More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3448 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3448  secretion protein HlyD  100 
 
 		 380 aa  762    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129275 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1772  secretion protein HlyD  72.49 
 
 		 385 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.535648  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3703  HlyD family secretion protein  72.3 
 
 		 387 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2494  secretion protein HlyD family protein  71.82 
 
 		 377 aa  511  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.359817 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2638  secretion protein HlyD family protein  73.48 
 
 		 377 aa  484  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.671719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1950  secretion protein HlyD family protein  60.77 
 
 		 360 aa  404  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  54.03 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  54.33 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3393  secretion protein HlyD family protein  55.76 
 
 		 350 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0452  secretion protein HlyD family protein  53.07 
 
 		 375 aa  352  7e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0737  secretion protein HlyD family protein  52.74 
 
 		 355 aa  344  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.855496 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  51.5 
 
 		 385 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3484  secretion protein HlyD  53.19 
 
 		 354 aa  341  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.956784  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04271  multidrug resistance efflux pump  55.28 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.146703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0859  secretion protein HlyD family protein  50.77 
 
 		 358 aa  315  7e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.103042 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  47.24 
 
 		 467 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3706  secretion protein HlyD family protein  47.13 
 
 		 348 aa  299  6e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  46.01 
 
 		 463 aa  298  1e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4248  secretion protein HlyD family protein  50.61 
 
 		 397 aa  297  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0400018  normal  0.0754484 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0508  secretion protein HlyD family protein  44.72 
 
 		 444 aa  296  5e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000010598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1211  secretion protein HlyD family protein  48.02 
 
 		 386 aa  293  4e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109615 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2675  secretion protein HlyD family protein  47.99 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0117  MFP family transporter  40.66 
 
 		 333 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  40.62 
 
 		 390 aa  235  8e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  40.46 
 
 		 342 aa  216  8e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  36.93 
 
 		 380 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3990  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 383 aa  206  6e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.302523  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  36.29 
 
 		 366 aa  205  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1183  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 		 354 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  38.51 
 
 		 390 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  35.81 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  37.91 
 
 		 413 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  38.57 
 
 		 375 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  36.16 
 
 		 383 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  37.85 
 
 		 414 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  41.47 
 
 		 344 aa  198  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  36.84 
 
 		 366 aa  195  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0143  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.723307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  36.63 
 
 		 344 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  36.02 
 
 		 355 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  39.51 
 
 		 390 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 374 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  34.07 
 
 		 347 aa  193  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4283  secretion protein HlyD family protein  38.98 
 
 		 365 aa  192  7e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.638187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.53 
 
 		 366 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0834  secretion protein HlyD family protein  38.48 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.541495 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0953  secretion protein HlyD family protein  41.43 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  38.31 
 
 		 385 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  35.08 
 
 		 411 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0402  HlyD family secretion protein  36.86 
 
 		 348 aa  189  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.111756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1088  MFP family transporter  35.39 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.802038  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3486  efflux pump membrane protein  37.15 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  35.29 
 
 		 364 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  38.17 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  35.8 
 
 		 351 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3330  efflux pump membrane protein  37.15 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  34.56 
 
 		 351 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  37.39 
 
 		 413 aa  186  4e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2501  secretion protein HlyD family protein  36.58 
 
 		 358 aa  186  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.259226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 352 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.49 
 
 		 351 aa  186  7e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  37.38 
 
 		 368 aa  186  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  35.71 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  36.77 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  35.49 
 
 		 351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  34.35 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0452  secretion protein HlyD family protein  36.68 
 
 		 352 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  37.43 
 
 		 373 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0744  secretion protein HlyD  38.15 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  33.82 
 
 		 422 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1624  HlyD family secretion protein  37.53 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  34.72 
 
 		 391 aa  181  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4487  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 358 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  36.42 
 
 		 374 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  35.79 
 
 		 394 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  36.51 
 
 		 346 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  37.19 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3991  secretion protein HlyD family protein  38.96 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.713524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  34.48 
 
 		 349 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1715  secretion protein HlyD  37.66 
 
 		 383 aa  179  1e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.118181  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  35.91 
 
 		 372 aa  178  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  34.52 
 
 		 351 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  36.1 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  37.3 
 
 		 406 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  35.69 
 
 		 343 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  33.52 
 
 		 366 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  37.57 
 
 		 372 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  35.75 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0207  secretion protein HlyD  37.8 
 
 		 371 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3379  secretion protein HlyD family protein  38.34 
 
 		 360 aa  176  8e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.316914 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  34.83 
 
 		 375 aa  176  8e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  35.75 
 
 		 373 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4584  secretion protein HlyD family protein  38.51 
 
 		 402 aa  175  9e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.83 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  37.81 
 
 		 350 aa  175  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1543  secretion protein HlyD family protein  33.64 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>