249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0558 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0558  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.235529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0359  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.717722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2200  putative regulatory protein TetR  27.43 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.841471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  33.66 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5814  transcriptional regulator, TetR family  24.41 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 236 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 205 aa  48.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 242 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  22.98 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  21.32 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 235 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 177 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 184 aa  46.2  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 181 aa  45.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  23.85 
 
 		 207 aa  45.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2112  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.935315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  22.04 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3154  transcriptional regulator, TetR family  23.21 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.06 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 177 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  30.37 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 236 aa  45.1  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  31.94 
 
 		 187 aa  45.1  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 205 aa  45.1  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 214 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  31.33 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  22.58 
 
 		 179 aa  44.7  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>