115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3836 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3836  fimbrial protein-like protein  100 
 
 		 362 aa  745    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.38252  normal  0.631566 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2227  fimbrial protein, putative  34.9 
 
 		 370 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0719141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2036  fimbrial protein  34.41 
 
 		 371 aa  176  6e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.031194  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1498  fimbrial protein  35.07 
 
 		 359 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1454  fimbrial protein  33.53 
 
 		 360 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.118343 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1888  fimbrial protein  32.5 
 
 		 364 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0436738  hitchhiker  0.00532877 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3393  fimbrial protein  33.33 
 
 		 176 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6274  type-1 fimbrial protein subunit A  37.04 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.229557  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0987  fimbrial protein  31.18 
 
 		 187 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.752417  normal  0.0768978 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0589  type-1 fimbrial protein, A chain  31.22 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.108306  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  30.13 
 
 		 355 aa  57.4  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0836  Fimbrial protein  29.01 
 
 		 298 aa  57  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.252785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1052  fimbrial protein  28.85 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0195347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2283  Fimbrial protein  32.9 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4922  fimbrial protein  30.57 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  33.99 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4243  fimbrial protein  29.14 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4193  long polar fimbrial operon protein LpfA  29.14 
 
 		 190 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3918  long polar fimbria protein A  28.66 
 
 		 174 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3962  long polar fimbria protein A  28.66 
 
 		 174 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0591  type-1 fimbrial protein subunit A  30.39 
 
 		 185 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.645033  normal  0.190697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4023  long polar fimbria protein A  28.66 
 
 		 174 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0027  fimbrial subunit  27.08 
 
 		 168 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.0735606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0026  fimbrial subunit  27.08 
 
 		 168 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0429819  normal  0.158284 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0028  fimbrial subunit  27.08 
 
 		 171 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.143965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0027  fimbrial protein  27.08 
 
 		 171 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0443558  normal  0.0275442 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0028  fimbrial subunit  27.08 
 
 		 171 aa  53.9  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0588  type-1 fimbrial protein, A chain  30.16 
 
 		 185 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0138802 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3853  long polar fimbria protein A  29.27 
 
 		 174 aa  53.5  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4253  fimbrial protein  25.71 
 
 		 336 aa  53.1  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000413623  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1523  fimbrial protein  32.68 
 
 		 170 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1546  fimbrial protein  32.68 
 
 		 170 aa  52.8  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114826  normal  0.375148 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  33.1 
 
 		 345 aa  52  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0596  type-1 fimbrial protein subunit A  31.18 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0272864 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0653  type-1 fimbrial protein, A chain  31.22 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  27.41 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  27.41 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  27.41 
 
 		 176 aa  51.6  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4096  long polar fimbrial operon protein LpfA  28.57 
 
 		 190 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.161781 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1055  fimbrial protein  29.37 
 
 		 193 aa  51.2  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0378165 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0028  fimbrial subunit  31.55 
 
 		 172 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.454936  normal  0.0721141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0029  fimbrial subunit  31.55 
 
 		 172 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0756629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0028  fimbrial protein  31.55 
 
 		 172 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.580839  normal  0.0519553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0029  fimbrial subunit  31.55 
 
 		 172 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0027  fimbrial subunit  31.55 
 
 		 172 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.036036  normal  0.161213 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  27.88 
 
 		 354 aa  50.4  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3248  fimbrial protein  30.06 
 
 		 193 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.747356  normal  0.0628332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1072  fimbrial protein  29.8 
 
 		 305 aa  49.7  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.251459 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2230  type-1 fimbrial protein, A subunit  31.62 
 
 		 323 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  30.26 
 
 		 170 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  30.26 
 
 		 170 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  30.26 
 
 		 170 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0765  Fimbrial protein  28.3 
 
 		 209 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.146412  normal  0.0127423 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5821  type-1 fimbrial protein homolog  31.62 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00946  predicted fimbrial-like adhesin protein  27.94 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.118713  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04184  fimbrial protein involved in type 1 pilus biosynthesis  29.81 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2701  Fimbrial protein  27.94 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000889642  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3682  Fimbrial protein  29.81 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.548011  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2087  major fimbrial subunit protein  31.62 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4917  protein LpfE  26.35 
 
 		 176 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1051  fimbrial protein  27.94 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00269088  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4541  type-1 fimbrial protein  29.81 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0222698  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1057  fimbrial protein  27.94 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000439054  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04146  hypothetical protein  29.81 
 
 		 179 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2654  fimbrial protein  27.94 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00417117  hitchhiker  0.00341593 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00953  hypothetical protein  27.94 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116375  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4842  type-1 fimbrial protein  29.81 
 
 		 165 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  27.27 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2375  fimbrial protein  27.94 
 
 		 180 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1105  fimbrial protein  27.94 
 
 		 150 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000686387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2030  type-1 fimbrial protein, A subunit  31.62 
 
 		 323 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4460  putative type 1 fimbrial protein  29.93 
 
 		 194 aa  47.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1273  fimbrial protein  43.06 
 
 		 180 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567833  normal  0.399124 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3929  Fimbrial protein  29.41 
 
 		 222 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.19818 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3816  Fimbrial protein  29.41 
 
 		 222 aa  47  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.351886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1024  type-1 fimbrial protein, A subunit  31.62 
 
 		 204 aa  46.6  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2039  fimbrial protein  28.12 
 
 		 183 aa  47  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330404  normal  0.373612 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3297  fimbrial protein  27.45 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0152009 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3624  fimbrial protein  29.93 
 
 		 194 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3982  protein LpfE  27.98 
 
 		 174 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.567222  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1678  fimbrial family protein  28.28 
 
 		 387 aa  46.2  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4804  type-1 fimbrial protein homolog  29.19 
 
 		 165 aa  46.2  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1789  fimbrial protein  28.28 
 
 		 387 aa  46.2  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00112621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2241  fimbrial protein  35.61 
 
 		 331 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0288255  normal  0.0430038 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5164  fimbrial protein  24.34 
 
 		 200 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.312284 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3262  putative fimbrial protein  27.5 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.792509  normal  0.342422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3199  fimbrial protein  28.74 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3364  fimbrial protein  28.83 
 
 		 193 aa  45.8  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364607  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01462  predicted fimbrial-like adhesin protein  24.85 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.998876  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03009  predicted fimbrial-like adhesin protein  29.93 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0563  Fimbrial protein  30.41 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2142  Fimbrial protein  24.85 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00278828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1588  protein FimF-like protein  24.85 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.860042  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3334  putative type 1 fimbrial protein  29.93 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.370999  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02960  hypothetical protein  29.93 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0556  fimbrial protein  29.93 
 
 		 194 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2153  fimbrial protein  24.85 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.248521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01474  hypothetical protein  24.85 
 
 		 176 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1667  protein FimF-like protein  24.85 
 
 		 176 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.554066 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3185  probable fimbrial protein  27.27 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>