More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_43540 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_43540  ABC transporter, ATP binding component  100 
 
 		 260 aa  525  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0288454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0549  ABC transporter related  78.16 
 
 		 265 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.505535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2987  ABC transporter related  80.16 
 
 		 277 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.657234  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  78.82 
 
 		 277 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0300535  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2990  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.7 
 
 		 264 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00578117  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0603  ABC transporter related  61.15 
 
 		 260 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.15363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0786  ABC transporter-related protein  62.55 
 
 		 263 aa  327  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.545872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  64.68 
 
 		 306 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3541  ABC transporter related  60.77 
 
 		 260 aa  324  7e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43780  ABC transporter, LivG family  64.86 
 
 		 262 aa  323  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.430374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0375  high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein livG  62.7 
 
 		 273 aa  323  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.529081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3608  ABC transporter related  60.94 
 
 		 261 aa  323  2e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.576125 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  64.68 
 
 		 313 aa  322  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3435  ABC transporter-related protein  61.51 
 
 		 264 aa  322  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000808082 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0250  ABC transporter related  61.92 
 
 		 260 aa  320  1.9999999999999998e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.830264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0953  ABC transporter related  62.85 
 
 		 274 aa  319  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.513158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4010  ABC transporter related  63.89 
 
 		 272 aa  318  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2748  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein, putative  65.75 
 
 		 266 aa  318  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.916728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3364  ABC transporter related  61.9 
 
 		 274 aa  318  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2218  ABC transporter related  62.85 
 
 		 274 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2278  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  62.85 
 
 		 279 aa  318  6e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3005  ABC transporter related  65.75 
 
 		 256 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0460  ABC transporter related  61.9 
 
 		 261 aa  315  3e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.530493  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0469  ABC transporter related  61.9 
 
 		 261 aa  315  4e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.331272  normal  0.304191 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1158  ABC transporter related  61.11 
 
 		 261 aa  314  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0049  ABC transporter related  63.24 
 
 		 269 aa  314  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5007  ABC transporter related  61.51 
 
 		 261 aa  313  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3491  ABC transporter related  61.57 
 
 		 256 aa  311  4.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.411905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  61.11 
 
 		 277 aa  311  6.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3799  ABC transporter related  61.57 
 
 		 256 aa  311  9e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.718599 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2544  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  60.47 
 
 		 256 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.661138  normal  0.234113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3873  ABC transporter related  62.75 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0725392 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5038  ABC transporter related  58.2 
 
 		 286 aa  301  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6107  ABC transporter related  59.29 
 
 		 261 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.319085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0114  ABC transporter related  61.11 
 
 		 272 aa  296  2e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.95101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0569  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  65.2 
 
 		 255 aa  296  2e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.383942  normal  0.0445823 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  58.5 
 
 		 269 aa  289  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  58.1 
 
 		 270 aa  289  3e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7156  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  55.77 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  55.34 
 
 		 269 aa  280  2e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  54.86 
 
 		 296 aa  278  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  56.05 
 
 		 282 aa  275  7e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  55.65 
 
 		 275 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  55.42 
 
 		 276 aa  272  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  53.36 
 
 		 265 aa  271  7e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2309  ABC transporter related  55.82 
 
 		 269 aa  271  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0078002 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  55.82 
 
 		 269 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  55.65 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  52.8 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  52.94 
 
 		 280 aa  267  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  53.2 
 
 		 265 aa  266  2e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  50.59 
 
 		 269 aa  261  8.999999999999999e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  50.79 
 
 		 266 aa  258  6e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1598  ABC transporter related protein  54.76 
 
 		 260 aa  258  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.41 
 
 		 273 aa  257  1e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3163  ABC transporter related protein  51.21 
 
 		 292 aa  257  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2281  ABC transporter related  53.97 
 
 		 264 aa  256  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2360  ABC transporter related  51.92 
 
 		 278 aa  255  4e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.547386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  49.8 
 
 		 289 aa  254  9e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  51.16 
 
 		 274 aa  253  1.0000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_809  branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  47.97 
 
 		 276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4298  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.54 
 
 		 305 aa  253  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  hitchhiker  0.00350718 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  49.61 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0822  ABC transporter related  48.47 
 
 		 276 aa  249  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3842  ABC transporter related  51.79 
 
 		 289 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000140209  normal  0.918006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3030  ABC transporter related protein  50.4 
 
 		 274 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.096709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  51.79 
 
 		 294 aa  248  7e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1465  ABC transporter-like protein  50.4 
 
 		 291 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3832  ABC transporter related protein  50.6 
 
 		 285 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0759  ABC transporter related protein  49.03 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0938  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  46.86 
 
 		 270 aa  242  6e-63  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0956002  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  48.41 
 
 		 251 aa  238  5.999999999999999e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  46.43 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0135  ABC transporter-like protein  50.6 
 
 		 255 aa  235  5.0000000000000005e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1001  ABC transporter related  49.61 
 
 		 268 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1438  ABC transporter related  55.42 
 
 		 310 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409389  hitchhiker  0.00000418659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  47.79 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  50.2 
 
 		 276 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  43.7 
 
 		 265 aa  230  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0609  ATPase  43.53 
 
 		 261 aa  230  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3771  ABC transporter related protein  46.64 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.417118  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  49.21 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2014  ABC transporter related  45.49 
 
 		 263 aa  229  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  45.45 
 
 		 271 aa  228  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  47.22 
 
 		 256 aa  228  7e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0588  ABC transporter related protein  44.58 
 
 		 255 aa  228  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  44.44 
 
 		 259 aa  228  9e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  45.78 
 
 		 259 aa  228  9e-59  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  47.98 
 
 		 270 aa  227  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0289  ABC transporter related  47.41 
 
 		 612 aa  226  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.92204  normal  0.8343 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  44.18 
 
 		 263 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  41.91 
 
 		 284 aa  226  2e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  49.21 
 
 		 273 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1425  ABC transporter related  44.62 
 
 		 253 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.715565  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.98 
 
 		 270 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  41.54 
 
 		 284 aa  226  3e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5286  ABC transporter related  45.88 
 
 		 283 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4818  ABC transporter related  47.43 
 
 		 274 aa  225  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.177699  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1542  ABC transporter related protein  47.41 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000371483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  45.38 
 
 		 264 aa  225  5.0000000000000005e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>