More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3471 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3471  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components-like protein  100 
 
 		 668 aa  1280    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0304055  hitchhiker  0.00154798 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5068  ABC transporter related  59.13 
 
 		 666 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.427212  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2407  ABC transporter related  49.84 
 
 		 608 aa  499  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6065  ABC transporter related protein  45.08 
 
 		 578 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37370  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.28 
 
 		 626 aa  404  1e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0648785  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1594  ABC transporter related protein  46.62 
 
 		 601 aa  401  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172161  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0854  hypothetical protein  45.27 
 
 		 595 aa  395  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.64 
 
 		 610 aa  385  1e-105  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0195496  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3026  ABC transporter related  43.37 
 
 		 610 aa  381  1e-104  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3688  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 609 aa  365  1e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378004  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3049  ABC transporter related  40.53 
 
 		 574 aa  362  1e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.511073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5181  ABC transporter related  39.74 
 
 		 611 aa  343  8e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2574  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 579 aa  341  2.9999999999999998e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.987194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3826  ABC transporter related  43.25 
 
 		 628 aa  339  7e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.010026  normal  0.036205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3042  ABC transporter related  38.34 
 
 		 577 aa  336  9e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00708157 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0697  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 577 aa  334  4e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1128  ABC transporter related protein  41.87 
 
 		 579 aa  324  3e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8452  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease components  39.75 
 
 		 581 aa  314  3.9999999999999997e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0317897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28430  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.12 
 
 		 580 aa  310  5e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.344359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07630  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.64 
 
 		 601 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.134302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0420  ABC transporter related protein  38.71 
 
 		 581 aa  306  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0646  ABC transporter related  34.91 
 
 		 595 aa  304  3.0000000000000004e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.659544  normal  0.277933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2081  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 581 aa  296  9e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0747  ABC transporter related  38.95 
 
 		 590 aa  293  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4197  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 646 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.329748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  33.75 
 
 		 610 aa  262  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3726  ABC transporter related  35.83 
 
 		 579 aa  262  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0338159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  33.57 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  33.57 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  30.82 
 
 		 614 aa  247  6e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4061  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 579 aa  241  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.759201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0831  ABC transporter related  32.78 
 
 		 629 aa  238  2e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3801  hypothetical protein  32.45 
 
 		 615 aa  237  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3786  ABC transporter related  32.13 
 
 		 634 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3403  ABC transporter related  32.66 
 
 		 610 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1666  ABC transporter related  32.27 
 
 		 606 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.590055  normal  0.300337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  31.65 
 
 		 642 aa  231  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1748  ABC transporter related  32.03 
 
 		 605 aa  230  8e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  33.33 
 
 		 636 aa  227  6e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 632 aa  227  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.33 
 
 		 622 aa  226  9e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 632 aa  225  2e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.91 
 
 		 598 aa  225  2e-57  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1227  ABC transporter related  33.82 
 
 		 619 aa  224  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.141283  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1666  ABC transporter related  32.21 
 
 		 665 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5005  ABC transporter-related protein  32.35 
 
 		 606 aa  224  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3183  cyclic nucleotide-binding protein  30.67 
 
 		 608 aa  224  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4166  ABC transporter related  32.63 
 
 		 633 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.24565  hitchhiker  0.00267368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1441  ABC transporter related protein  33.58 
 
 		 606 aa  223  7e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.695725  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  25.44 
 
 		 597 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  32.3 
 
 		 596 aa  220  7e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0266  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.18 
 
 		 632 aa  216  8e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.358191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  34.91 
 
 		 1218 aa  216  8e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  32.68 
 
 		 627 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  31.43 
 
 		 628 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  31.03 
 
 		 640 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 		 614 aa  214  3.9999999999999995e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.19 
 
 		 1257 aa  213  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  30.53 
 
 		 637 aa  212  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  31.65 
 
 		 631 aa  211  3e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  31.38 
 
 		 626 aa  211  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01290  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.36 
 
 		 581 aa  211  4e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  30.28 
 
 		 658 aa  210  7e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  28.89 
 
 		 648 aa  209  1e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.17 
 
 		 591 aa  209  1e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 636 aa  209  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.91 
 
 		 634 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  32.08 
 
 		 687 aa  208  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  27.44 
 
 		 595 aa  207  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  31.16 
 
 		 627 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0520  ABC transporter related  31.38 
 
 		 652 aa  206  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00806721  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  31.16 
 
 		 627 aa  206  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1275  ABC transporter related protein  25.74 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  30.73 
 
 		 639 aa  205  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  29.56 
 
 		 592 aa  204  3e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  28.99 
 
 		 609 aa  204  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  29.62 
 
 		 648 aa  205  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  31.82 
 
 		 635 aa  205  3e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  30.97 
 
 		 641 aa  204  4e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  33.52 
 
 		 620 aa  204  5e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4713  ABC transporter related  31.05 
 
 		 616 aa  204  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  27.73 
 
 		 625 aa  204  6e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 622 aa  204  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  28.86 
 
 		 622 aa  204  6e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  28.35 
 
 		 614 aa  204  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  30.21 
 
 		 658 aa  203  7e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  24.79 
 
 		 615 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  29.52 
 
 		 642 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.73 
 
 		 608 aa  203  9.999999999999999e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  29.13 
 
 		 768 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  24.67 
 
 		 587 aa  201  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1510  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.64 
 
 		 628 aa  201  5e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.639878 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0822  ABC transporter related  26.32 
 
 		 640 aa  201  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0882213  hitchhiker  0.0000266707 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  30.73 
 
 		 640 aa  200  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  30.99 
 
 		 615 aa  200  6e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  31.83 
 
 		 663 aa  200  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6252  ABC transporter related  34.21 
 
 		 1436 aa  200  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  29.3 
 
 		 607 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  32.38 
 
 		 1218 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  28.24 
 
 		 814 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>