84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3041 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 890 aa  1705    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  88.54 
 
 		 890 aa  1409    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  43.85 
 
 		 873 aa  489  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  42.03 
 
 		 897 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  40.11 
 
 		 902 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  40.07 
 
 		 874 aa  358  2.9999999999999997e-97  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  37.93 
 
 		 848 aa  277  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  33.11 
 
 		 811 aa  258  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  33.06 
 
 		 880 aa  255  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  32.53 
 
 		 811 aa  252  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  35.37 
 
 		 595 aa  230  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  32.96 
 
 		 905 aa  196  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  32.85 
 
 		 883 aa  183  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  32.22 
 
 		 814 aa  179  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  35.03 
 
 		 751 aa  148  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 916 aa  117  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  31.28 
 
 		 689 aa  109  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.9 
 
 		 2741 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 		 846 aa  78.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.13 
 
 		 2741 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  30.77 
 
 		 1009 aa  78.2  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  42 
 
 		 861 aa  77.4  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  30.23 
 
 		 717 aa  77  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  30.53 
 
 		 959 aa  75.9  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.65 
 
 		 809 aa  74.7  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  36.47 
 
 		 827 aa  71.6  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  29.84 
 
 		 729 aa  69.7  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.03 
 
 		 1007 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  26.05 
 
 		 919 aa  66.6  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 868 aa  65.1  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  26.36 
 
 		 918 aa  62  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 1060 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.89 
 
 		 1162 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 1162 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.08 
 
 		 828 aa  57.4  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  37.23 
 
 		 1475 aa  57  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  24.12 
 
 		 1328 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  35.48 
 
 		 1142 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  26.15 
 
 		 992 aa  56.6  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  25.55 
 
 		 891 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5349  hypothetical protein  35.26 
 
 		 1441 aa  54.7  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.598215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.73 
 
 		 991 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 854 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 994 aa  54.3  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2979  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 1054 aa  53.9  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.864707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  23.56 
 
 		 1409 aa  53.5  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  30.59 
 
 		 903 aa  52.8  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 1247 aa  52.4  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6571  hypothetical protein  30.58 
 
 		 1077 aa  52.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.997096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  26.51 
 
 		 893 aa  52.4  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  32.03 
 
 		 1096 aa  51.2  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  29.17 
 
 		 1025 aa  51.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1546  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 1779 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.362162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  30.66 
 
 		 1051 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  25.8 
 
 		 755 aa  49.7  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1374  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 720 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1360  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 720 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  32.54 
 
 		 447 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2985  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 720 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.898664  hitchhiker  0.0000903507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1104 aa  49.7  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  32.43 
 
 		 1022 aa  49.7  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  24.38 
 
 		 1711 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  22.92 
 
 		 909 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  32.91 
 
 		 1228 aa  48.5  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1399  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 720 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405164  decreased coverage  0.00313663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  31.86 
 
 		 960 aa  48.5  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 1215 aa  47.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1552  TPR domain-containing protein  26.42 
 
 		 720 aa  47.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5133  hypothetical protein  30.12 
 
 		 1058 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1292  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 723 aa  47.4  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2883  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 720 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.897775  decreased coverage  0.00000211929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 923 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1214  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 1365 aa  46.6  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.7 
 
 		 968 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2781  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 720 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.416452  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2713  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 720 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274552  hitchhiker  0.0000574617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  31.67 
 
 		 965 aa  45.8  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  37.89 
 
 		 775 aa  45.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.2 
 
 		 1238 aa  45.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.03 
 
 		 782 aa  45.1  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  26.43 
 
 		 532 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4189  hypothetical protein  32.73 
 
 		 1246 aa  44.3  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  30.65 
 
 		 1147 aa  44.3  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1301  hypothetical protein  32.7 
 
 		 989 aa  44.3  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>