114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18160 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_18160  uncharacterized endonuclease III-like protein  100 
 
 		 212 aa  406  1.0000000000000001e-112  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.141064  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0834  endonuclease III-like protein  40.93 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.509724  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0846  HhH-GPD family protein  33.68 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00183555  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  30.15 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1612  HhH-GPD family DNA repair protein  37.75 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1039  DNA-3-methyladenine glycosylase III  37.19 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491229 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0580  HhH-GPD family protein  41.71 
 
 		 234 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  35.82 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0263  endonuclease III, putative  30.77 
 
 		 211 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0904  HhH-GPD family protein  40.61 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00777346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  37.76 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2870  HhH-GPD family protein  41.18 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1875  DNA-3-methyladenine glycosylase III  32.22 
 
 		 237 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000316545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0921  HhH-GPD family protein  41.4 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.595294  normal  0.257216 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  34.33 
 
 		 220 aa  112  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0631  HhH-GPD family protein  30.98 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0646  HhH-GPD family protein  30.98 
 
 		 211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2009  HhH-GPD family protein  39.58 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483803  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1358  HhH-GPD family protein  34.95 
 
 		 223 aa  109  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  36.98 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  39.39 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1733  HhH-GPD family protein  33.16 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000108213  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1435  DNA-3-methyladenine glycosylase III  38.3 
 
 		 221 aa  105  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.115204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1494  HhH-GPD protein  33.98 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2572  putative endonuclease  34.55 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0686  HhH-GPD family protein  29.29 
 
 		 206 aa  104  9e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0196  HhH-GPD family protein  32.32 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00220253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0376  HhH-GPD family protein  33.66 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3377  helix-hairpin-helix domain-containing protein  33.98 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  34.65 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1638  HhH-GPD family protein  35.52 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  34.72 
 
 		 222 aa  101  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0971  HhH-GPD family protein  25.85 
 
 		 213 aa  101  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1800  HhH-GPD family protein  42.45 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.267286  normal  0.256575 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3521  HhH-GPD family protein  31.71 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.318887  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  41.89 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  41.89 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1436  HhH-GPD family protein  31.6 
 
 		 226 aa  97.8  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00274165  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1026  HhH-GPD family protein  36.79 
 
 		 216 aa  98.2  9e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0612  HhH-GPD family protein  27.5 
 
 		 225 aa  97.4  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3590  HhH-GPD family protein  32.98 
 
 		 228 aa  97.1  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0080  endonuclease III  31.41 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.801844  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0716  chemotaxis protein methyltransferase  30.23 
 
 		 222 aa  95.9  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0276125  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0522  HhH-GPD family protein  29.9 
 
 		 216 aa  95.5  5e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.42834  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0466  endonuclease III  31.02 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1021  DNA-3-methyladenine glycosylase III  24.31 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.499104  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3332  HhH-GPD family protein  39.22 
 
 		 297 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0307  HhH-GPD family protein  23.85 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1560  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.86 
 
 		 257 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0814  HhH-GPD  31.5 
 
 		 222 aa  90.1  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0231377  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1607  HhH-GPD family protein  23.85 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.341596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1010  HhH-GPD family protein  33.04 
 
 		 296 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.341182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1475  HhH-GPD  28.85 
 
 		 226 aa  89  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0340  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.01 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0101883  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0996  endonuclease III-like protein  25.91 
 
 		 216 aa  87.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02160  HhH-GPD family protein  30.35 
 
 		 224 aa  87.8  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000559772  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3333  DNA-3-methyladenine glycosylase III  27.78 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0577922  normal  0.0670566 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1611  HhH-GPD family protein  27.98 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1458  HhH-GPD family protein  22.37 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1244  HhH-GPD family protein  31.09 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00988433  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1310  uncharacterized endonuclease III related protein  26.16 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000484285 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1226  endonuclease III, putative  25.33 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0740  endonuclease III  25.74 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00244289  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1101  endonuclease III, putative  24.22 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.471141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0292  HhH-GPD family protein  30.43 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0651  HhH-GPD family protein  26.11 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  unclonable  0.0000000000124535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1038  HhH-GPD family protein  25 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.444398  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0640  putative endonuclease III  22.42 
 
 		 228 aa  72  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.178436  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2873  HhH-GPD family protein  35 
 
 		 268 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1583  DNA-3-methyladenine glycosylase III  33.58 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00807235  decreased coverage  0.00557129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.54 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  35.61 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.73 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1101  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  23.46 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00131579  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  29.21 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  27 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  26.9 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  27.64 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.01 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  27.68 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.42 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2070  HhH-GPD family protein  31.03 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  31.18 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  30.77 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  22.9 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2765  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.73 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.361393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  28.1 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4478  DNA-3-methyladenine glycosylase II  34.84 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.795178 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2806  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  28.46 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  25.82 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0118  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  27.2 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  28.86 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  30.18 
 
 		 270 aa  45.1  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  26.56 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  26.61 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  26.61 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  26.4 
 
 		 230 aa  45.1  0.0009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0705  DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.9 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.545476  normal  0.965549 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0009  endonuclease III  26.92 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000385159  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  25.57 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>