48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2973 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2973  tetratricopeptide domain-containing protein  100 
 
 		 723 aa  1482    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.128138  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3308  TPR repeat-containing protein  38.95 
 
 		 718 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128236  hitchhiker  0.000709516 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1292  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 723 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2781  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 720 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.416452  hitchhiker  0.00227805 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2713  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 720 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.274552  hitchhiker  0.0000574617 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1374  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 720 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2883  TPR repeat-containing protein  36.4 
 
 		 720 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.897775  decreased coverage  0.00000211929 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2985  TPR repeat-containing protein  36.86 
 
 		 720 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.898664  hitchhiker  0.0000903507 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2753  TPR repeat-containing protein  37.4 
 
 		 718 aa  444  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0197782 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1360  TPR repeat-containing protein  36.19 
 
 		 720 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1399  TPR repeat-containing protein  36.75 
 
 		 720 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.405164  decreased coverage  0.00313663 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1552  TPR domain-containing protein  37.94 
 
 		 720 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3457  TPR repeat-containing protein  37.15 
 
 		 714 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000557237 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2773  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 		 718 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2417  TPR domain-containing protein  33.43 
 
 		 716 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.614244  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2555  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 736 aa  349  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00405398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3715  histidine kinase  25.45 
 
 		 695 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.69 
 
 		 991 aa  67.4  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0415  histidine kinase  24.34 
 
 		 600 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 		 1060 aa  63.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2207  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 760 aa  62  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166244 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  23.79 
 
 		 755 aa  60.8  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  24.68 
 
 		 1360 aa  59.7  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  21.6 
 
 		 1238 aa  59.7  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  21.78 
 
 		 782 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0939  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 714 aa  56.2  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  25.81 
 
 		 828 aa  55.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  22.57 
 
 		 2145 aa  55.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  24.06 
 
 		 1025 aa  53.5  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  22.91 
 
 		 1550 aa  53.9  0.00001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1261 aa  52.8  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  22.17 
 
 		 957 aa  50.8  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  19.91 
 
 		 1015 aa  50.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  25.5 
 
 		 1009 aa  49.3  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 		 1313 aa  48.1  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0160  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 438 aa  47.8  0.0008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00134878  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  21.86 
 
 		 1147 aa  47  0.001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0899  transcriptional regulator, SARP family  23.59 
 
 		 919 aa  46.6  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0538686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2397  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 571 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3156  tetratricopeptide TPR_4  27.52 
 
 		 357 aa  46.6  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.605618  normal  0.725142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  19.46 
 
 		 985 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3391  transcriptional regulator, SARP family  21.88 
 
 		 971 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.436064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  21.22 
 
 		 412 aa  45.8  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  22.45 
 
 		 844 aa  45.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  23.35 
 
 		 343 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2580  diguanylate cyclase  22.75 
 
 		 653 aa  45.1  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  24.26 
 
 		 809 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  24.1 
 
 		 1404 aa  44.3  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>