115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0440 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0440  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 145 aa  296  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0844  thioesterase superfamily protein  48.08 
 
 		 173 aa  149  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.689934 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4894  thioesterase superfamily protein  48.57 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2203  hypothetical protein  47.44 
 
 		 168 aa  147  7e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224192  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2864  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 		 167 aa  146  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.382014 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0878  thioesterase superfamily protein  46.79 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2289  thioesterase superfamily protein  48.34 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1029  phenylacetic acid degradation-related protein  54.69 
 
 		 295 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.800657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5262  thioesterase superfamily protein  47.1 
 
 		 144 aa  142  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2725  putative phenylacetic acid degradation-related protein  54.89 
 
 		 301 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.267873 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1129  phenylacetic acid degradation-related protein  54.92 
 
 		 319 aa  140  6e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.705789  normal  0.314496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5044  thioesterase superfamily protein  52.89 
 
 		 304 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0523  hypothetical protein  50 
 
 		 141 aa  133  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.317062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1552  hypothetical protein  45.58 
 
 		 172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.661135 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2966  thioesterase superfamily protein  46.26 
 
 		 167 aa  130  7.999999999999999e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.697555  normal  0.0270768 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1524  thioesterase superfamily protein  44.53 
 
 		 155 aa  124  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1826  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 		 168 aa  125  3e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00011356  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1053  thioesterase superfamily protein  41.04 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2323  thioesterase superfamily protein  43.41 
 
 		 147 aa  124  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.384497  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1800  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 165 aa  123  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2486  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 165 aa  123  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00173813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1792  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 165 aa  123  6e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00168803  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1449  hypothetical protein  45.31 
 
 		 329 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1836  thioesterase superfamily protein  43.75 
 
 		 165 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.867971  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2721  hypothetical protein  42.97 
 
 		 159 aa  122  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2312  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.35983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2382  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2505  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000534909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1655  hypothetical protein  43.75 
 
 		 335 aa  122  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.104709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1884  thioesterase superfamily protein  42.97 
 
 		 332 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.679311  normal  0.322867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2754  hypothetical protein  42.97 
 
 		 334 aa  120  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0304755  normal  0.110761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1733  thioesterase superfamily protein  42.64 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.240519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1624  thioesterase superfamily protein  42.54 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2493  thioesterase superfamily protein  46.09 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0486038  normal  0.110001 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1377  thioesterase superfamily protein  45 
 
 		 152 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.732085  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3680  hypothetical protein  44.7 
 
 		 148 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4180  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.112175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1688  thioesterase superfamily protein  42.34 
 
 		 160 aa  114  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.233754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3503  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 		 160 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.633344 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0880  thioesterase superfamily protein  42.36 
 
 		 150 aa  113  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3751  thioesterase superfamily protein  40.88 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43880  hypothetical protein  42.42 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0431  hypothetical protein  41.79 
 
 		 163 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0593  hypothetical protein  43.28 
 
 		 163 aa  103  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0904  phenylacetic acid degradation-related protein  38.71 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.765027  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0099  thioesterase superfamily protein  38.84 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.809262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2865  hypothetical protein  37.01 
 
 		 167 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.218944 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2967  phenylacetic acid degradation-related protein  30.5 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.247323  normal  0.0252633 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0843  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.515116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2202  hypothetical protein  31.78 
 
 		 163 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.42347  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0441  thioesterase superfamily protein  31.39 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0877  hypothetical protein  31.01 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.609076 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1553  phenylacetic acid degradation-related protein  30.71 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3681  hypothetical protein  32.37 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.302156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43890  hypothetical protein  33.57 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1623  phenylacetic acid degradation-like protein  30.95 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.866187  normal  0.0463589 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4181  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.101635  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2722  hypothetical protein  34.43 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1732  hypothetical protein  35.25 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.253534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3752  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 158 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2313  hypothetical protein  34.43 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.352653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2383  hypothetical protein  34.43 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2506  hypothetical protein  34.43 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000551148 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1523  hypothetical protein  31.82 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1687  thioesterase superfamily protein  31.43 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.311432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4895  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1115  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.62313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0253  hypothetical protein  30.07 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69270  hypothetical protein  36.36 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0524  hypothetical protein  39.22 
 
 		 162 aa  57  0.00000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.388646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1378  hypothetical protein  28.8 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2494  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0172407  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2487  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.004295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3504  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1799  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5992  hypothetical protein  36.22 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1791  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.133003  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1825  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00014804  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1835  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.651387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1052  hypothetical protein  28.91 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2647  phenylacetic acid degradation-related protein  30.97 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2324  phenylacetic acid degradation-related protein  33.61 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3340  thioesterase superfamily protein  29.81 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0295  hypothetical protein  33.86 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0879  hypothetical protein  26.98 
 
 		 155 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2516  phenylacetic acid degradation-related protein  28.57 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.158842 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2356  phenylacetic acid degradation-related protein  28.69 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.757412  normal  0.692346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0749  hypothetical protein  28.04 
 
 		 139 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.053315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0947  thioesterase superfamily protein  28.71 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.285063 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0191  hypothetical protein  28.46 
 
 		 156 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.631837  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3906  thioesterase superfamily protein  21.99 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0216  hypothetical protein  28.99 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0191  hypothetical protein  30.58 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.338214 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0553  hypothetical protein  28.99 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4000  hypothetical protein  28.99 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.279387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0588  hypothetical protein  31.15 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.565127  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3919  hypothetical protein  30.65 
 
 		 169 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  0.128368 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3469  hypothetical protein  29.51 
 
 		 188 aa  43.5  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.247806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0468  hypothetical protein  28.26 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0075  thioesterase superfamily protein  43.9 
 
 		 150 aa  42  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>