More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3335 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  100 
 
 		 520 aa  1036    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  75.19 
 
 		 520 aa  772    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  67.31 
 
 		 520 aa  704    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  67.12 
 
 		 520 aa  711    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  99.62 
 
 		 520 aa  1035    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  71.54 
 
 		 522 aa  724    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  61.78 
 
 		 592 aa  650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  70.33 
 
 		 522 aa  744    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  63.72 
 
 		 523 aa  681    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  76.06 
 
 		 519 aa  769    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  60.73 
 
 		 522 aa  617  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  53.83 
 
 		 548 aa  588  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  49.08 
 
 		 549 aa  488  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.81 
 
 		 522 aa  484  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  45.37 
 
 		 562 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  46.99 
 
 		 545 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  44.88 
 
 		 568 aa  466  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  46.45 
 
 		 539 aa  461  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  44.73 
 
 		 561 aa  456  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  47.38 
 
 		 536 aa  442  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  41.55 
 
 		 565 aa  397  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.35 
 
 		 561 aa  397  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  42.68 
 
 		 561 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  40.86 
 
 		 509 aa  356  6.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  35.14 
 
 		 523 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  37.09 
 
 		 533 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  34.38 
 
 		 551 aa  248  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  35.47 
 
 		 526 aa  244  3e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.39 
 
 		 565 aa  238  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  32.37 
 
 		 598 aa  236  8e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  30.8 
 
 		 551 aa  226  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  29.7 
 
 		 531 aa  219  8.999999999999998e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.33 
 
 		 526 aa  217  4e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  32.95 
 
 		 562 aa  217  5e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  33.12 
 
 		 557 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  33.69 
 
 		 557 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  28.86 
 
 		 551 aa  211  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  31.94 
 
 		 529 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  28.77 
 
 		 571 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  28.77 
 
 		 571 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  28.77 
 
 		 571 aa  200  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  28.77 
 
 		 571 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  28.57 
 
 		 571 aa  199  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  28.37 
 
 		 571 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  29.07 
 
 		 596 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  30.14 
 
 		 537 aa  197  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.56 
 
 		 474 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.62 
 
 		 474 aa  195  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  27.17 
 
 		 532 aa  192  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.25 
 
 		 473 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  29.33 
 
 		 529 aa  188  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  35.13 
 
 		 765 aa  188  3e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  28.81 
 
 		 530 aa  185  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.36 
 
 		 613 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  29.52 
 
 		 565 aa  172  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.05 
 
 		 567 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.45 
 
 		 593 aa  166  6.9999999999999995e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.09 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.77 
 
 		 550 aa  158  2e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  28.48 
 
 		 562 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  26.99 
 
 		 564 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  27.39 
 
 		 566 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  25.73 
 
 		 569 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  26.67 
 
 		 505 aa  146  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  25.97 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  29.23 
 
 		 486 aa  144  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.25 
 
 		 542 aa  137  6.0000000000000005e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  25.38 
 
 		 560 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  27.38 
 
 		 513 aa  130  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  27.56 
 
 		 509 aa  125  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  27.78 
 
 		 883 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  25.22 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.42 
 
 		 527 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  27.39 
 
 		 530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.18 
 
 		 526 aa  117  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  25.94 
 
 		 520 aa  114  6e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  25.25 
 
 		 581 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  25.96 
 
 		 566 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  25.71 
 
 		 513 aa  111  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  23.91 
 
 		 529 aa  111  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.42 
 
 		 892 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  24.04 
 
 		 575 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.19 
 
 		 492 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.19 
 
 		 492 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.19 
 
 		 492 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  25 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  25 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  25.39 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  23.5 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.19 
 
 		 492 aa  105  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1384  sodium:solute symporter family protein  24.46 
 
 		 588 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1358  Na+/solute symporter  26.46 
 
 		 587 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00027915  normal  0.0566975 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2672  Na+/solute symporter  23.99 
 
 		 599 aa  104  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.19 
 
 		 492 aa  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1526  Na+/solute symporter  24.66 
 
 		 586 aa  103  6e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  28.28 
 
 		 547 aa  103  7e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  27.47 
 
 		 581 aa  103  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0961  Na+/solute symporter  26.21 
 
 		 587 aa  103  8e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  25.52 
 
 		 492 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>