More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0668 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0668  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  100 
 
 		 272 aa  542  1e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  49.17 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0162  ABC transporter related  40.64 
 
 		 261 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.543023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2305  ABC transporter related protein  40 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 248 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  40.98 
 
 		 251 aa  186  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  44.67 
 
 		 259 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0027  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 250 aa  182  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  38.37 
 
 		 268 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  40.34 
 
 		 251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  42.06 
 
 		 250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  39.11 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0024  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 		 250 aa  180  2e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  37.04 
 
 		 263 aa  181  2e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  39 
 
 		 265 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5447  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  39.83 
 
 		 247 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.726701  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  40.24 
 
 		 252 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  37.65 
 
 		 253 aa  180  2.9999999999999997e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.24 
 
 		 250 aa  179  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7911  ABC transporter related  43.37 
 
 		 264 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  38.71 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2364  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.65 
 
 		 256 aa  176  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  42.11 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  41.43 
 
 		 277 aa  176  4e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6214  ABC transporter related  41.15 
 
 		 271 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  39.3 
 
 		 257 aa  176  5e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3320  ABC transporter related  43.67 
 
 		 329 aa  175  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  40.41 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  40.41 
 
 		 256 aa  175  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  37.3 
 
 		 251 aa  175  7e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.17 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  42.21 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.513247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  39.84 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 257 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  37.55 
 
 		 625 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  41.22 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 259 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2953  ABC transporter related  39.06 
 
 		 258 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.121974 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  39.52 
 
 		 250 aa  172  5e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  38.93 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3060  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  40.25 
 
 		 251 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.963696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2316  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.92 
 
 		 261 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 257 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.8 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  36.94 
 
 		 288 aa  171  9e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.53 
 
 		 277 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.68 
 
 		 254 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1447  ABC transporter related  38.62 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0752148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  38.68 
 
 		 258 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  40.16 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1285  ABC transporter related  38.62 
 
 		 256 aa  171  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  40.24 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  37.98 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  39.53 
 
 		 277 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.3 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 		 257 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  35.54 
 
 		 253 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4105  ABC transporter related  41.31 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0418  ABC transporter-like protein  42.86 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.912938 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 276 aa  170  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  38.52 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  37.19 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  39.75 
 
 		 246 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1772  ABC transporter related  36.21 
 
 		 247 aa  170  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  38.52 
 
 		 250 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  36.63 
 
 		 253 aa  170  3e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3315  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  39.42 
 
 		 251 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.52 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2849  ABC transporter related protein  40.98 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.485647  normal  0.511604 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  37.45 
 
 		 254 aa  169  4e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.89 
 
 		 257 aa  169  5e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  34.56 
 
 		 284 aa  169  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  39.59 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.83 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0996  ABC transporter related  38.84 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  39.37 
 
 		 270 aa  168  8e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1180  ABC transporter related  38.21 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1942  ABC transporter related  39.26 
 
 		 247 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1802  ABC transporter related  36.63 
 
 		 257 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.201927  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  35.68 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3555  ABC transporter related  37.96 
 
 		 256 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0799958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  38.25 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  39.11 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  38.27 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  37.7 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  38.31 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  37.34 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  37.9 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  38.31 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0223  ABC transporter related  36.95 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  38.31 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  41.04 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5860  ABC transporter related  38.49 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  40 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  38.96 
 
 		 250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>