125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1536 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1536  DEAD_2 domain protein  100 
 
 		 537 aa  1097    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.849616  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0134  DEAD_2 domain-containing protein  84.51 
 
 		 537 aa  957    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00117441 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1288  DEAD_2 domain protein  31.65 
 
 		 550 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1867  DEAD_2 domain-containing protein  30.47 
 
 		 541 aa  202  9.999999999999999e-51  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.512598 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1737  DEAD_2 domain-containing protein  26.4 
 
 		 574 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000703978 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1117  DEAD_2 domain-containing protein  25.35 
 
 		 582 aa  117  5e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0620  DEAD_2 domain-containing protein  24.56 
 
 		 634 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1357  DEAD_2 domain-containing protein  24.96 
 
 		 575 aa  106  8e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0243831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0478  DEAD_2 domain-containing protein  26.77 
 
 		 588 aa  104  5e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.738253  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0390  DEAD_2 domain-containing protein  24.39 
 
 		 580 aa  100  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.12513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0289  DEAD_2  23.19 
 
 		 785 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00121679  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1408  putative ATP-dependent helicase  23.41 
 
 		 781 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5827  DEAD_2  20.62 
 
 		 779 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1217  ATP-dependent helicase, putative  23.49 
 
 		 781 aa  67.4  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.11747  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2947  DEAD_2 domain protein  22.67 
 
 		 774 aa  67.4  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.443127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1498  helicase c2  22.28 
 
 		 773 aa  65.9  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.486316  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4268  helicase c2  20.89 
 
 		 766 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0100597  normal  0.178799 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3978  helicase c2  20.34 
 
 		 766 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0904062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4389  helicase c2  20.34 
 
 		 766 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.787433  normal  0.56553 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3801  helicase c2  20.89 
 
 		 766 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.354929 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0984  DEAD_2 domain-containing protein  20.03 
 
 		 773 aa  64.3  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5966  helicase c2  20.17 
 
 		 766 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.224812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37740  predicted protein  27.98 
 
 		 849 aa  63.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.689797  normal  0.0804873 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  22.48 
 
 		 644 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  22.48 
 
 		 646 aa  63.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0660  DEAD_2 domain protein  22.47 
 
 		 790 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0995  DEAD_2 domain protein  21.4 
 
 		 777 aa  62.8  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0909  hypothetical protein  22.11 
 
 		 773 aa  62.4  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.205853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4111  helicase c2  21.67 
 
 		 766 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.620969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3423  hypothetical protein  22.38 
 
 		 758 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4233  helicase c2  20.55 
 
 		 757 aa  62  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.134799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1630  Rad3-related DNA helicases-like  20.03 
 
 		 766 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.138986  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10282  predicted protein  25.62 
 
 		 614 aa  61.2  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54439  YPL008W (CHL1)-like protein  28.92 
 
 		 835 aa  60.5  0.00000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.106037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5813  helicase c2  21.12 
 
 		 790 aa  60.1  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.208635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3036  hypothetical protein  20.54 
 
 		 761 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0104594  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0196  DEAD_2 domain protein  24.02 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.544403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  22.79 
 
 		 644 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2943  DEAD_2 domain-containing protein  20.83 
 
 		 753 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05090  CHL1 helicase, putative  27.06 
 
 		 849 aa  57.4  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0015  DEAD_2 domain-containing protein  21.03 
 
 		 750 aa  57.4  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.338089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4042  DEAD_2 domain protein  22.66 
 
 		 798 aa  57.4  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2690  DEAD_2  20.65 
 
 		 772 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00215798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1566  Rad3-related DNA helicases  21.47 
 
 		 726 aa  56.2  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000243015  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2112  DEAD_2 domain-containing protein  22.91 
 
 		 797 aa  56.6  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37445  predicted protein  21.36 
 
 		 938 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.258887  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2972  DEAD_2 domain-containing protein  21.06 
 
 		 753 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2228  helicase c2  21.37 
 
 		 639 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.232993  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0185  helicase c2  21.71 
 
 		 798 aa  55.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0911  putative ATP-dependent helicase  27.95 
 
 		 651 aa  55.5  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2909  DEAD_2  22.3 
 
 		 775 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0996428 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2806  DEAD_2 domain protein  23.23 
 
 		 785 aa  54.7  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717048  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5421  DEAD_2 domain protein  21.55 
 
 		 754 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1361  helicase c2  21.56 
 
 		 801 aa  53.5  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  20.69 
 
 		 639 aa  53.1  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1376  DNA helicase RepD  27.39 
 
 		 773 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.905642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  20.91 
 
 		 640 aa  52.8  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  21.91 
 
 		 649 aa  53.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40350  hypothetical protein  21.06 
 
 		 758 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.650358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1934  helicase c2  20.49 
 
 		 640 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.101214  normal  0.540234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  22.04 
 
 		 645 aa  53.5  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2763  helicase c2  21.15 
 
 		 634 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0359097  hitchhiker  0.00537714 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1933  helicase c2  21.38 
 
 		 639 aa  52.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10414  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G05590)  25.84 
 
 		 841 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_32894  predicted protein  35.42 
 
 		 1067 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0780237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40695  predicted protein  25.6 
 
 		 749 aa  52.8  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00000000149445  normal  0.993011 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1203  helicase c2  22.54 
 
 		 583 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281396  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4133  DEAD_2 domain protein  22.66 
 
 		 798 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2532  helicase c2  20.4 
 
 		 640 aa  52.8  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.139439 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5309  DEAD_2 domain-containing protein  19.44 
 
 		 756 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.173286  hitchhiker  0.0033003 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1847  DEAD_2 domain-containing protein  21.24 
 
 		 807 aa  51.6  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1104  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.84 
 
 		 676 aa  51.6  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  20.71 
 
 		 636 aa  51.6  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  20.71 
 
 		 636 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  20.71 
 
 		 636 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4835  helicase c2  22.2 
 
 		 874 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0589586 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  20.71 
 
 		 636 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  20.71 
 
 		 636 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  20.71 
 
 		 636 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  20.27 
 
 		 636 aa  51.2  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  20.71 
 
 		 636 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2413  helicase c2  20.23 
 
 		 669 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0561182  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0789  helicase c2  21.47 
 
 		 669 aa  50.8  0.00007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.222881  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_24915  predicted protein  21.92 
 
 		 791 aa  50.4  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.615618  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1699  DEAD_2 domain protein  21.72 
 
 		 670 aa  50.4  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0524758  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  20.71 
 
 		 636 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2424  helicase c2  20.07 
 
 		 669 aa  49.7  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0224  DEAD_2 domain-containing protein  22.55 
 
 		 852 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115724  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  20.54 
 
 		 636 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1013  helicase c2  21.45 
 
 		 588 aa  49.3  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  20.32 
 
 		 649 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2406  hypothetical protein  20.78 
 
 		 634 aa  49.3  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00282147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2128  helicase c2  21.96 
 
 		 634 aa  49.3  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  22.76 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1260  putative ATP-dependent helicase  21.69 
 
 		 755 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2850  DEAD_2 domain-containing protein  20.68 
 
 		 753 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1186  putative ATP-dependent helicase  20.91 
 
 		 755 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.146047  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  29.41 
 
 		 646 aa  48.1  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2017  hypothetical protein  20.78 
 
 		 634 aa  48.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.451998  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2839  DEAD_2 domain protein  20.55 
 
 		 762 aa  47.8  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>