268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3461 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  548  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  82.92 
 
 		 281 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  82.21 
 
 		 281 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  47.87 
 
 		 284 aa  263  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  48.42 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  49.11 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  40.71 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  44.68 
 
 		 283 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  41.49 
 
 		 283 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  38.16 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  38.16 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  38.16 
 
 		 287 aa  196  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  41.2 
 
 		 284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  37.01 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  35.94 
 
 		 283 aa  185  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  40.34 
 
 		 288 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  40 
 
 		 288 aa  182  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  35.79 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  36.14 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  37.54 
 
 		 284 aa  179  4e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  36.17 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  33.8 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  35.69 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  32.98 
 
 		 281 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  37.72 
 
 		 283 aa  161  1e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  32.29 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  35.69 
 
 		 284 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  32.27 
 
 		 281 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  32.86 
 
 		 286 aa  142  4e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  28.87 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  30.1 
 
 		 307 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  28.52 
 
 		 281 aa  97.8  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  24.11 
 
 		 278 aa  97.1  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  22.92 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  22.26 
 
 		 284 aa  82.8  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  21.55 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  22.03 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  25.86 
 
 		 279 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  28.67 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  26.11 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  26.49 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  31.78 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.79 
 
 		 297 aa  58.9  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  27.12 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  31.65 
 
 		 270 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1566  universal stress protein family protein  28.11 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.57632  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.25 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  50.98 
 
 		 271 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3584  hypothetical protein  29.3 
 
 		 278 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  35 
 
 		 172 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0708  hypothetical protein  38.2 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.560113  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3201  hypothetical protein  31.25 
 
 		 156 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2431  universal stress protein family protein  38.2 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1719  universal stress family protein  38.2 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  31.18 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0754  universal stress family protein  38.2 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.576046  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1233  universal stress family protein  38.2 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.705496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1159  universal stress family protein  38.2 
 
 		 279 aa  53.9  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.39 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  33.33 
 
 		 281 aa  53.1  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5577  UspA domain protein  35.8 
 
 		 140 aa  53.1  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00018626  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  36.59 
 
 		 155 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  30.93 
 
 		 279 aa  52.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  32.91 
 
 		 271 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  32.56 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  32.35 
 
 		 279 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1416  UspA domain protein  26.67 
 
 		 280 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.700604  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2605  hypothetical protein  27.33 
 
 		 279 aa  52.4  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.490664  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  29.66 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  26.74 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0742  UspA domain-containing protein  34.87 
 
 		 286 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.861253 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2008  UspA domain-containing protein  27.14 
 
 		 141 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0427  UspA domain-containing protein  30.43 
 
 		 271 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  30.67 
 
 		 281 aa  51.2  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0401  hypothetical protein  31.25 
 
 		 140 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  41.82 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2280  UspA12  31.33 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1893  UspA domain protein  31.65 
 
 		 136 aa  50.4  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.125519  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  38.16 
 
 		 281 aa  50.4  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  25.32 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  27.01 
 
 		 298 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0912  UspA domain-containing protein  26.5 
 
 		 317 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363039 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.5 
 
 		 140 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  31.78 
 
 		 286 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  23.55 
 
 		 282 aa  49.7  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  48 
 
 		 277 aa  49.7  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  26.97 
 
 		 281 aa  49.7  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1168  hypothetical protein  42.25 
 
 		 279 aa  49.7  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  28.67 
 
 		 274 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0776  UspA domain protein  30.34 
 
 		 570 aa  49.3  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  30.71 
 
 		 278 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  25.48 
 
 		 309 aa  49.3  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1529  UspA domain protein  32.99 
 
 		 287 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.459492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2292  UspA domain-containing protein  35.05 
 
 		 287 aa  48.9  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0820685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  22.17 
 
 		 283 aa  49.3  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1568  universal stress protein family protein  28.72 
 
 		 278 aa  48.9  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.801358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1852  hypothetical protein  32.12 
 
 		 275 aa  49.3  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  31.76 
 
 		 156 aa  49.3  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3035  UspA domain-containing protein  27.5 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.415696  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>