More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1479 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2251  helicase domain-containing protein  38.43 
 
 		 1100 aa  701    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.788605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0298  helicase domain-containing protein  50.53 
 
 		 1128 aa  1093    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.189592  normal  0.0770021 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4501  helicase domain protein  37.75 
 
 		 1086 aa  676    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.304192 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3669  helicase domain-containing protein  56.84 
 
 		 1109 aa  1286    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1479  helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1140 aa  2336    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3323  helicase domain protein  50.09 
 
 		 1153 aa  1055    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000535173 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5516  helicase domain-containing protein  39.96 
 
 		 853 aa  609  1e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2539  helicase domain-containing protein  26.85 
 
 		 1131 aa  266  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0445  helicase domain-containing protein  27.77 
 
 		 1016 aa  258  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0490  helicase domain protein  27.31 
 
 		 1052 aa  250  1e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1425  helicase domain protein  27.46 
 
 		 1051 aa  235  3e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2911  helicase domain protein  27.48 
 
 		 1112 aa  232  3e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0768227  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1550  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.05 
 
 		 1085 aa  229  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3437  helicase domain protein  26.98 
 
 		 1124 aa  229  3e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1535  helicase domain-containing protein  26.23 
 
 		 1086 aa  227  8e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1602  helicase domain-containing protein  25.68 
 
 		 1080 aa  219  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.602122  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0411  helicase domain-containing protein  25.67 
 
 		 1086 aa  217  9.999999999999999e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1670  helicase domain protein  25.26 
 
 		 1109 aa  216  9.999999999999999e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0799  helicase domain protein  28.44 
 
 		 1077 aa  211  8e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.356327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3414  helicase domain protein  25.21 
 
 		 1127 aa  211  9e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2177  helicase domain protein  28.62 
 
 		 1081 aa  207  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2252  helicase domain-containing protein  28.06 
 
 		 1075 aa  205  4e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0034  helicase domain protein  27.36 
 
 		 1153 aa  204  6e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3644  helicase domain protein  27.66 
 
 		 1125 aa  202  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0362  helicase domain protein  27.3 
 
 		 1083 aa  199  4.0000000000000005e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0152  helicase domain-containing protein  26.4 
 
 		 1075 aa  197  1e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0594133  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1109  helicase/SNF2 domain-containing protein  28.66 
 
 		 1075 aa  196  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1146  helicase domain protein  26.87 
 
 		 1082 aa  196  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0937503 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1203  hypothetical protein  26.8 
 
 		 1065 aa  193  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.666944  normal  0.0115575 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  25.86 
 
 		 1117 aa  192  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1519  helicase domain protein  27.6 
 
 		 1078 aa  191  5e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00298818  hitchhiker  0.00000196773 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1748  DEAD/DEAH box helicase-like  28.5 
 
 		 1067 aa  191  7e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0783  helicase domain-containing protein  29.22 
 
 		 1077 aa  189  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.105121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5225  helicase domain protein  26.95 
 
 		 1074 aa  187  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.786499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6770  helicase domain-containing protein  25.33 
 
 		 1143 aa  185  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.652865  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2490  helicase DEAD/DEAH box  25.12 
 
 		 1087 aa  183  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0540271  normal  0.0731117 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0521  helicase-like protein  28.45 
 
 		 1089 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.036679  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0157  helicase domain-containing protein  28.51 
 
 		 1078 aa  180  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046471 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1126  helicase domain protein  27.53 
 
 		 1064 aa  178  5e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0541  helicase-like  25.9 
 
 		 1090 aa  178  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137746  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1396  helicase domain protein  28.11 
 
 		 1065 aa  177  9e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0240  helicase domain-containing protein  28.29 
 
 		 1072 aa  172  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4597  helicase domain protein  26.83 
 
 		 1069 aa  169  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0861  Snf2/Rad54 family helicase  24.8 
 
 		 1160 aa  167  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001848 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2162  helicase-like protein  23.87 
 
 		 1065 aa  153  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1830  helicase domain-containing protein  30.42 
 
 		 1053 aa  127  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0580  helicase-like  37.19 
 
 		 1071 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.254655  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4207  helicase domain-containing protein  35.47 
 
 		 1077 aa  113  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124797  normal  0.095515 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0183  helicase domain-containing protein  27.87 
 
 		 1122 aa  106  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.482568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3971  helicase domain protein  30.1 
 
 		 1060 aa  105  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00406642  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1947  helicase domain protein  24.96 
 
 		 1099 aa  100  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  40.27 
 
 		 1043 aa  95.9  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  24.06 
 
 		 924 aa  94  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3488  type III restriction enzyme, res subunit  26.01 
 
 		 696 aa  92.8  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325873  normal  0.223098 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  29.94 
 
 		 1046 aa  88.2  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  36.93 
 
 		 941 aa  87.4  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  36.93 
 
 		 941 aa  87.4  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3376  helicase domain-containing protein  32.82 
 
 		 877 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  32.18 
 
 		 1037 aa  85.5  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  37.33 
 
 		 972 aa  84.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  30.69 
 
 		 1147 aa  84.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  24.7 
 
 		 1212 aa  83.6  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  33.18 
 
 		 962 aa  84  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1352  helicase-like  29.79 
 
 		 928 aa  82.4  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  31.68 
 
 		 1065 aa  82.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  31.68 
 
 		 1065 aa  82.8  0.00000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  30.72 
 
 		 1116 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  23.9 
 
 		 1170 aa  82  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  32.81 
 
 		 966 aa  80.9  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0985  helicase domain-containing protein  35.81 
 
 		 813 aa  81.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.033377  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  32.34 
 
 		 1062 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  31.77 
 
 		 969 aa  79.7  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  27.09 
 
 		 541 aa  79  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  32.66 
 
 		 801 aa  79  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  34.21 
 
 		 805 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  37.4 
 
 		 988 aa  78.2  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  26.99 
 
 		 937 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  32.23 
 
 		 933 aa  77  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  34.5 
 
 		 933 aa  76.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  30.63 
 
 		 1129 aa  76.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  32.05 
 
 		 1013 aa  75.9  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  30.21 
 
 		 760 aa  75.5  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  31.71 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0219  helicase-like  33.33 
 
 		 840 aa  75.1  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000357618  hitchhiker  0.00781123 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  38.14 
 
 		 915 aa  75.1  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  38.06 
 
 		 949 aa  74.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  37.29 
 
 		 916 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  28.14 
 
 		 922 aa  74.3  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  22.96 
 
 		 1138 aa  74.3  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  27.42 
 
 		 889 aa  74.3  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  37.29 
 
 		 915 aa  73.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  30.22 
 
 		 919 aa  72.8  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  29.44 
 
 		 1069 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  29.44 
 
 		 1069 aa  73.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  31.51 
 
 		 560 aa  72  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  31.51 
 
 		 560 aa  72  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  31.51 
 
 		 560 aa  72  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  31.84 
 
 		 1170 aa  72.4  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  31.51 
 
 		 560 aa  72  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  31.51 
 
 		 560 aa  72  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>