More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0663 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0663  protein of unknown function UPF0118  100 
 
 		 373 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.177633 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3310  protein of unknown function UPF0118  67.82 
 
 		 354 aa  478  1e-134  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2927  permease  43.06 
 
 		 365 aa  300  3e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241708  normal  0.258096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0136  protein of unknown function UPF0118  44.1 
 
 		 387 aa  292  6e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291617  normal  0.459798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4116  protein of unknown function UPF0118  48.8 
 
 		 360 aa  276  5e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.614918  normal  0.119486 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2957  hypothetical protein  37.43 
 
 		 366 aa  245  9e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2317  protein of unknown function UPF0118  36.09 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.255461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3362  protein of unknown function UPF0118  33.96 
 
 		 367 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0425381  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1233  protein of unknown function UPF0118  34.08 
 
 		 370 aa  204  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0667714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4013  protein of unknown function UPF0118  34.22 
 
 		 389 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00579473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6357  protein of unknown function UPF0118  31.76 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2697  transport protein  33.95 
 
 		 371 aa  179  9e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0215163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5612  protein of unknown function UPF0118  32.98 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0555  hypothetical protein  27.17 
 
 		 380 aa  122  9e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.11052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0304  protein of unknown function UPF0118  26.93 
 
 		 650 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.10955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3083  hypothetical protein  28.62 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000376158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  29.28 
 
 		 396 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6648  putative phytochrome sensor protein  26.36 
 
 		 805 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1431  hypothetical protein  27.49 
 
 		 606 aa  108  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.145958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1773  hypothetical protein  25.54 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000027115  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6859  protein of unknown function UPF0118  26.01 
 
 		 662 aa  106  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0209  protein of unknown function UPF0118  26.13 
 
 		 651 aa  105  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3812  hypothetical protein  26.13 
 
 		 651 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5154  hypothetical protein  25.36 
 
 		 663 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3380  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.300528  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3055  permease  28.62 
 
 		 376 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0055436  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3381  membrane protein YubA  28.57 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00559166  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3355  hypothetical protein  28.16 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3380  hypothetical protein  28.57 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6242  hypothetical protein  24 
 
 		 659 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.253941  normal  0.568466 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1364  protein of unknown function UPF0118  27.87 
 
 		 420 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108983  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3161  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000118258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3145  permease  28.57 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000188051  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3410  hypothetical protein  28.57 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.38657  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2927  transport protein  27 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.799818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1871  membrane protein YubA  28.16 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  26.09 
 
 		 369 aa  103  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1990  protein of unknown function UPF0118  26.98 
 
 		 372 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4731  protein of unknown function UPF0118  27.3 
 
 		 649 aa  102  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0106944 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4560  hypothetical protein  22.38 
 
 		 668 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.119566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5020  protein of unknown function UPF0118  22.38 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247687  normal  0.0740005 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2298  hypothetical protein  23.48 
 
 		 371 aa  101  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0296876 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1892  putative GAF sensor protein  26.03 
 
 		 824 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.397553 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  25.74 
 
 		 398 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3882  putative GAF sensor protein  26.65 
 
 		 782 aa  101  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2560  hypothetical protein  23.74 
 
 		 644 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  24.2 
 
 		 349 aa  99.8  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5344  hypothetical protein  23.3 
 
 		 647 aa  99.4  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0275026 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4144  putative GAF sensor protein  26.59 
 
 		 801 aa  99.4  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0823  protein of unknown function UPF0118  27.09 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.74505  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4214  hypothetical protein  26.61 
 
 		 652 aa  99  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0784859  normal  0.378864 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4584  protein of unknown function UPF0118  26.61 
 
 		 652 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.113593  normal  0.096848 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  23.93 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1696  putative phytochrome sensor protein  26.45 
 
 		 830 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0662  protein of unknown function UPF0118  26.21 
 
 		 372 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3881  hypothetical protein  26 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.198688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2899  hypothetical protein  25.52 
 
 		 344 aa  96.3  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0256984  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1096  protein of unknown function UPF0118  26.22 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771823  hitchhiker  0.00624948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2774  hypothetical protein  25.41 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  26.99 
 
 		 344 aa  95.9  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0633  hypothetical protein  23.97 
 
 		 348 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0451762  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1003  permease  27.91 
 
 		 350 aa  95.9  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0492002  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1964  hypothetical protein  25.37 
 
 		 378 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  25.24 
 
 		 343 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4144  putative phytochrome sensor protein  24.16 
 
 		 821 aa  94.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0677009 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1242  protein of unknown function UPF0118  25.93 
 
 		 374 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.4957  hitchhiker  0.00297495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1060  hypothetical protein  24.79 
 
 		 645 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0742  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 361 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2201  hypothetical protein  25.35 
 
 		 365 aa  92.8  8e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000750597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  24.46 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2111  hypothetical protein  27.47 
 
 		 363 aa  92.8  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5076  protein of unknown function UPF0118  21.82 
 
 		 675 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.864281 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0456  protein of unknown function UPF0118  25.6 
 
 		 460 aa  92  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.204189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1910  putative transport protein  27.3 
 
 		 344 aa  92  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1495  protein of unknown function UPF0118  26.62 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0496073  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  26.27 
 
 		 375 aa  91.3  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0632  hypothetical protein  24.92 
 
 		 348 aa  91.7  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000226632  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0061  hypothetical protein  24.9 
 
 		 383 aa  91.3  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2541  protein of unknown function UPF0118  25.22 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.407102  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  24.69 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1725  protein of unknown function UPF0118  24.47 
 
 		 680 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2253  putative permease  25.21 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1623  PerM family permease  24.79 
 
 		 367 aa  90.5  4e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.134997 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2050  hypothetical protein  25.62 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116574  hitchhiker  0.00000000347502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2087  hypothetical protein  28.36 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.257402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1125  protein of unknown function UPF0118  23.53 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1066  hypothetical protein  22.49 
 
 		 359 aa  90.1  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.283585  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1233  membrane transporter  23.67 
 
 		 650 aa  90.5  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0210631  normal  0.375468 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  24.38 
 
 		 368 aa  90.5  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1855  hypothetical protein  25.07 
 
 		 368 aa  90.1  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0735664  normal  0.142574 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1704  hypothetical protein  24.05 
 
 		 650 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.61682 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0726  hypothetical protein  21.47 
 
 		 355 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3095  hypothetical protein  26.46 
 
 		 393 aa  89.4  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4051  hypothetical protein  25.15 
 
 		 354 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2002  hypothetical protein  25 
 
 		 434 aa  89.4  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0749036  hitchhiker  0.0034214 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  22.71 
 
 		 393 aa  89.4  9e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1488  hypothetical protein  24.04 
 
 		 341 aa  89  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000137756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3308  protein of unknown function UPF0118  22.89 
 
 		 452 aa  89  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0783017  normal  0.176079 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1635  hypothetical protein  25.68 
 
 		 357 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.546399  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4510  hypothetical protein  21.47 
 
 		 355 aa  89  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>