More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6214 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6214  ABC transporter related  100 
 
 		 271 aa  538  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  42 
 
 		 253 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  45.04 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2058  ABC transporter related  42.39 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2451  ABC transporter related  42.8 
 
 		 257 aa  185  6e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4009  ABC transporter related  44.21 
 
 		 250 aa  182  7e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.704457  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2246  ABC transporter ATP-binding protein  41.56 
 
 		 257 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.423117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  40.89 
 
 		 484 aa  181  1e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4817  putative ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 260 aa  180  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.355184  normal  0.730838 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  41.98 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0668  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  41.15 
 
 		 272 aa  176  5e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.508853 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0223  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.46 
 
 		 247 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  41.77 
 
 		 250 aa  171  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1750  ABC transporter related  39 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.272511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0291  ABC transporter related  38.17 
 
 		 268 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3381  ABC transporter related  39 
 
 		 265 aa  169  6e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3392  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.32 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1582  ABC transporter related  38.87 
 
 		 250 aa  168  8e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0196  ABC transporter related  41.67 
 
 		 251 aa  168  8e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  42.5 
 
 		 246 aa  168  8e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3237  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  38.93 
 
 		 259 aa  168  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0314824  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3911  ABC transporter related  38.37 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.651155  normal  0.068215 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0860  ABC transporter related  39.58 
 
 		 536 aa  166  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.473738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1708  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  35.06 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00618326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1697  ABC transporter related  40.4 
 
 		 593 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.777579  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1589  ABC transporter related  38.31 
 
 		 250 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.536198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3142  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  34.26 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.589399  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2727  ABC transporter related  36.93 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0769832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  36.51 
 
 		 268 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2972  response regulator receiver domain-containing protein  34.4 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.85607  normal  0.195493 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2064  ABC transporter related  38.06 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  39.58 
 
 		 251 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1985  ABC transporter related  40.25 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.356154  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5671  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  34.4 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3735  ABC transporter related  34.4 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4633  ABC transporter related  34.4 
 
 		 247 aa  162  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3590  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 		 247 aa  162  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 276 aa  161  9e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3864  ABC transporter related  36.78 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  39.11 
 
 		 257 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2028  ABC transporter related  41.53 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.480224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  39 
 
 		 621 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2123  ABC transporter-like protein  38.43 
 
 		 250 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.542398 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  37.25 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0567  ABC transporter related  32.4 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0705  ABC transporter related  41.49 
 
 		 505 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.355127  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4607  ABC transporter related  39.75 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2327  ABC transporter related  39.67 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.47517  normal  0.0713014 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2335  ABC transporter related  39.67 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.448695  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1362  ABC transporter related  38.59 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.58229 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  38.52 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0979  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  33.85 
 
 		 254 aa  160  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.436167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2288  ABC transporter related  39.67 
 
 		 275 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4220  ABC transporter related  39.51 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2032  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0564166  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0839  ABC transporter related  37.5 
 
 		 246 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.211901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2011  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 		 257 aa  159  6e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4907  ABC transporter related  37.92 
 
 		 266 aa  159  6e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  38.31 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1932  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.22 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4184  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 271 aa  157  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.233186  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4463  ABC transporter related  36.21 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.27047  normal  0.236919 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4075  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.51 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416831  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4556  ABC transporter related  36.29 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1394  ABC transporter related  39.59 
 
 		 250 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.665987 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2527  ABC transporter related  40.82 
 
 		 266 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.727233  normal  0.57543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0080  ABC transporter related  40.74 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3410  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400579 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3115  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.1 
 
 		 248 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.848406  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0127  ABC transporter related  35.54 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1243 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  36.67 
 
 		 250 aa  157  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0763  ABC transporter related  40.66 
 
 		 504 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  39.92 
 
 		 251 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4328  ABC transporter related  37.45 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.233197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0659  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  36.99 
 
 		 269 aa  156  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1989  ABC transporter related  35.66 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.599945  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1793  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1594  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  33.2 
 
 		 247 aa  156  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1933  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  34.55 
 
 		 257 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  36.21 
 
 		 266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5704  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.695215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1446  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  35.12 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.685432  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1750  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.844188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2617  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtD  36.19 
 
 		 264 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0395155 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0934  ABC transporter related  39.18 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00957205  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1416  ABC transporter related  39.18 
 
 		 250 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4298  ABC transporter related  38.08 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4062  ABC transporter related  35.1 
 
 		 259 aa  155  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.662042  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1661  ABC transporter related  37.45 
 
 		 260 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3796  ABC transporter related  36.73 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.477228  normal  0.17284 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3909  ABC transporter related  36.73 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.804783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3801  ABC transporter related  39.83 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6327  ABC transporter related  38.93 
 
 		 252 aa  155  9e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2593  ABC transporter-related protein  38.91 
 
 		 277 aa  155  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.479665  normal  0.611604 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1767  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.790665  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  38.1 
 
 		 254 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1968  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.55 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000325906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2715  ABC transporter related  38.59 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00707444  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3478  ABC transporter related  37.76 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.213105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>