163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_0466 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  100 
 
 		 216 aa  444  1.0000000000000001e-124  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  54.84 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  57.28 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  54.55 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  47.8 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  48.42 
 
 		 228 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  46.84 
 
 		 228 aa  160  1e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  45.23 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  48.07 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  37.88 
 
 		 250 aa  138  6e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  40.58 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  38.62 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  39.71 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  38.54 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  41.18 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.69 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  38.71 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  38.73 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  37.77 
 
 		 222 aa  125  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  37.44 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  35.1 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  39.27 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  38.14 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  38.14 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  39.22 
 
 		 223 aa  121  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  39.61 
 
 		 216 aa  121  8e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  36.73 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  36.59 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  38.42 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.89 
 
 		 223 aa  118  7e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  36.65 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  37.86 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  38.25 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  36.59 
 
 		 206 aa  114  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  36.76 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  32.21 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  35.1 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  35.57 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  34.72 
 
 		 223 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  35.96 
 
 		 219 aa  112  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  38.32 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  38.32 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  36.27 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  33.82 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  33.99 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.85 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  39.66 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  37.62 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.55 
 
 		 232 aa  104  9e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  31.25 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  36.26 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  38.33 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  31.75 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  40.54 
 
 		 254 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  32.63 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  36.81 
 
 		 215 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  27.4 
 
 		 297 aa  91.7  8e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  28.85 
 
 		 296 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  34.5 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  32.95 
 
 		 268 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.84 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  37.04 
 
 		 216 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  33.71 
 
 		 243 aa  85.5  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  35.2 
 
 		 232 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  31.82 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  35.82 
 
 		 204 aa  78.2  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  35.15 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  31.02 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  31.03 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  28.57 
 
 		 233 aa  69.3  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  27.04 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.63 
 
 		 222 aa  62  0.000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  28.98 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  32.81 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.22 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  30.82 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  30.86 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  28.85 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  31.08 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  31.08 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0663  HhH-GPD family protein  29.2 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0113206  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  31.5 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  28.03 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.38 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  30.99 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1327  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.5 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000159505  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.57 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.2 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30 
 
 		 274 aa  52.8  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3917  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.57 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  28.35 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.81 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  27.54 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0873  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.37 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00263227  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2523  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.26 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.181892 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1891  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  26.7 
 
 		 233 aa  49.3  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.71 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  32.38 
 
 		 248 aa  48.1  0.00009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1283  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  36.9 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000427752  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3625  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.85 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>