127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2935 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2935  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 383 aa  770    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0474976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2703  TPR domain-containing protein  29.33 
 
 		 394 aa  162  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00726  TPR domain protein  28.61 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2168  hypothetical protein  25.19 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0530  tetratricopeptide TPR_2  28.42 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4120  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.132007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3529  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 395 aa  122  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.178581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2902  tetratricopeptide TPR_2  26.36 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.449948  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0594  TPR repeat-containing protein  27.56 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.212365  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0757  TPR domain-containing protein  27.22 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3359  TPR repeat-containing protein  27.35 
 
 		 395 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.811599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0983  TPR repeat-containing protein  27.95 
 
 		 402 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.145285 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0626  TPR repeat-containing protein  26.44 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.13673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0936  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0800  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.014788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3647  Tetratricopeptide domain protein  26.45 
 
 		 397 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000857085  hitchhiker  0.00481631 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0836  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0293971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3829  TPR repeat-containing protein  26.33 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3705  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 397 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000033956  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0653  TPR domain-containing protein  24.65 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0849  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 		 393 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00820886  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1794  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 416 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2760  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 392 aa  89.4  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.258861  normal  0.160346 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1879  TPR repeat-containing protein  24.72 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684701 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1445  hypothetical protein  28.34 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000257118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1815  TPR repeat-containing protein  20.95 
 
 		 380 aa  62.4  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4477  tetratricopeptide TPR_4  36.36 
 
 		 236 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.545922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 550 aa  58.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.93 
 
 		 733 aa  57.4  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0901  tfp pilus assembly protein PilF  28.3 
 
 		 246 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1421 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1022  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 		 308 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 878 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.45 
 
 		 810 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 3145 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 955 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.65 
 
 		 632 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.26 
 
 		 816 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.49 
 
 		 2240 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  22.33 
 
 		 637 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.19 
 
 		 624 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  25.38 
 
 		 589 aa  50.1  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  26.62 
 
 		 1676 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  25.26 
 
 		 750 aa  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  23.2 
 
 		 820 aa  50.1  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  28.37 
 
 		 587 aa  49.7  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 		 352 aa  49.7  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.913573  normal  0.799861 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4983  TPR domain-containing protein  23.17 
 
 		 278 aa  49.3  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 685 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 927 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0908  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  25.32 
 
 		 837 aa  48.9  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3115  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 284 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000023055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0507  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 451 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1753  TPR repeat-containing protein  35.71 
 
 		 1014 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0882  TPR repeat-containing protein  31.39 
 
 		 388 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  26.22 
 
 		 743 aa  48.9  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  29.93 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0604  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.3 
 
 		 878 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1192 aa  48.5  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  29.46 
 
 		 545 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0486  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 445 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 361 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 808 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2365  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.11 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  25.97 
 
 		 405 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4642  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 249 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 689 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1943  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 952 aa  47.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.102548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  29.7 
 
 		 399 aa  47.8  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 649 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.16 
 
 		 1486 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  26.23 
 
 		 695 aa  47  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 688 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.78 
 
 		 615 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  29.14 
 
 		 792 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  29.75 
 
 		 866 aa  46.6  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 792 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  29.69 
 
 		 363 aa  46.2  0.0008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  35.83 
 
 		 667 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0270  TPR repeat-containing protein  29.53 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  29.68 
 
 		 968 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  23.38 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3833  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 446 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0811  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.29 
 
 		 236 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.940424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0639  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 542 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 1106 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 1450 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 594 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  22.78 
 
 		 603 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase, putative  21.08 
 
 		 1098 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.048897  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  24.2 
 
 		 594 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 824 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 602 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 681 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  27.7 
 
 		 718 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 697 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 1005 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>