More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0773 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0773  ribonuclease R  100 
 
 		 695 aa  1392    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000896455  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  41.11 
 
 		 716 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  41.48 
 
 		 716 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  40.79 
 
 		 751 aa  490  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  40.84 
 
 		 709 aa  483  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  40.5 
 
 		 751 aa  485  1e-135  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  40.44 
 
 		 762 aa  481  1e-134  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  40.44 
 
 		 758 aa  480  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  40.81 
 
 		 706 aa  482  1e-134  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  38.05 
 
 		 788 aa  473  1e-132  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  38.51 
 
 		 706 aa  475  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  39.6 
 
 		 814 aa  472  1e-132  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  40.48 
 
 		 806 aa  474  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  40.38 
 
 		 722 aa  473  1e-132  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  40.48 
 
 		 806 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  40.63 
 
 		 806 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  40.48 
 
 		 812 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  40.33 
 
 		 808 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  40.33 
 
 		 804 aa  470  1.0000000000000001e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  40.48 
 
 		 810 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  37.96 
 
 		 759 aa  472  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  40.33 
 
 		 808 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  40.33 
 
 		 808 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0450  VacB/RNase II family exoribonuclease  42.05 
 
 		 792 aa  466  9.999999999999999e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  39.48 
 
 		 792 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  40.03 
 
 		 757 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0821  ribonuclease R  39.83 
 
 		 790 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0805  ribonuclease R  39.83 
 
 		 790 aa  462  1e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.127645  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  42.08 
 
 		 619 aa  462  9.999999999999999e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0280  exoribonuclease II  39.33 
 
 		 705 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000108449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  38.39 
 
 		 763 aa  458  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  37.45 
 
 		 715 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  36.73 
 
 		 763 aa  452  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  37.07 
 
 		 752 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  39.91 
 
 		 710 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  39.76 
 
 		 710 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0273  ribonuclease R  37.82 
 
 		 770 aa  439  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.112412  normal  0.673615 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0747  ribonuclease R  38.35 
 
 		 903 aa  436  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.197271  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  34.34 
 
 		 720 aa  428  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  37.5 
 
 		 708 aa  426  1e-118  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0394  ribonuclease R  37.54 
 
 		 801 aa  424  1e-117  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00157968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  39.11 
 
 		 766 aa  425  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1625  ribonuclease R  35.6 
 
 		 737 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2601  ribonuclease R  35.61 
 
 		 737 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0821887  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  34.68 
 
 		 777 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  37.5 
 
 		 737 aa  399  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0106  hypothetical protein  33.67 
 
 		 726 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0091  hypothetical protein  33.82 
 
 		 726 aa  395  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1490  ribonuclease R  33.48 
 
 		 818 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1200  ribonuclease R  36.13 
 
 		 751 aa  392  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1513  ribonuclease R  38.19 
 
 		 704 aa  392  1e-107  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0815616  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1293  ribonuclease R  33.38 
 
 		 819 aa  381  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.611528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0643  RNAse R  32.45 
 
 		 828 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135735 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0886  ribonuclease R  33.68 
 
 		 801 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.127406  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0351  ribonuclease R  32.62 
 
 		 803 aa  382  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1626  ribonuclease R  33.69 
 
 		 840 aa  376  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0588631  normal  0.0102881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  35.36 
 
 		 705 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5664  exoribonuclease RNase R  33.43 
 
 		 906 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  34.86 
 
 		 709 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  35.11 
 
 		 726 aa  376  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  32.66 
 
 		 722 aa  375  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1953  VacB/RNase II family 3'-5' exoribonuclease  33 
 
 		 735 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.223171  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  34.34 
 
 		 857 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  34.61 
 
 		 858 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1232  ribonuclease R  33.57 
 
 		 736 aa  373  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1054  RNAse R  32.59 
 
 		 937 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.947842  normal  0.977325 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0788  exoribonuclease R  32.63 
 
 		 819 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1192  ribonuclease R  33.43 
 
 		 749 aa  372  1e-102  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65200  exoribonuclease RNase R  33.43 
 
 		 907 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3378  ribonuclease R  33.28 
 
 		 1055 aa  371  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3715  ribonuclease R  36.1 
 
 		 795 aa  369  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.713746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0579  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  32.06 
 
 		 877 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1891  ribonuclease R  32.45 
 
 		 746 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2092  RNAse R  31.34 
 
 		 876 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.300457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4936  ribonuclease R  32.15 
 
 		 857 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000328048 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0830  ribonuclease R  33.43 
 
 		 742 aa  368  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1565  ribonuclease R  32.45 
 
 		 746 aa  368  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000702631 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1976  ribonuclease R  32.45 
 
 		 755 aa  365  1e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2855  ribonuclease R  34.27 
 
 		 733 aa  365  2e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.180659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4760  ribonuclease R  31.86 
 
 		 857 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.334111  normal  0.140366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4670  ribonuclease R  31.9 
 
 		 859 aa  363  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.425963  normal  0.0849008 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1303  exoribonuclease R  34.44 
 
 		 779 aa  363  5.0000000000000005e-99  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00042422  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  32.27 
 
 		 863 aa  363  6e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  34.08 
 
 		 857 aa  363  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4935  ribonuclease R  31.47 
 
 		 877 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0151  exoribonuclease II (ribonuclease R)  32.63 
 
 		 804 aa  362  1e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4880  ribonuclease R  31.71 
 
 		 857 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3445  exoribonuclease R  32.47 
 
 		 818 aa  361  2e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.866643  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2072  RNAse R  31.48 
 
 		 870 aa  361  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.927626  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0580  ribonuclease R  32 
 
 		 758 aa  360  3e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000747077 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0986  exoribonuclease II  32.47 
 
 		 836 aa  360  5e-98  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00085  ribonuclease R  32.18 
 
 		 830 aa  360  5e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0868  ribonuclease R  32.16 
 
 		 838 aa  360  5e-98  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl209  virulence associated protein, ribonuclease R  37.35 
 
 		 704 aa  359  9.999999999999999e-98  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000726605  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1095  ribonuclease R  35.69 
 
 		 701 aa  359  9.999999999999999e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1017  ribonuclease R  35.24 
 
 		 726 aa  358  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2768  ribonuclease R  31.81 
 
 		 833 aa  358  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  32.56 
 
 		 770 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01238  ribonuclease R  31.87 
 
 		 842 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1546  ribonuclease R  30.72 
 
 		 827 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>