168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1449 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  681    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  76.72 
 
 		 335 aa  531  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  75.08 
 
 		 332 aa  525  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  73.95 
 
 		 334 aa  520  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  85.71 
 
 		 180 aa  293  3e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  82.61 
 
 		 169 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  80.61 
 
 		 175 aa  280  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  80 
 
 		 175 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  80 
 
 		 175 aa  277  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  79.39 
 
 		 175 aa  276  5e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  81.94 
 
 		 165 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  81.94 
 
 		 165 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  81.94 
 
 		 165 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  78.88 
 
 		 165 aa  272  6e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  84.56 
 
 		 165 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  78.79 
 
 		 175 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  78.79 
 
 		 175 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  78.79 
 
 		 175 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  78.79 
 
 		 175 aa  270  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  84.83 
 
 		 154 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  84.83 
 
 		 154 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  84.83 
 
 		 154 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  84.14 
 
 		 159 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  84.62 
 
 		 168 aa  265  8e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  75 
 
 		 155 aa  256  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  77.7 
 
 		 154 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  77.62 
 
 		 147 aa  250  2e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  71.86 
 
 		 168 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  59.71 
 
 		 144 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  37.54 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  56.55 
 
 		 148 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  55.17 
 
 		 148 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 		 160 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 		 148 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  35.03 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  37 
 
 		 304 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  53.47 
 
 		 160 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  53.47 
 
 		 160 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  53.47 
 
 		 160 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  54.23 
 
 		 150 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  33.44 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  54.73 
 
 		 157 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 		 159 aa  162  7e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  54.86 
 
 		 156 aa  162  8.000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  53.38 
 
 		 157 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  48.57 
 
 		 178 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  44.16 
 
 		 158 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  44.81 
 
 		 158 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  44.16 
 
 		 158 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  44.14 
 
 		 158 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 144 aa  140  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  50.81 
 
 		 139 aa  135  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  52.8 
 
 		 150 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  43.29 
 
 		 173 aa  130  3e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  39.63 
 
 		 172 aa  126  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 		 167 aa  126  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  44.06 
 
 		 152 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  45.31 
 
 		 145 aa  123  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  49.59 
 
 		 167 aa  123  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  40.12 
 
 		 168 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  39.51 
 
 		 168 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  39.51 
 
 		 168 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  40.85 
 
 		 233 aa  119  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  38.65 
 
 		 167 aa  118  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  47.93 
 
 		 152 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  41.22 
 
 		 163 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  45.99 
 
 		 155 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  41.22 
 
 		 163 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  40.91 
 
 		 163 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  41.46 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  40.15 
 
 		 163 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  38.24 
 
 		 140 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  41.54 
 
 		 151 aa  110  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  40.15 
 
 		 167 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5263  thioesterase superfamily protein  41.22 
 
 		 158 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 		 144 aa  104  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0905  phenylacetic acid degradation-related protein  37.31 
 
 		 167 aa  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.503626  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  44.26 
 
 		 128 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  40.34 
 
 		 162 aa  91.7  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  36.59 
 
 		 137 aa  77.8  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0100  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.975371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  67.4  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  35 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0432  hypothetical protein  32.59 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  32.35 
 
 		 157 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  28.99 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  32.89 
 
 		 155 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  32.8 
 
 		 188 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 138 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 155 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  32.61 
 
 		 169 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1344  hypothetical protein  32.09 
 
 		 166 aa  57  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1836  hypothetical protein  33.91 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  32.5 
 
 		 156 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  31.34 
 
 		 163 aa  54.3  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0737  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 154 aa  53.9  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1049  phenylacetic acid degradation-related protein  34.38 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000760712  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1022  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 		 128 aa  53.5  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  30.58 
 
 		 138 aa  53.1  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>