46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1292 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1360  TPR repeat-containing protein  71.92 
 
 		 720 aa  1087    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1374  TPR repeat-containing protein  72.34 
 
 		 720 aa  1090    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2883  TPR repeat-containing protein  74.69 
 
 		 720 aa  1103    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.897775  decreased coverage  0.00000211929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1292  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 723 aa  1493    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2781  TPR repeat-containing protein  74.41 
 
 		 720 aa  1113    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.416452  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2713  TPR repeat-containing protein  74.41 
 
 		 720 aa  1113    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274552  hitchhiker  0.0000574617 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1399  TPR repeat-containing protein  71.92 
 
 		 720 aa  1088    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405164  decreased coverage  0.00313663 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2985  TPR repeat-containing protein  72.48 
 
 		 720 aa  1096    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.898664  hitchhiker  0.0000903507 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1552  TPR domain-containing protein  72.48 
 
 		 720 aa  1038    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3308  TPR repeat-containing protein  38.99 
 
 		 718 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128236  hitchhiker  0.000709516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2753  TPR repeat-containing protein  42.33 
 
 		 718 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0197782 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2555  TPR repeat-containing protein  38.62 
 
 		 736 aa  486  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00405398  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2773  TPR repeat-containing protein  39.06 
 
 		 718 aa  483  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2417  TPR domain-containing protein  38.77 
 
 		 716 aa  473  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.614244  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3457  TPR repeat-containing protein  38.94 
 
 		 714 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2973  tetratricopeptide domain-containing protein  37.31 
 
 		 723 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.128138  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0423  hypothetical protein  23.03 
 
 		 753 aa  68.6  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.89 
 
 		 991 aa  63.9  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  25.24 
 
 		 695 aa  63.5  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 1060 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  26.79 
 
 		 828 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  30.4 
 
 		 2145 aa  58.5  0.0000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 714 aa  57  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.21 
 
 		 809 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.07 
 
 		 957 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  20.95 
 
 		 782 aa  55.1  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  33.04 
 
 		 724 aa  54.7  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0697  hypothetical protein  22.42 
 
 		 743 aa  52.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.419028  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 		 636 aa  51.2  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1404 aa  51.2  0.00006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  22.67 
 
 		 1261 aa  50.8  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25.53 
 
 		 1550 aa  50.4  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.52 
 
 		 1279 aa  48.9  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 1025 aa  48.5  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.03 
 
 		 985 aa  47.8  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  25.79 
 
 		 890 aa  47.8  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  19.28 
 
 		 1238 aa  47  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 		 854 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 438 aa  46.6  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 436 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 412 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.99 
 
 		 1162 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.79 
 
 		 852 aa  45.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 1162 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02383  response regulator  23.65 
 
 		 655 aa  44.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1212 aa  43.9  0.01  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>