More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0270 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0270  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 397 aa  791    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1981  glycosyl transferase family 2  42.93 
 
 		 391 aa  318  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804142 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3371  glycosyl transferase family protein  41.27 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.547122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3537  glycosyl transferase family 2  44.78 
 
 		 397 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2131  glycosyl transferase family protein  42.75 
 
 		 395 aa  310  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1760  glycosyl transferase family 2  39.33 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1736  glycosyl transferase family 2  39.07 
 
 		 392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26171  TPR repeat-containing glycosyl transferase  42.68 
 
 		 427 aa  288  9e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.599832 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5176  family 2 glycosyl transferase  38.11 
 
 		 434 aa  276  5e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.634801  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2352  hypothetical protein  42.2 
 
 		 400 aa  269  5.9999999999999995e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.831558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  41.33 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1386  glycosyl transferase family protein  38.46 
 
 		 657 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0252  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 		 677 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1128  glycosyl transferase family 2  37.3 
 
 		 414 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1388  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 421 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.739804  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1402  glycosyl transferase family protein  39.05 
 
 		 646 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1408  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 640 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3336  glycosyl transferase family protein  30.18 
 
 		 1268 aa  132  7.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0030  glycosyl transferase family 2  40.36 
 
 		 797 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0565776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1385  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 		 377 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3374  glycosyl transferase family 2  31.84 
 
 		 1435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1410  glycosyl transferase family protein  32.09 
 
 		 826 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  33.62 
 
 		 798 aa  123  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0939  glycosyl transferase family 2  42.02 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.334815  normal  0.709084 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1511  glycosyl transferase family protein  39.6 
 
 		 359 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.675878  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2023  glycosyl transferase family protein  27.15 
 
 		 385 aa  120  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2521  glycosyl transferase family 2  45.91 
 
 		 444 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00644687  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 		 1162 aa  119  7e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2617  glycosyl transferase family 2  37.89 
 
 		 444 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000160485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3823  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 1523 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.588357 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1337  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00375711  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  33.75 
 
 		 1523 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1409  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 585 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2559  glycosyl transferase family 2  47.17 
 
 		 754 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3656  glycosyl transferase family 2  37.02 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.306407 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1118  glycosyl transferase family protein  28.86 
 
 		 365 aa  101  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4733  glycosyl transferase family 2  37.02 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1695  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00815  hypothetical protein  34.98 
 
 		 362 aa  100  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491334  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4188  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 644 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1812  glycosyl transferase family protein  31.15 
 
 		 875 aa  100  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.515485  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0772  glycosyl transferase family protein  27.85 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1372  glycosyl transferase family protein  34.03 
 
 		 633 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.371979  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1578  glycosyl transferase  34.44 
 
 		 183 aa  98.6  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0848772  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2550  glycosyl transferase family 2  31.41 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.930398  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1263  glycosyl transferase, group 2 family protein  50 
 
 		 365 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4746  glycosyl transferase family 2  39.71 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0888  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 363 aa  96.3  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0933  glycosyl transferase family protein  52.13 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0802  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 		 386 aa  95.5  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3669  glycosyl transferase family 2  39.71 
 
 		 364 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.765348  normal  0.962708 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4078  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.14 
 
 		 365 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2810  glycosyl transferase family protein  36.67 
 
 		 356 aa  94.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1131  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.14 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1111  glycosyltransferase  51.14 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1224  group 2 family glycosyl transferase  51.14 
 
 		 370 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1292  glycosyl transferase, group 2 family protein  51.14 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0409043 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0991  glycosyl transferase family 2  35.33 
 
 		 493 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1477  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 		 877 aa  91.3  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5418  glycosyl transferase family protein  48.89 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0515  glycosyl transferase family protein  47.62 
 
 		 857 aa  91.3  3e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1331  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.73 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1369  glycosyl transferase, group 2 family protein  47.73 
 
 		 366 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1105  glycosyltransferase  47.73 
 
 		 365 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  37.71 
 
 		 878 aa  86.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0323  glycosyl transferase family protein  47.06 
 
 		 341 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00034223  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0171  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 860 aa  85.9  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0169  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 860 aa  84  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.14 
 
 		 810 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0220  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 608 aa  83.2  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0681  glycosyl transferase family 2  36.52 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2052  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 255 aa  79.7  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2771  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  42.59 
 
 		 269 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1178  glycosyl transferase family protein  37.96 
 
 		 535 aa  78.2  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026276 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1248  glycosyl transferase family protein  42.31 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.480822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1982  glycosyl transferase family protein  34.01 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1206  glycosyl transferase family protein  47.67 
 
 		 521 aa  76.6  0.0000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.959652  normal  0.0123578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2509  hypothetical protein  47.3 
 
 		 354 aa  76.3  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4816  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2091  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 		 260 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.646647  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0106  glycosyl transferase family protein  40.78 
 
 		 258 aa  75.9  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.002357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0588  glycosyl transferase family 2  36.08 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00392203  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0206  glycosyl transferase family protein  28.82 
 
 		 251 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.204479  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0291  UDP-glucose--lipooligosaccharide beta 1-4 glucosyltransferase  37.17 
 
 		 256 aa  74.7  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0225943  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 3145 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1574  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.15 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0213376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0968  glycosyl transferase family protein  35.96 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1693  group 2 family glycosyl transferase  28.15 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191123  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 632 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1446  glycosyl transferase family protein  42.16 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00046  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase  38.78 
 
 		 255 aa  73.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.11 
 
 		 725 aa  72.4  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.55 
 
 		 733 aa  72.8  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.5 
 
 		 689 aa  72.8  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0883  hypothetical protein  38.17 
 
 		 259 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0060  lipopolysaccharide core biosynthesis glycosyl transferase  44.12 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000254421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0066  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.12 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000310001  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4150  glycosyl transferase family protein  44.12 
 
 		 260 aa  70.9  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021853  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2005  glycosyl transferase family 2  30.67 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.983134  normal  0.586584 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3892  glycosyl transferase family protein  36.72 
 
 		 255 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>