192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2073 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2073  nitroreductase  100 
 
 		 242 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3657  nitrobenzoate reductase, putative  97.32 
 
 		 224 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.583331  normal  0.143139 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6222  nitroreductase  69.33 
 
 		 246 aa  356  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6027  nitroreductase  67.22 
 
 		 254 aa  352  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4912  nitroreductase  66.39 
 
 		 247 aa  349  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5783  nitroreductase  66.8 
 
 		 254 aa  347  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0682  nitroreductase  62.87 
 
 		 249 aa  322  3e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00504715  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5940  nitroreductase  61.43 
 
 		 237 aa  308  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.118292  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0222  putative nitroreductase  61.43 
 
 		 229 aa  299  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1610  nitroreductase  60.63 
 
 		 235 aa  295  6e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.367755  normal  0.918275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7105  nitroreductase  61.36 
 
 		 229 aa  292  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1938  nitroreductase  60.45 
 
 		 235 aa  292  3e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.255877  hitchhiker  0.00446173 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1203  nitroreductase  59.11 
 
 		 231 aa  290  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000186245  normal  0.254827 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1608  oxidoreductase protein  59.29 
 
 		 235 aa  284  8e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000515625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6397  nitroreductase  57.94 
 
 		 242 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3047  nitroreductase  56.41 
 
 		 239 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.496767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2436  nitroreductase  58.11 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3050  nitroreductase  58.11 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.908871  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3069  nitroreductase  58.11 
 
 		 242 aa  265  5e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3085  nitroreductase  54.46 
 
 		 258 aa  249  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000834764  normal  0.027265 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1615  nitroreductase  53.12 
 
 		 257 aa  248  7e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00251246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2142  nitroreductase  52.79 
 
 		 236 aa  247  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000385966  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2908  nitroreductase  51.07 
 
 		 239 aa  232  3e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1481  nitroreductase  51.39 
 
 		 236 aa  227  1e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6301  nitroreductase  51.36 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.540366  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1410  nitroreductase  47.51 
 
 		 231 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0345  nitroreductase  49.56 
 
 		 228 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2263  nitroreductase  52.29 
 
 		 224 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00513133 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0573  nitroreductase family protein  46.08 
 
 		 228 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3982  nitroreductase  47.49 
 
 		 233 aa  209  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47250  Nitroreductase  45.25 
 
 		 224 aa  209  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3352  nitroreductase  45.45 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2012  nitroreductase  45.54 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0408  nitroreductase  44.7 
 
 		 223 aa  192  6e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.341785  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3737  NADH dehydrogenase  44.24 
 
 		 221 aa  187  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0926  nitroreductase  41.94 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6984  nitroreductase  42.08 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.795076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0170  nitroreductase  40.99 
 
 		 221 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.834926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3607  nitroreductase  41.63 
 
 		 223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127181  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8469  nitroreductase  39.64 
 
 		 240 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5984  nitroreductase  39.91 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0282838  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3999  nitroreductase  40.37 
 
 		 223 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5417  nitroreductase  37.78 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5454  nitroreductase  41.74 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111331  normal  0.0192138 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5185  nitroreductase  41.28 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0863183  normal  0.13215 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1917  nitroreductase  37.72 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.805688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2388  nitroreductase  39.45 
 
 		 226 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1213  nitroreductase  39.73 
 
 		 221 aa  148  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718567 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2316  nitroreductase  40.55 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.999623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4924  nitroreductase  39.27 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5013  nitroreductase  39.27 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1543  nitroreductase  40.09 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.973718  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5306  nitroreductase  39.27 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1690  nitroreductase  35.29 
 
 		 230 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4839  nitroreductase  36.74 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0536307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3603  nitroreductase  34.84 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0181645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1973  nitroreductase  35.14 
 
 		 244 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1048  nitroreductase  35.71 
 
 		 219 aa  135  8e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.043093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2312  nitroreductase  36.92 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.501363  normal  0.270967 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0200  nitroreductase  36.36 
 
 		 225 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.878675  normal  0.802011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4604  nitroreductase  36.32 
 
 		 241 aa  131  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.278026  normal  0.441291 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0966  nitroreductase  35.24 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.247672  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1911  nitroreductase  33.48 
 
 		 232 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2168  nitroreductase  35.43 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2199  nitroreductase  31.53 
 
 		 231 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.396094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4473  nitroreductase  36.32 
 
 		 225 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1036  nitroreductase  32.59 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0519  nitroreductase  31.53 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000999564  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2969  nitroreductase  34.43 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.788882  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7115  hypothetical protein  33.03 
 
 		 215 aa  123  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3698  nitroreductase  32.74 
 
 		 231 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5533  nitroreductase  33.49 
 
 		 230 aa  119  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2041  nitroreductase  30.8 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505491  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7293  nitroreductase  31.98 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367017 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6296  nitroreductase  33.98 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.214758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3141  nitroreductase  31.78 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0024  hypothetical protein  33.04 
 
 		 225 aa  112  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.369937  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3631  nitroreductase  32.44 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2325  nitroreductase  31.56 
 
 		 234 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  0.241368 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2473  nitroreductase  29.91 
 
 		 235 aa  105  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0563773  normal  0.616707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01216  putative oxidoreductase  27.11 
 
 		 223 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.711869  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1796  nitroreductase  31.25 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.539857  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3154  nitroreductase  33.04 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.297718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1408  nitroreductase  27.06 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1327  nitroreductase family protein  29.95 
 
 		 270 aa  91.3  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0723  p-nitrobenzoate reductase  28.11 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0055643  normal  0.275976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1205  nitroreductase  29.41 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0563  p-nitrobenzoate reductase  27.14 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000325568  hitchhiker  0.0000528283 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  26.67 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  26.79 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  25.5 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  24.12 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  23.27 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1641  nitroreductase  47.27 
 
 		 272 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  25 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  25.52 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  24.24 
 
 		 167 aa  53.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  23.83 
 
 		 334 aa  52  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0556  nitroreductase  25 
 
 		 345 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1657  nitroreductase  25.79 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0325303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>