More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0196 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  502  1e-141  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  60.16 
 
 		 251 aa  335  3.9999999999999995e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  45.27 
 
 		 251 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  44.8 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  46.96 
 
 		 251 aa  211  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  44.4 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  43.33 
 
 		 249 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.98 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  44.26 
 
 		 251 aa  204  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2559  ABC transporter ATP-binding protein  41.98 
 
 		 249 aa  202  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  42.5 
 
 		 249 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4170  ABC transporter related  43.39 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  40.91 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2815  ABC transporter related  44.03 
 
 		 250 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.454528  normal  0.076686 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  43.98 
 
 		 249 aa  198  6e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1978  ABC transporter related  44.18 
 
 		 259 aa  198  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.951957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1402  ABC transporter related  41.63 
 
 		 257 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  42.49 
 
 		 266 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1576  ABC transporter related  44.4 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  41.91 
 
 		 250 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1243  ABC transporter related  44.98 
 
 		 260 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  38.46 
 
 		 840 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.33 
 
 		 260 aa  195  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  42.06 
 
 		 262 aa  195  6e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1605  ABC transporter related  45.42 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  42.74 
 
 		 264 aa  194  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  41.94 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  40.8 
 
 		 261 aa  194  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  40.91 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0633  ABC transporter related  47.72 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.622953  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  42.74 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1320  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  44.03 
 
 		 250 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  42.62 
 
 		 248 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0363  ABC transporter related  45.42 
 
 		 251 aa  194  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  42.57 
 
 		 254 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  43.44 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  42.21 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  40.08 
 
 		 253 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1859  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 		 259 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.200968 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.94 
 
 		 250 aa  193  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1176  ABC transporter related  44.03 
 
 		 252 aa  192  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  42.8 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  41.06 
 
 		 250 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  43.75 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1019  ABC transporter related  43.55 
 
 		 594 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  43.33 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.06 
 
 		 250 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3696  ABC transporter related  40 
 
 		 840 aa  191  9e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  42.74 
 
 		 260 aa  191  9e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  40.65 
 
 		 251 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  43.5 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  39.92 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2026  ABC transporter related  42.74 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  43.98 
 
 		 251 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  41.2 
 
 		 266 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0760  ABC transporter related  43.57 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  41.41 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1401  ABC transporter related  39.27 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.948053  normal  0.617202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1384  ABC transporter related  40.08 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0904717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  43.98 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  43.03 
 
 		 257 aa  189  5e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  42.08 
 
 		 250 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0733  ABC transporter related  42.5 
 
 		 597 aa  189  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  41.31 
 
 		 265 aa  188  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  42.28 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  42.28 
 
 		 256 aa  188  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4643  ABC transporter related  40.41 
 
 		 840 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343173  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  43.5 
 
 		 250 aa  188  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2718  ABC transporter related  44.49 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.743331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0428  ABC transporter related  39.59 
 
 		 863 aa  186  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  41.92 
 
 		 264 aa  186  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  42.74 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  40.62 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1514  ABC transporter related  39.68 
 
 		 251 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.168064  normal  0.658577 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4998  ABC transporter related  42.04 
 
 		 250 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.101708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  42.51 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0668  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  40.98 
 
 		 272 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6728  ABC transporter related  39.83 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  40.5 
 
 		 251 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1860  ABC transporter related  42.25 
 
 		 259 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.180905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5822  ABC transporter related  39.42 
 
 		 260 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.545268  normal  0.0926857 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0401  ABC-type branched-chain amino acid transport system, ATPase component  39.37 
 
 		 254 aa  186  4e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.87 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1852  ABC transporter-related protein  43.64 
 
 		 253 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  43.44 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  43.44 
 
 		 250 aa  185  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3576  ABC transporter related  39.34 
 
 		 838 aa  185  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0854  ABC transporter related  41.2 
 
 		 250 aa  185  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.690377  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  41.7 
 
 		 253 aa  185  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3186  ABC transporter related  41.91 
 
 		 254 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.556382 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.32 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2899  ABC transporter related  40.94 
 
 		 852 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3457  ABC transporter related  40 
 
 		 254 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  43.62 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.15 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  41.49 
 
 		 254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1335  ABC transporter related  41.87 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0569483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  39.83 
 
 		 254 aa  183  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  38.55 
 
 		 253 aa  182  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1049  ABC transporter related  39.59 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>