
 
232 aa  148  8e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 
232 aa  143  3e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  40.5 
 
 
225 aa  143  3e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.2 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  41.44 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  37.88 
 
 
216 aa  138  7.999999999999999e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  45.95 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  37.17 
 
 
211 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  35.34 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  38.39 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  35.42 
 
 
297 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  38.46 
 
 
221 aa  123  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  33.46 
 
 
243 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  36.7 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  36.7 
 
 
211 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  37.38 
 
 
215 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  35.84 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.61 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.2 
 
 
274 aa  110  3e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  35.42 
 
 
204 aa  109  4.0000000000000004e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  35.98 
 
 
226 aa  107  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  40.13 
 
 
221 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  35.76 
 
 
228 aa  103  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  35.71 
 
 
219 aa  103  4e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  33.18 
 
 
222 aa  103  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  36.17 
 
 
236 aa  102  6e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.77 
 
 
230 aa  102  8e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  34.5 
 
 
233 aa  101  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.49 
 
 
222 aa  100  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  35.81 
 
 
228 aa  99.8  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  31.6 
 
 
218 aa  99  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  32.14 
 
 
216 aa  99  7e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  31.03 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  32.92 
 
 
228 aa  96.7  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  31 
 
 
269 aa  95.5  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  28.43 
 
 
227 aa  94.4  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.88 
 
 
270 aa  93.6  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  29.63 
 
 
224 aa  92.8  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  29.1 
 
 
208 aa  90.9  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.86 
 
 
222 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  27.35 
 
 
236 aa  87.8  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  28.5 
 
 
213 aa  87.8  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.54 
 
 
230 aa  87  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  28.24 
 
 
220 aa  85.5  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  31.46 
 
 
242 aa  85.5  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  25.24 
 
 
211 aa  85.5  8e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  26.16 
 
 
241 aa  85.5  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.42 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.93 
 
 
218 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  26.7 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  27.75 
 
 
210 aa  84.3  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.94 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  29.8 
 
 
221 aa  83.6  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  26.32 
 
 
236 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.23 
 
 
219 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  28.97 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  26.24 
 
 
220 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  29.27 
 
 
219 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.37 
 
 
238 aa  82  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  29.56 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>