More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3137 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3137  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3494  OmpA/MotB domain-containing protein  98.03 
 
 		 254 aa  487  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2459  OmpA/MotB domain-containing protein  61.54 
 
 		 197 aa  152  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1012  OmpA/MotB  41.51 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857514 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0900  OmpA/MotB  40.57 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3033  OmpA/MotB domain-containing protein  41.23 
 
 		 269 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0106321 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.14 
 
 		 637 aa  75.1  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.71 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0870  OmpA/MotB  40.57 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0729  OmpA/MotB domain protein  38.79 
 
 		 282 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.965103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2821  OmpA/MotB domain-containing protein  42.16 
 
 		 236 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.700022  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5159  OmpA/MotB domain protein  33.59 
 
 		 216 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.314153  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  39.82 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3028  OmpA/MotB  37.74 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.251626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1151  OmpA/MotB domain-containing protein  35.52 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0260064  normal  0.0786224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  39.42 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009485  BBta_0555  hypothetical protein  36.79 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.279361 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  39.13 
 
 		 509 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.81 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.83 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  38.83 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 487 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 487 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  39 
 
 		 487 aa  68.9  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0896  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2207  putative outer membrane protein of unknown function  31.25 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.533668 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  37.86 
 
 		 242 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0113937 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  36.28 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.33 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1289  OmpA/MotB domain protein  31.45 
 
 		 260 aa  67  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000447727  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1008  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 212 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.223165  normal  0.0458619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0127  outer membrane protein  42.31 
 
 		 415 aa  66.6  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017735  normal  0.0709429 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0835  OmpA/MotB domain-containing protein  35.45 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.374195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4178  OmpA/MotB domain-containing protein  36.03 
 
 		 229 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  38.83 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.89 
 
 		 214 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.33 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  35.78 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1992  OmpA/MotB domain-containing protein  31.21 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  39.42 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  38.1 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1336  OmpA/MotB domain protein  33.65 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.761552  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  34.82 
 
 		 440 aa  65.5  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2789  OmpA/MotB domain-containing protein  36.89 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000026968  hitchhiker  0.00127263 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  37.86 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  34.97 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  41 
 
 		 481 aa  65.1  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0900  signal peptide protein  37.17 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0000937501  normal  0.517414 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1135  OmpA/MotB domain-containing protein  32.35 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00317388  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0909  OmpA/MotB domain-containing protein  31.82 
 
 		 227 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1403  OmpA/MotB domain protein  37.74 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0715247  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6949  OmpA/MotB domain protein  30.91 
 
 		 189 aa  63.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  37.86 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  34 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  42.72 
 
 		 609 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  33.59 
 
 		 607 aa  63.2  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  36.43 
 
 		 277 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  37.27 
 
 		 345 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  37.5 
 
 		 240 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  35.46 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2069  OmpA/MotB  37.04 
 
 		 703 aa  62.8  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0149284  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  37.86 
 
 		 464 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2579  OmpA/MotB  35.4 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  35.24 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0712  OmpA/MotB  35.4 
 
 		 217 aa  62.4  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0107689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  35.59 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  33.59 
 
 		 351 aa  62.4  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  34.75 
 
 		 310 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  34.75 
 
 		 310 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  39.22 
 
 		 226 aa  62  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04077  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)protein  35.92 
 
 		 205 aa  62  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  35.78 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  34.75 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  34.75 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3649  OmpA/MotB domain-containing protein  36.54 
 
 		 218 aa  62  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0958  OmpA/MotB domain-containing protein  35.92 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  34.75 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0053  OmpA/MotB domain protein  36.61 
 
 		 333 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  34.75 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  35.78 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  35.78 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3395  peptidoglycan-associated lipoprotein  38.24 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.184385  hitchhiker  0.00984431 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  34.75 
 
 		 310 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2246  OmpA/MotB  38.61 
 
 		 167 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.18876  normal  0.277213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  39 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.79 
 
 		 525 aa  61.6  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  40.18 
 
 		 1987 aa  61.6  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  37.86 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0841  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0197529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  34.86 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0749  OmpA/MotB  34.4 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  38.61 
 
 		 261 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3509  OmpA/MotB domain-containing protein  43.14 
 
 		 742 aa  60.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  38.39 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0770  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00244637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>