More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3937 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3937  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 293 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.629256  normal  0.0112723 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4203  polysaccharide deacetylase family protein  99.32 
 
 		 293 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2502  polysaccharide deacetylase  86.6 
 
 		 293 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1692  polysaccharide deacetylase family protein  86.25 
 
 		 293 aa  534  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000173795  normal  0.0616933 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2405  polysaccharide deacetylase family protein  86.6 
 
 		 293 aa  535  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000804057  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2092  polysaccharide deacetylase  84.19 
 
 		 291 aa  525  1e-148  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0344916 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5882  polysaccharide deacetylase family protein  80.2 
 
 		 293 aa  511  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0999  polysaccharide deacetylase  81.03 
 
 		 294 aa  507  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.289502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2033  polysaccharide deacetylase  83.79 
 
 		 300 aa  508  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0672  polysaccharide deacetylase family protein  78.5 
 
 		 293 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.193798  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2326  polysaccharide deacetylase  77.4 
 
 		 294 aa  485  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39050  predicted xylanase/chitin deacetylase  76.71 
 
 		 295 aa  472  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.619767 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4391  polysaccharide deacetylase  73.63 
 
 		 296 aa  468  1.0000000000000001e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.424954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  72.85 
 
 		 319 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2229  polysaccharide deacetylase  73.2 
 
 		 296 aa  463  1e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22830  predicted xylanase/chitin deacetylase  69.05 
 
 		 295 aa  433  1e-120  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1415  putative polysaccharide deacetylase  68.28 
 
 		 300 aa  424  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.226464  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3485  polysaccharide deacetylase  67.93 
 
 		 300 aa  423  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3662  polysaccharide deacetylase  68.68 
 
 		 378 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57412  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06518  polysaccharide deacetylase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G05030)  63.32 
 
 		 295 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0030  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 299 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08606  hypothetical polysaccharide deacetylase (Eurofung)  41.53 
 
 		 303 aa  244  9.999999999999999e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.940784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3477  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  40 
 
 		 307 aa  215  7e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3310  polysaccharide deacetylase domain protein  40 
 
 		 307 aa  215  9e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3384  polysaccharide deacetylase domain protein  40 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.691477 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3377  putative xylanase/chitin deacetylase  40 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3304  polysaccharide deacetylase domain protein  40 
 
 		 307 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.216596  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  38.32 
 
 		 271 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  39.58 
 
 		 299 aa  205  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  39.78 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6336  polysaccharide deacetylase  37.94 
 
 		 279 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.932988 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0928  polysaccharide deacetylase  38.28 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.686986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 287 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  34.53 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  33.68 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  32.42 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  33.73 
 
 		 321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  31.32 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  31.65 
 
 		 299 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  30.5 
 
 		 296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5709  polysaccharide deacetylase  30.43 
 
 		 294 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.903612  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2856  polysaccharide deacetylase  29.84 
 
 		 281 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709645 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  29.6 
 
 		 273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  31.14 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  29.75 
 
 		 290 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  28.79 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  30.17 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  28.62 
 
 		 302 aa  114  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  30.42 
 
 		 292 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  26.86 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  27.98 
 
 		 282 aa  108  2e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2100  hypothetical protein  31.29 
 
 		 297 aa  99.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.726789 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0456  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 330 aa  91.7  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0475  polysaccharide deacetylase  25.93 
 
 		 330 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1477  polysaccharide deacetylase  25.51 
 
 		 298 aa  88.6  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.167942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  22.18 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2116  urate catabolism protein  28.46 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126861  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1393  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 336 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1353  polysaccharide deacetylase  27.67 
 
 		 341 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4151  polysaccharide deacetylase family protein  26.34 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3692  polysaccharide deacetylase  26.34 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44830  hypothetical protein  28.85 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.190091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4092  polysaccharide deacetylase  24.69 
 
 		 312 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  hitchhiker  0.00263168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0986  twin-arginine translocation pathway signal  27.27 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.649552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1468  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 336 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  33.12 
 
 		 276 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1446  polysaccharide deacetylase  26.38 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2857  polysaccharide deacetylase  23.79 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3204  polysaccharide deacetylase  27.31 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.933502  normal  0.3249 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3818  hypothetical protein  28.08 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0653039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0469  chitin deacetylase  26.64 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0934  polysaccharide deacetylase  26.69 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0312  polysaccharide deacetylase  24.55 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1300  urate catabolism protein  27.03 
 
 		 317 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.540933  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3666  polysaccharide deacetylase family protein  26.36 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.854112  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1926  putative polysaccharide deacetylase  26.72 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.644925 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  34.86 
 
 		 273 aa  75.9  0.0000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1878  urate catabolism protein  27.73 
 
 		 332 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312787  normal  0.172237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3513  polysaccharide deacetylase  24.18 
 
 		 294 aa  75.5  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.206647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3850  urate catabolism protein  27.38 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.387177  normal  0.686624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1809  polysaccharide deacetylase  26.98 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  35.9 
 
 		 280 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1951  polysaccharide deacetylase  27.73 
 
 		 332 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1100  urate catabolism protein  27.41 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270076 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1607  hypothetical protein  23.63 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1987  urate catabolism protein  27.73 
 
 		 317 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.567399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5278  polysaccharide deacetylase  26.64 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0440872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2329  urate catabolism protein  27.2 
 
 		 316 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.276332 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2718  polysaccharide deacetylase  26.48 
 
 		 298 aa  74.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2432  polysaccharide deacetylase  27.8 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2533  polysaccharide deacetylase family protein  27.8 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3450  polysaccharide deacetylase  25.6 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231432 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3475  polysaccharide deacetylase  27.2 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.40619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6114  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1963  polysaccharide deacetylase  27.34 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>