More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1567 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 780 aa  1575    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  36.14 
 
 		 770 aa  466  9.999999999999999e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  31.31 
 
 		 703 aa  320  7.999999999999999e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 696 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  25.83 
 
 		 762 aa  240  9e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  25.84 
 
 		 688 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  24.63 
 
 		 682 aa  200  7.999999999999999e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  25.48 
 
 		 690 aa  194  7e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0733  tonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 680 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  23.57 
 
 		 691 aa  160  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 731 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 688 aa  150  8e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 728 aa  150  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 675 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  25.14 
 
 		 709 aa  149  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  25.72 
 
 		 715 aa  147  8.000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 694 aa  144  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  24.3 
 
 		 706 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  24.3 
 
 		 706 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  24.3 
 
 		 706 aa  143  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  24.3 
 
 		 721 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  24.16 
 
 		 706 aa  141  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  24.41 
 
 		 720 aa  137  9.999999999999999e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 700 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  24.16 
 
 		 700 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 701 aa  135  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 700 aa  135  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 742 aa  134  6.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  23.88 
 
 		 700 aa  134  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  23.18 
 
 		 726 aa  134  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  24.85 
 
 		 726 aa  134  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  24.18 
 
 		 757 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  23.98 
 
 		 700 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  23.74 
 
 		 700 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  23.98 
 
 		 700 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  23.99 
 
 		 723 aa  131  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  23.98 
 
 		 700 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  22.31 
 
 		 680 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 705 aa  129  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 700 aa  128  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  23.91 
 
 		 710 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 706 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  24.89 
 
 		 706 aa  117  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  22.41 
 
 		 681 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  22.79 
 
 		 717 aa  115  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4534  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 779 aa  115  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.732299 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.22 
 
 		 727 aa  114  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 678 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.26 
 
 		 715 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  23.22 
 
 		 681 aa  111  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 723 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 713 aa  106  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1302  TonB-dependent receptor  22.34 
 
 		 702 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.220115  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  22.49 
 
 		 716 aa  103  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  21.73 
 
 		 743 aa  100  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 705 aa  100  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0836  TonB-dependent receptor  22.39 
 
 		 787 aa  99.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 836 aa  99.8  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.24 
 
 		 712 aa  98.2  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0940  TonB-dependent receptor  22.62 
 
 		 706 aa  98.2  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  30.86 
 
 		 1018 aa  97.8  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  22.75 
 
 		 701 aa  97.4  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  22.17 
 
 		 698 aa  96.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  22.45 
 
 		 700 aa  96.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 828 aa  94.7  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 734 aa  94.7  6e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  24.13 
 
 		 791 aa  92.8  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1387  TonB-dependent receptor plug  27.17 
 
 		 1008 aa  92.8  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.840954  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  22.33 
 
 		 828 aa  92  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  23.02 
 
 		 733 aa  91.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  22.22 
 
 		 697 aa  92  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1728  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 690 aa  92  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.322796  normal  0.420828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 933 aa  91.3  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  24.51 
 
 		 791 aa  90.5  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  22.98 
 
 		 736 aa  90.1  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1082 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0808  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 714 aa  90.5  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.131492 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4137  outer membrane siderophore receptor, putative  22.63 
 
 		 690 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2500  TonB-dependent receptor  23.04 
 
 		 733 aa  87.8  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 1029 aa  87.4  8e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2627  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1117 aa  87.4  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.454001  normal  0.67516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3149  TonB-dependent receptor  21.2 
 
 		 785 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  31.09 
 
 		 769 aa  87.4  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.01 
 
 		 873 aa  86.7  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  22.96 
 
 		 818 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  22.66 
 
 		 861 aa  86.3  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  30.71 
 
 		 1086 aa  86.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3065  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 786 aa  85.9  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.935063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1856  TonB-dependent receptor  23.17 
 
 		 688 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.405305  normal  0.0244044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  26.86 
 
 		 793 aa  85.1  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  27.66 
 
 		 797 aa  84.3  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0236  TonB-dependent receptor  28.39 
 
 		 958 aa  84.3  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 		 979 aa  84  0.000000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 999 aa  84  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4475  TonB-dependent receptor  29.18 
 
 		 955 aa  83.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 975 aa  83.6  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  22.93 
 
 		 845 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  20.71 
 
 		 692 aa  83.6  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  29.01 
 
 		 1006 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  27.45 
 
 		 1085 aa  83.2  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>