More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1311 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 721 aa  1472    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  40.8 
 
 		 719 aa  478  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  39.71 
 
 		 715 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 698 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  38.57 
 
 		 709 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  38.86 
 
 		 709 aa  432  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38.69 
 
 		 747 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  26.87 
 
 		 798 aa  182  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  28.42 
 
 		 748 aa  165  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  28.32 
 
 		 750 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  28.03 
 
 		 750 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  28.65 
 
 		 756 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  31.86 
 
 		 750 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 731 aa  133  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.06 
 
 		 661 aa  126  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  31.32 
 
 		 664 aa  126  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  44.59 
 
 		 669 aa  125  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  40.25 
 
 		 729 aa  124  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  32.99 
 
 		 641 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  29.43 
 
 		 690 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  30.67 
 
 		 720 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 649 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  32.64 
 
 		 657 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 730 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  28.39 
 
 		 724 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  36.75 
 
 		 730 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  24.36 
 
 		 797 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  42.86 
 
 		 804 aa  118  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  31.85 
 
 		 660 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  38.79 
 
 		 663 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  31.6 
 
 		 642 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  31.92 
 
 		 637 aa  116  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  31.08 
 
 		 677 aa  115  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  32.82 
 
 		 663 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  115  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  40.65 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  40.65 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  40.65 
 
 		 645 aa  114  6e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  114  6e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  114  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  114  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  114  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  40.65 
 
 		 645 aa  114  6e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  26.45 
 
 		 730 aa  113  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  40.38 
 
 		 647 aa  114  9e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 		 643 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 650 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 645 aa  113  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  31.51 
 
 		 607 aa  113  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 653 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  31.51 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  31.51 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  31.51 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  40.94 
 
 		 649 aa  112  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  43.42 
 
 		 688 aa  111  4.0000000000000004e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 637 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  42.75 
 
 		 654 aa  111  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  41.06 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  41.89 
 
 		 657 aa  111  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 682 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  39.26 
 
 		 187 aa  111  5e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  41.89 
 
 		 657 aa  111  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  30.5 
 
 		 788 aa  110  6e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  41.06 
 
 		 644 aa  111  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 760 aa  110  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  40.27 
 
 		 649 aa  110  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  28.18 
 
 		 747 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  39.33 
 
 		 642 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  30.56 
 
 		 650 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  39.33 
 
 		 642 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  41.45 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  30.47 
 
 		 681 aa  110  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  39.74 
 
 		 644 aa  110  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  38.71 
 
 		 659 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  29.31 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  30.48 
 
 		 651 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  30.48 
 
 		 651 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  30.48 
 
 		 651 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  41.45 
 
 		 690 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  30.48 
 
 		 651 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.61 
 
 		 645 aa  109  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  30.48 
 
 		 651 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  31.16 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  31.08 
 
 		 655 aa  109  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  30.48 
 
 		 651 aa  109  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  30.82 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  30.48 
 
 		 651 aa  109  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  41.33 
 
 		 678 aa  108  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38.67 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  32.5 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  44.85 
 
 		 644 aa  108  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  39.22 
 
 		 643 aa  107  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  35.4 
 
 		 671 aa  108  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  35.87 
 
 		 643 aa  108  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  42.57 
 
 		 747 aa  108  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>