More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1477 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1477  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1124 aa  2274    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.415294  normal  0.236417 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  52.1 
 
 		 1143 aa  1172    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01960  multidrug resistance protein, putative  38.66 
 
 		 1165 aa  815    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  51.34 
 
 		 1146 aa  1140    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  59.52 
 
 		 1134 aa  1370    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  35.05 
 
 		 1092 aa  656    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  61.47 
 
 		 1191 aa  1410    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2050  acriflavin resistance protein  29.5 
 
 		 1069 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.440026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0869  acriflavin resistance protein  29.51 
 
 		 1038 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0434774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4620  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.2 
 
 		 1052 aa  437  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002594  putative multidrug resistance protein  29.56 
 
 		 1034 aa  435  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.018875  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03414  hypothetical protein  28.52 
 
 		 1044 aa  431  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0619  acriflavin resistance protein  29.15 
 
 		 1045 aa  429  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1320  multidrug resistance protein D  27.3 
 
 		 1024 aa  420  1e-116  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  27.45 
 
 		 1050 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0158  putative multidrug resistance protein  28.49 
 
 		 1039 aa  419  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0453777  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0561  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.64 
 
 		 1032 aa  414  1e-114  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.38553  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2510  acriflavin resistance protein  30.14 
 
 		 1033 aa  415  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00600549  normal  0.198744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.79 
 
 		 1011 aa  411  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0879  acriflavin resistance protein  37.28 
 
 		 1290 aa  413  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0540  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.34 
 
 		 1049 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  27.18 
 
 		 1044 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  27.55 
 
 		 1034 aa  407  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  28.12 
 
 		 1020 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  28 
 
 		 1043 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0469  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1038 aa  393  1e-107  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2817  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1053 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  25.97 
 
 		 1071 aa  386  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1038 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  27.56 
 
 		 1044 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2569  integral membrane protein, putative multidrug resistance protein  27.35 
 
 		 1042 aa  380  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0974879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  40.98 
 
 		 1043 aa  381  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3708  acriflavin resistance protein  28.62 
 
 		 1063 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0987  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1267 aa  380  1e-104  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.869665  normal  0.972102 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.77 
 
 		 1065 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  27.07 
 
 		 1028 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2982  acriflavin resistance protein  26.85 
 
 		 1028 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1675  acriflavin resistance protein  26.29 
 
 		 1034 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.640028  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  25.58 
 
 		 1014 aa  372  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  25.79 
 
 		 1496 aa  369  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2480  acriflavin resistance protein  26.05 
 
 		 1028 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0971  NolG efflux transporter  26.09 
 
 		 1036 aa  366  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2392  acriflavin resistance protein  25.96 
 
 		 1028 aa  365  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1613  acriflavin resistance protein  26.23 
 
 		 1041 aa  364  5.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  25.15 
 
 		 1058 aa  363  1e-98  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2518  acriflavin resistance protein  26.22 
 
 		 1041 aa  362  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00118511  normal  0.514323 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3296  acriflavin resistance protein  25.91 
 
 		 1006 aa  362  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0229109  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2664  acriflavin resistance protein  25.83 
 
 		 1039 aa  361  4e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0165  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1032 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1470 aa  358  2.9999999999999997e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  26.12 
 
 		 1059 aa  357  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1033 aa  357  5.999999999999999e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1058 aa  357  6.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1667  acriflavin resistance protein  25.57 
 
 		 1095 aa  357  1e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.954276 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2558  acriflavin resistance protein  26.3 
 
 		 1048 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.181919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  26.36 
 
 		 1034 aa  353  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1020 aa  352  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  26.18 
 
 		 1046 aa  345  2.9999999999999997e-93  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  27.44 
 
 		 1052 aa  345  2.9999999999999997e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  25.09 
 
 		 1036 aa  345  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  26.03 
 
 		 1024 aa  344  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  25.82 
 
 		 1069 aa  345  4e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  25.49 
 
 		 1043 aa  344  5e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  25.25 
 
 		 1070 aa  344  5.999999999999999e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6348  acriflavin resistance protein  26.48 
 
 		 1121 aa  342  2e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.644425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1006  acriflavin resistance plasma membrane protein  25.27 
 
 		 1040 aa  341  4e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.236802  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  25.78 
 
 		 1040 aa  339  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3955  acriflavin resistance protein  25.94 
 
 		 1075 aa  339  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.542775  normal  0.203686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  25.92 
 
 		 1039 aa  339  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0960  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1047 aa  338  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  25.9 
 
 		 1040 aa  338  2.9999999999999997e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  25.41 
 
 		 1050 aa  338  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2317  acriflavin resistance protein  27 
 
 		 1029 aa  338  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.259725 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1082 aa  338  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  25.69 
 
 		 1042 aa  338  5e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  28.09 
 
 		 1041 aa  337  7e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5557  AcrB/AcrD/AcrF family protein  25.45 
 
 		 1032 aa  336  1e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.130118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1637  acriflavin resistance protein  25.82 
 
 		 1173 aa  334  7.000000000000001e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0894  acriflavin resistance protein  26.21 
 
 		 1060 aa  334  7.000000000000001e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  25.7 
 
 		 1026 aa  333  8e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  25.35 
 
 		 1029 aa  333  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3902  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 1044 aa  333  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.263563  normal  0.110043 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1699  acriflavin resistance protein  26.99 
 
 		 1044 aa  331  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.920783  normal  0.0913661 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  25.88 
 
 		 1044 aa  331  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  24.55 
 
 		 1022 aa  331  5.0000000000000004e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6213  acriflavin resistance protein  25.45 
 
 		 1055 aa  330  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  26.4 
 
 		 1055 aa  328  3e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  26.67 
 
 		 1038 aa  328  4.0000000000000003e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1006  acriflavin resistance protein  26.16 
 
 		 1058 aa  327  6e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00411218  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0108  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 		 1033 aa  327  1e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.153145  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0394  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.5 
 
 		 1077 aa  325  2e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  26.3 
 
 		 1046 aa  326  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0304  acriflavin resistance protein  25.61 
 
 		 1028 aa  326  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.99394  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  26.26 
 
 		 1048 aa  325  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0765  acriflavin resistance protein  26.2 
 
 		 1049 aa  325  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.114262 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3717  acriflavin resistance protein  25.2 
 
 		 1055 aa  325  3e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.530646  normal  0.0294121 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1907  acriflavin resistance protein  25.67 
 
 		 1038 aa  325  3e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1045  acriflavin resistance protein  26.06 
 
 		 1046 aa  325  3e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.061236  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3529  acriflavin resistance protein  25.33 
 
 		 1063 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  25.34 
 
 		 1040 aa  324  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>