46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2713 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1374  TPR repeat-containing protein  71.67 
 
 		 720 aa  1065    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2883  TPR repeat-containing protein  90.42 
 
 		 720 aa  1316    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.897775  decreased coverage  0.00000211929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1292  TPR repeat-containing protein  74.41 
 
 		 723 aa  1113    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1552  TPR domain-containing protein  83.89 
 
 		 720 aa  1202    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2985  TPR repeat-containing protein  71.39 
 
 		 720 aa  1061    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.898664  hitchhiker  0.0000903507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2781  TPR repeat-containing protein  99.86 
 
 		 720 aa  1479    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.416452  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1399  TPR repeat-containing protein  71.53 
 
 		 720 aa  1066    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405164  decreased coverage  0.00313663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2713  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 720 aa  1481    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274552  hitchhiker  0.0000574617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1360  TPR repeat-containing protein  71.39 
 
 		 720 aa  1063    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3308  TPR repeat-containing protein  40.08 
 
 		 718 aa  527  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128236  hitchhiker  0.000709516 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2753  TPR repeat-containing protein  41.86 
 
 		 718 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0197782 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2773  TPR repeat-containing protein  39.75 
 
 		 718 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2555  TPR repeat-containing protein  40.03 
 
 		 736 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00405398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3457  TPR repeat-containing protein  39.83 
 
 		 714 aa  486  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2417  TPR domain-containing protein  40.42 
 
 		 716 aa  476  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.614244  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2973  tetratricopeptide domain-containing protein  37.46 
 
 		 723 aa  451  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.128138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.43 
 
 		 991 aa  65.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  26.02 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.29 
 
 		 1060 aa  62  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0423  hypothetical protein  22.29 
 
 		 753 aa  60.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.6 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  25.68 
 
 		 714 aa  57.8  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0229  histidine kinase  33.91 
 
 		 724 aa  57.4  0.0000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0610831  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.87 
 
 		 636 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.07 
 
 		 2145 aa  56.2  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  26.9 
 
 		 809 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  25 
 
 		 1550 aa  55.1  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1404 aa  54.7  0.000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 		 957 aa  54.3  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.07 
 
 		 1279 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0697  hypothetical protein  22.77 
 
 		 743 aa  51.6  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.419028  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  25.57 
 
 		 1025 aa  50.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  18.38 
 
 		 782 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 1261 aa  50.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  24.2 
 
 		 436 aa  48.9  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  20.09 
 
 		 1238 aa  47.4  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 1313 aa  47  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  26.42 
 
 		 890 aa  47  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  25.18 
 
 		 412 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  21.93 
 
 		 985 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0976  transcriptional regulator, XRE family  22.92 
 
 		 775 aa  45.8  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 1048 aa  45.4  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 854 aa  44.7  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3413  histidine kinase internal region  27.66 
 
 		 671 aa  44.3  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  31.19 
 
 		 1162 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.19 
 
 		 1162 aa  43.9  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>